Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 CAF4YKR036C 1932 nt4.63□□□□□ -1.67
SEC28P40509 SYP1YCR030C 2613 nt4.63□□□□□ -1.67
SEC28P40509 TUB3YML124C 1338 nt4.63□□□□□ -1.67
SEC28P40509 TAF5YBR198C 2397 nt4.63□□□□□ -1.67
SEC28P40509 TIF4632YGL049C 2745 nt4.63□□□□□ -1.67
SEC28P40509 RAD28YDR030C 1521 nt4.62□□□□□ -1.67
SEC28P40509 RRB1YMR131C 1536 nt4.62□□□□□ -1.67
SEC28P40509 SSA2YLL024C 1920 nt4.62□□□□□ -1.67
SEC28P40509 EUG1YDR518W 1554 nt4.62□□□□□ -1.67
SEC28P40509 IZH3YLR023C 1632 nt4.62□□□□□ -1.67
SEC28P40509 AKL1YBR059C 3327 nt4.62□□□□□ -1.67
SEC28P40509 RIP1YEL024W 648 nt4.62□□□□□ -1.67
SEC28P40509 YGR273CYGR273C 525 nt4.62□□□□□ -1.67
SEC28P40509 VMA22YHR060W 546 nt4.62□□□□□ -1.67
SEC28P40509 YIL047C-AYIL047C-A 369 nt4.62□□□□□ -1.67
SEC28P40509 PPA2YMR267W 933 nt4.62□□□□□ -1.67
SEC28P40509 HMT1YBR034C 1047 nt4.62□□□□□ -1.67
SEC28P40509 MNN1YER001W 2289 nt4.62□□□□□ -1.67
SEC28P40509 SWI3YJL176C 2478 nt4.62□□□□□ -1.67
SEC28P40509 MUP3YHL036W 1641 nt4.61□□□□□ -1.67
SEC28P40509 RTC5YOR118W 1704 nt4.61□□□□□ -1.67
SEC28P40509 GLN4YOR168W 2430 nt4.61□□□□□ -1.67
SEC28P40509 SSB1YDL229W 1842 nt4.61□□□□□ -1.67
SEC28P40509 RCK2YLR248W 1833 nt4.61□□□□□ -1.67
SEC28P40509 SSB2YNL209W 1842 nt4.61□□□□□ -1.67
SEC28P40509 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt4.61□□□□□ -1.67
SEC28P40509 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt4.61□□□□□ -1.67
SEC28P40509 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt4.61□□□□□ -1.67
SEC28P40509 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt4.61□□□□□ -1.67
SEC28P40509 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt4.61□□□□□ -1.67
SEC28P40509 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt4.61□□□□□ -1.67
SEC28P40509 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt4.61□□□□□ -1.67
SEC28P40509 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt4.61□□□□□ -1.67
SEC28P40509 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt4.61□□□□□ -1.67
SEC28P40509 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt4.61□□□□□ -1.67
SEC28P40509 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt4.61□□□□□ -1.67
SEC28P40509 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt4.61□□□□□ -1.67
SEC28P40509 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt4.61□□□□□ -1.67
SEC28P40509 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt4.61□□□□□ -1.67
SEC28P40509 RPS1BYML063W 768 nt4.61□□□□□ -1.67
SEC28P40509 IMP2YMR035W 534 nt4.61□□□□□ -1.67
SEC28P40509 DSE3YOR264W 1293 nt4.61□□□□□ -1.67
SEC28P40509 FEX1YOR390W 1128 nt4.61□□□□□ -1.67
SEC28P40509 FEX2YPL279C 1128 nt4.61□□□□□ -1.67
SEC28P40509 EGT2YNL327W 3126 nt4.61□□□□□ -1.67
SEC28P40509 HOM3YER052C 1584 nt4.61□□□□□ -1.67
SEC28P40509 PGM2YMR105C 1710 nt4.6□□□□□ -1.67
SEC28P40509 CDC48YDL126C 2508 nt4.6□□□□□ -1.67
SEC28P40509 COS7YDL248W 1152 nt4.6□□□□□ -1.67
SEC28P40509 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt4.6□□□□□ -1.67
SEC28P40509 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt4.6□□□□□ -1.67
SEC28P40509 YER190C-BYER190C-B 483 nt4.6□□□□□ -1.67
SEC28P40509 YFL068WYFL068W 483 nt4.6□□□□□ -1.67
SEC28P40509 YGR066CYGR066C 879 nt4.6□□□□□ -1.67
SEC28P40509 YGR296C-BYGR296C-B 483 nt4.6□□□□□ -1.67
SEC28P40509 YHL050W-AYHL050W-A 483 nt4.6□□□□□ -1.67
SEC28P40509 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt4.6□□□□□ -1.67
SEC28P40509 YIL177W-AYIL177W-A 483 nt4.6□□□□□ -1.67
SEC28P40509 YJL225W-AYJL225W-A 483 nt4.6□□□□□ -1.67
SEC28P40509 COS5YJR161C 1152 nt4.6□□□□□ -1.67
SEC28P40509 MRT4YKL009W 711 nt4.6□□□□□ -1.67
SEC28P40509 YLL066W-AYLL066W-A 483 nt4.6□□□□□ -1.67
SEC28P40509 YLL067W-AYLL067W-A 483 nt4.6□□□□□ -1.67
SEC28P40509 YLR466C-AYLR466C-A 483 nt4.6□□□□□ -1.67
SEC28P40509 YLR467C-AYLR467C-A 483 nt4.6□□□□□ -1.67
SEC28P40509 YML133W-BYML133W-B 483 nt4.6□□□□□ -1.67
SEC28P40509 YNL339W-BYNL339W-B 483 nt4.6□□□□□ -1.67
SEC28P40509 AIF1YNR074C 1137 nt4.6□□□□□ -1.67
SEC28P40509 YBL113W-AYBL113W-A 483 nt4.6□□□□□ -1.67
SEC28P40509 YOR396C-AYOR396C-A 483 nt4.6□□□□□ -1.67
SEC28P40509 YPL283W-BYPL283W-B 483 nt4.6□□□□□ -1.67
SEC28P40509 YPR204C-AYPR204C-A 483 nt4.6□□□□□ -1.67
SEC28P40509 CBF5YLR175W 1452 nt4.6□□□□□ -1.67
SEC28P40509 NGL3YML118W 1518 nt4.6□□□□□ -1.67
SEC28P40509 PRP28YDR243C 1767 nt4.6□□□□□ -1.67
SEC28P40509 TAF12YDR145W 1620 nt4.59□□□□□ -1.67
SEC28P40509 GPP1YIL053W 753 nt4.59□□□□□ -1.67
SEC28P40509 ALG11YNL048W 1647 nt4.59□□□□□ -1.67
SEC28P40509 CMR3YPR013C 954 nt4.59□□□□□ -1.67
SEC28P40509 YBR134WYBR134W 402 nt4.59□□□□□ -1.67
SEC28P40509 CDC15YAR019C 2925 nt4.59□□□□□ -1.68
SEC28P40509 CAB1YDR531W 1104 nt4.58□□□□□ -1.68
SEC28P40509 YER147C-AYER147C-A 411 nt4.58□□□□□ -1.68
SEC28P40509 YFR045WYFR045W 930 nt4.58□□□□□ -1.68
SEC28P40509 JAC1YGL018C 555 nt4.58□□□□□ -1.68
SEC28P40509 RMR1YGL250W 726 nt4.58□□□□□ -1.68
SEC28P40509 YHR137C-AYHR137C-A 651 nt4.58□□□□□ -1.68
SEC28P40509 SNL1YIL016W 480 nt4.58□□□□□ -1.68
SEC28P40509 UPS2YLR168C 693 nt4.58□□□□□ -1.68
SEC28P40509 TPS3YMR261C 3165 nt4.58□□□□□ -1.68
SEC28P40509 THI20YOL055C 1656 nt4.57□□□□□ -1.68
SEC28P40509 RIM21YNL294C 1602 nt4.57□□□□□ -1.68
SEC28P40509 GSY1YFR015C 2127 nt4.57□□□□□ -1.68
SEC28P40509 YDL012CYDL012C 324 nt4.57□□□□□ -1.68
SEC28P40509 SNA2YDR525W-A 240 nt4.57□□□□□ -1.68
SEC28P40509 TYW3YGL050W 822 nt4.57□□□□□ -1.68
SEC28P40509 COG5YNL051W 1212 nt4.57□□□□□ -1.68
SEC28P40509 SAT4YCR008W 1812 nt4.57□□□□□ -1.68
SEC28P40509 YER158CYER158C 1722 nt4.57□□□□□ -1.68
SEC28P40509 GPB1YOR371C 2694 nt4.57□□□□□ -1.68
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