Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPN7P35236 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms