Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5A1P25705 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5A1P25705 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5A1P25705 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5A1P25705 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5A1P25705 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5A1P25705 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5A1P25705 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5A1P25705 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5A1P25705 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5A1P25705 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5A1P25705 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATP5A1P25705 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5A1P25705 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATP5A1P25705 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5A1P25705 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5A1P25705 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5A1P25705 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5A1P25705 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5A1P25705 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5A1P25705 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5A1P25705 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5A1P25705 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5A1P25705 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5A1P25705 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5A1P25705 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5A1P25705 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5A1P25705 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5A1P25705 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5A1P25705 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 210.2 ms