Protein–RNA interactions for Protein: P51798

CLCN7, H(+)/Cl(-) exchange transporter 7, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN7P51798 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCN7P51798 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCN7P51798 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCN7P51798 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCN7P51798 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCN7P51798 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCN7P51798 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN7P51798 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLCN7P51798 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCN7P51798 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCN7P51798 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCN7P51798 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCN7P51798 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCN7P51798 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCN7P51798 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCN7P51798 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCN7P51798 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCN7P51798 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLCN7P51798 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLCN7P51798 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLCN7P51798 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLCN7P51798 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CLCN7P51798 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLCN7P51798 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CLCN7P51798 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CLCN7P51798 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLCN7P51798 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLCN7P51798 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLCN7P51798 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLCN7P51798 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLCN7P51798 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLCN7P51798 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCN7P51798 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCN7P51798 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176 ms