Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC4A3P48751 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SLC4A3P48751 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC4A3P48751 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC4A3P48751 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC4A3P48751 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC4A3P48751 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC4A3P48751 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC4A3P48751 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC4A3P48751 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A3P48751 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A3P48751 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A3P48751 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A3P48751 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A3P48751 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A3P48751 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A3P48751 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A3P48751 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A3P48751 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A3P48751 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC4A3P48751 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC4A3P48751 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC4A3P48751 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC4A3P48751 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC4A3P48751 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC4A3P48751 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC4A3P48751 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC4A3P48751 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A3P48751 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A3P48751 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A3P48751 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A3P48751 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A3P48751 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A3P48751 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A3P48751 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A3P48751 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A3P48751 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A3P48751 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A3P48751 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A3P48751 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A3P48751 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A3P48751 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A3P48751 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A3P48751 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A3P48751 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC4A3P48751 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC4A3P48751 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC4A3P48751 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC4A3P48751 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SLC4A3P48751 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC4A3P48751 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC4A3P48751 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC4A3P48751 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC4A3P48751 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SLC4A3P48751 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SLC4A3P48751 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SLC4A3P48751 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC4A3P48751 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC4A3P48751 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC4A3P48751 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC4A3P48751 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC4A3P48751 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A3P48751 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A3P48751 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A3P48751 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A3P48751 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A3P48751 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A3P48751 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A3P48751 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A3P48751 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A3P48751 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A3P48751 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A3P48751 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A3P48751 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A3P48751 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A3P48751 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A3P48751 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A3P48751 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC4A3P48751 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC4A3P48751 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC4A3P48751 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC4A3P48751 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms