Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM4AO75164 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
KDM4AO75164 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM4AO75164 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM4AO75164 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM4AO75164 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM4AO75164 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM4AO75164 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM4AO75164 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM4AO75164 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM4AO75164 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM4AO75164 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM4AO75164 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM4AO75164 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms