Protein–RNA interactions for Protein: P02381

VAR1, Ribosomal protein VAR1, mitochondrial, yeast

Predictions only

Length 398 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAR1	P02381	MNL1	YHR204W	2391 nt		3.4	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	LDB17	YDL146W	1476 nt		3.4	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	PTR2	YKR093W	1806 nt		3.4	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	LPL1	YOR059C	1353 nt		3.39	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	MAG2	YLR427W	2013 nt		3.39	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	MNN4	YKL201C	3537 nt		3.39	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	RRP45	YDR280W	918 nt		3.39	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	LSO1	YJR005C-A	282 nt		3.39	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	ELF1	YKL160W	438 nt		3.39	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	FBP1	YLR377C	1047 nt		3.39	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	SLM5	YCR024C	1479 nt		3.39	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	MIS1	YBR084W	2928 nt		3.39	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	TYW1	YPL207W	2433 nt		3.39	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	NOC2	YOR206W	2133 nt		3.38	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	FAS2	YPL231W	5664 nt		3.38	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	ARF2	YDL137W	546 nt		3.38	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	tS(AGA)D3	tS(AGA)D3	83 nt		3.38	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	FAF1	YIL019W	1041 nt		3.38	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	YIL028W	YIL028W	399 nt		3.38	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	YIF1	YNL263C	945 nt		3.38	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	UMP1	YBR173C	447 nt		3.38	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	RTC1	YOL138C	4026 nt		3.38	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	NTH1	YDR001C	2256 nt		3.38	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	ARG4	YHR018C	1392 nt		3.38	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	RAD54	YGL163C	2697 nt		3.37	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	SVF1	YDR346C	1446 nt		3.37	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	YRM1	YOR172W	2361 nt		3.37	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	ADK2	YER170W	678 nt		3.37	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	TIF5	YPR041W	1218 nt		3.37	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	FRM2	YCL026C-A	582 nt		3.37	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	NMD3	YHR170W	1557 nt		3.37	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	YCR023C	YCR023C	1836 nt		3.37	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	PRM1	YNL279W	1986 nt		3.36	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	GAD1	YMR250W	1758 nt		3.36	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	YDL012C	YDL012C	324 nt		3.36	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	NUS1	YDL193W	1128 nt		3.36	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	NMA1	YLR328W	1206 nt		3.36	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	SET6	YPL165C	1122 nt		3.36	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	YTH1	YPR107C	627 nt		3.36	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	MRPS9	YBR146W	837 nt		3.36	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	CDC6	YJL194W	1542 nt		3.35	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	DHR2	YKL078W	2208 nt		3.35	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	IMD2	YHR216W	1572 nt		3.35	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	PIC2	YER053C	903 nt		3.35	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	JAC1	YGL018C	555 nt		3.35	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	YGL132W	YGL132W	336 nt		3.35	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	COG1	YGL223C	1254 nt		3.35	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	LSB1	YGR136W	726 nt		3.35	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	tR(ACG)J	tR(ACG)J	73 nt		3.35	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	SPS19	YNL202W	879 nt		3.35	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	YPL025C	YPL025C	558 nt		3.35	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	UBA3	YPR066W	900 nt		3.35	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	RNA14	YMR061W	2034 nt		3.35	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	GCD1	YOR260W	1737 nt		3.35	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	FMP25	YLR077W	1752 nt		3.35	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	ABP140	YOR239W	1887 nt		3.35	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	TAF6	YGL112C	1551 nt		3.34	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	SRV2	YNL138W	1581 nt		3.34	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	OCA4	YCR095C	1089 nt		3.34	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	snR7-L	snR7-L	214 nt		3.34	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	NUP42	YDR192C	1293 nt		3.34	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	FMP10	YER182W	735 nt		3.34	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	YJR112W-A	YJR112W-A	330 nt		3.34	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	PNP1	YLR209C	936 nt		3.34	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	CIN5	YOR028C	888 nt		3.34	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	YOR034C-A	YOR034C-A	243 nt		3.34	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	YPL114W	YPL114W	420 nt		3.34	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	REI1	YBR267W	1182 nt		3.34	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	IOC2	YLR095C	2439 nt		3.34	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	TRF5	YNL299W	1929 nt		3.34	□□□□□ -1.88
VAR1	P02381	VMA1	YDL185W	3216 nt		3.34	□□□□□ -1.88
VAR1	P02381	RPG1	YBR079C	2895 nt		3.33	□□□□□ -1.88
VAR1	P02381	APC1	YNL172W	5247 nt		3.33	□□□□□ -1.88
VAR1	P02381	YER145C-A	YER145C-A	438 nt		3.33	□□□□□ -1.88
VAR1	P02381	PRE9	YGR135W	777 nt		3.33	□□□□□ -1.88
VAR1	P02381	GEP4	YHR100C	558 nt		3.33	□□□□□ -1.88
VAR1	P02381	YNL217W	YNL217W	981 nt		3.33	□□□□□ -1.88
VAR1	P02381	HPR1	YDR138W	2259 nt		3.33	□□□□□ -1.88
VAR1	P02381	YCF1	YDR135C	4548 nt		3.33	□□□□□ -1.88
VAR1	P02381	YIL165C	YIL165C	360 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VAR1	P02381	YAR030C	YAR030C	342 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VAR1	P02381	NKP2	YLR315W	462 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VAR1	P02381	YNL165W	YNL165W	1221 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VAR1	P02381	YPR059C	YPR059C	387 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VAR1	P02381	SUA7	YPR086W	1038 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VAR1	P02381	YTM1	YOR272W	1383 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VAR1	P02381	YMR221C	YMR221C	1515 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VAR1	P02381	ALR2	YFL050C	2577 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VAR1	P02381	BUD5	YCR038C	1929 nt		3.31	□□□□□ -1.88
VAR1	P02381	NOP58	YOR310C	1536 nt		3.31	□□□□□ -1.88
VAR1	P02381	YDR056C	YDR056C	618 nt		3.31	□□□□□ -1.88
VAR1	P02381	BUD13	YGL174W	801 nt		3.31	□□□□□ -1.88
VAR1	P02381	NTR2	YKR022C	969 nt		3.31	□□□□□ -1.88
VAR1	P02381	YKR104W	YKR104W	921 nt		3.31	□□□□□ -1.88
VAR1	P02381	SLD7	YOR060C	774 nt		3.31	□□□□□ -1.88
VAR1	P02381	SPO19	YPL130W	672 nt		3.31	□□□□□ -1.88
VAR1	P02381	NAM2	YLR382C	2685 nt		3.31	□□□□□ -1.88
VAR1	P02381	MLF3	YNL074C	1359 nt		3.3	□□□□□ -1.88
VAR1	P02381	HSP42	YDR171W	1128 nt		3.3	□□□□□ -1.88
VAR1	P02381	ECM34	YHL043W	513 nt		3.3	□□□□□ -1.88

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