Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms