Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms