Protein–RNA interactions for Protein: A8K0Z3

WASHC1, WASH complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC1A8K0Z3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
WASHC1A8K0Z3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
WASHC1A8K0Z3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
WASHC1A8K0Z3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
WASHC1A8K0Z3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
WASHC1A8K0Z3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
WASHC1A8K0Z3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
WASHC1A8K0Z3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
WASHC1A8K0Z3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
WASHC1A8K0Z3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
WASHC1A8K0Z3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
WASHC1A8K0Z3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
WASHC1A8K0Z3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
WASHC1A8K0Z3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
WASHC1A8K0Z3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
WASHC1A8K0Z3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
WASHC1A8K0Z3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
WASHC1A8K0Z3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
WASHC1A8K0Z3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
WASHC1A8K0Z3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
WASHC1A8K0Z3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
WASHC1A8K0Z3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
WASHC1A8K0Z3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
WASHC1A8K0Z3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
WASHC1A8K0Z3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
WASHC1A8K0Z3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
WASHC1A8K0Z3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
WASHC1A8K0Z3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
WASHC1A8K0Z3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
WASHC1A8K0Z3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
WASHC1A8K0Z3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
WASHC1A8K0Z3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
WASHC1A8K0Z3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
WASHC1A8K0Z3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
WASHC1A8K0Z3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
WASHC1A8K0Z3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
WASHC1A8K0Z3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
WASHC1A8K0Z3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
WASHC1A8K0Z3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
WASHC1A8K0Z3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms