Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB6O95452 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB6O95452 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB6O95452 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB6O95452 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB6O95452 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB6O95452 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB6O95452 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB6O95452 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB6O95452 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB6O95452 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB6O95452 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB6O95452 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB6O95452 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB6O95452 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB6O95452 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB6O95452 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB6O95452 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB6O95452 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB6O95452 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB6O95452 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB6O95452 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GJB6O95452 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GJB6O95452 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GJB6O95452 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB6O95452 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB6O95452 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB6O95452 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB6O95452 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB6O95452 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB6O95452 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB6O95452 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB6O95452 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB6O95452 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB6O95452 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB6O95452 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB6O95452 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB6O95452 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB6O95452 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB6O95452 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB6O95452 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB6O95452 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB6O95452 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB6O95452 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB6O95452 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB6O95452 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB6O95452 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB6O95452 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB6O95452 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB6O95452 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB6O95452 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB6O95452 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB6O95452 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB6O95452 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB6O95452 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB6O95452 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB6O95452 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB6O95452 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB6O95452 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB6O95452 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB6O95452 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB6O95452 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB6O95452 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB6O95452 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB6O95452 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB6O95452 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB6O95452 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB6O95452 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB6O95452 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB6O95452 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB6O95452 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB6O95452 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB6O95452 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB6O95452 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB6O95452 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB6O95452 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB6O95452 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB6O95452 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB6O95452 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB6O95452 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB6O95452 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB6O95452 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB6O95452 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB6O95452 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB6O95452 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB6O95452 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB6O95452 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB6O95452 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB6O95452 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GJB6O95452 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GJB6O95452 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GJB6O95452 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB6O95452 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB6O95452 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB6O95452 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB6O95452 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB6O95452 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB6O95452 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB6O95452 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB6O95452 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms