Protein–RNA interactions for Protein: Q12527

ATG11, Autophagy-related protein 11, yeastyeast

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Length 1,178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG11Q12527 YSP3YOR003W 1437 nt11.94□□□□□ -0.5
ATG11Q12527 NAT4YMR069W 858 nt11.94□□□□□ -0.5
ATG11Q12527 GAL1YBR020W 1587 nt11.92□□□□□ -0.5
ATG11Q12527 YNL115CYNL115C 1935 nt11.92□□□□□ -0.5
ATG11Q12527 SIM1YIL123W 1431 nt11.9□□□□□ -0.5
ATG11Q12527 YJL225CYJL225C 5277 nt11.89□□□□□ -0.51
ATG11Q12527 TRM5YHR070W 1500 nt11.88□□□□□ -0.51
ATG11Q12527 YLR415CYLR415C 339 nt11.88□□□□□ -0.51
ATG11Q12527 GLK1YCL040W 1503 nt11.86□□□□□ -0.51
ATG11Q12527 STB1YNL309W 1263 nt11.85□□□□□ -0.51
ATG11Q12527 YHL050CYHL050C 2094 nt11.84□□□□□ -0.51
ATG11Q12527 CCT4YDL143W 1587 nt11.84□□□□□ -0.51
ATG11Q12527 SPC25YER018C 666 nt11.83□□□□□ -0.52
ATG11Q12527 MSF1YPR047W 1410 nt11.81□□□□□ -0.52
ATG11Q12527 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.79□□□□□ -0.52
ATG11Q12527 MIR1YJR077C 936 nt11.78□□□□□ -0.52
ATG11Q12527 ATF2YGR177C 1608 nt11.78□□□□□ -0.52
ATG11Q12527 GPI16YHR188C 1833 nt11.77□□□□□ -0.52
ATG11Q12527 THI74YDR438W 1113 nt11.77□□□□□ -0.53
ATG11Q12527 DDR2YOL052C-A 186 nt11.77□□□□□ -0.53
ATG11Q12527 PIB2YGL023C 1908 nt11.75□□□□□ -0.53
ATG11Q12527 VPS60YDR486C 690 nt11.74□□□□□ -0.53
ATG11Q12527 SWC5YBR231C 912 nt11.74□□□□□ -0.53
ATG11Q12527 YFL067WYFL067W 528 nt11.73□□□□□ -0.53
ATG11Q12527 VPS75YNL246W 795 nt11.73□□□□□ -0.53
ATG11Q12527 ERF2YLR246W 1080 nt11.72□□□□□ -0.53
ATG11Q12527 RTF1YGL244W 1677 nt11.71□□□□□ -0.53
ATG11Q12527 NVJ2YPR091C 2313 nt11.71□□□□□ -0.53
ATG11Q12527 ALG3YBL082C 1377 nt11.69□□□□□ -0.54
ATG11Q12527 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.69□□□□□ -0.54
ATG11Q12527 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.68□□□□□ -0.54
ATG11Q12527 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.68□□□□□ -0.54
ATG11Q12527 FEN2YCR028C 1539 nt11.67□□□□□ -0.54
ATG11Q12527 SPT8YLR055C 1809 nt11.66□□□□□ -0.54
ATG11Q12527 CRR1YLR213C 1269 nt11.66□□□□□ -0.54
ATG11Q12527 YMR244WYMR244W 1068 nt11.66□□□□□ -0.54
ATG11Q12527 BOP3YNL042W 1191 nt11.64□□□□□ -0.55
ATG11Q12527 ANP1YEL036C 1503 nt11.64□□□□□ -0.55
ATG11Q12527 DAT1YML113W 747 nt11.63□□□□□ -0.55
ATG11Q12527 PAU7YAR020C 168 nt11.58□□□□□ -0.56
ATG11Q12527 SNG1YGR197C 1644 nt11.57□□□□□ -0.56
ATG11Q12527 GLR1YPL091W 1452 nt11.56□□□□□ -0.56
ATG11Q12527 YGL034CYGL034C 366 nt11.55□□□□□ -0.56
ATG11Q12527 YIR016WYIR016W 798 nt11.55□□□□□ -0.56
ATG11Q12527 HEM12YDR047W 1089 nt11.54□□□□□ -0.56
ATG11Q12527 NCP1YHR042W 2076 nt11.54□□□□□ -0.56
ATG11Q12527 MIC10YCL057C-A 294 nt11.53□□□□□ -0.56
ATG11Q12527 UBA4YHR111W 1323 nt11.53□□□□□ -0.56
ATG11Q12527 PTK1YKL198C 1989 nt11.52□□□□□ -0.57
ATG11Q12527 LYS4YDR234W 2082 nt11.51□□□□□ -0.57
ATG11Q12527 TIM17YJL143W 477 nt11.51□□□□□ -0.57
ATG11Q12527 SHB17YKR043C 816 nt11.48□□□□□ -0.57
ATG11Q12527 YSR3YKR053C 1215 nt11.45□□□□□ -0.58
ATG11Q12527 SHM2YLR058C 1410 nt11.44□□□□□ -0.58
ATG11Q12527 NDI1YML120C 1542 nt11.44□□□□□ -0.58
ATG11Q12527 RBG2YGR173W 1107 nt11.43□□□□□ -0.58
ATG11Q12527 XYL2YLR070C 1071 nt11.41□□□□□ -0.58
ATG11Q12527 YDR010CYDR010C 333 nt11.4□□□□□ -0.58
ATG11Q12527 RBG1YAL036C 1110 nt11.39□□□□□ -0.59
ATG11Q12527 XDJ1YLR090W 1380 nt11.38□□□□□ -0.59
ATG11Q12527 SGT2YOR007C 1041 nt11.36□□□□□ -0.59
ATG11Q12527 NIT1YIL164C 600 nt11.35□□□□□ -0.59
ATG11Q12527 YFL054CYFL054C 1941 nt11.32□□□□□ -0.6
ATG11Q12527 RET2YFR051C 1641 nt11.31□□□□□ -0.6
ATG11Q12527 BNA2YJR078W 1362 nt11.31□□□□□ -0.6
ATG11Q12527 PHO89YBR296C 1725 nt11.3□□□□□ -0.6
ATG11Q12527 GDH3YAL062W 1374 nt11.29□□□□□ -0.6
ATG11Q12527 YCR087WYCR087W 516 nt11.29□□□□□ -0.6
ATG11Q12527 MIC12YBR262C 321 nt11.29□□□□□ -0.6
ATG11Q12527 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.28□□□□□ -0.6
ATG11Q12527 AIM45YPR004C 1035 nt11.27□□□□□ -0.61
ATG11Q12527 YMR226CYMR226C 804 nt11.24□□□□□ -0.61
ATG11Q12527 RAX1YOR301W 1308 nt11.2□□□□□ -0.62
ATG11Q12527 YGR201CYGR201C 678 nt11.2□□□□□ -0.62
ATG11Q12527 HHO1YPL127C 777 nt11.19□□□□□ -0.62
ATG11Q12527 BOR1YNL275W 1731 nt11.18□□□□□ -0.62
ATG11Q12527 MRP20YDR405W 792 nt11.17□□□□□ -0.62
ATG11Q12527 SAM1YLR180W 1149 nt11.15□□□□□ -0.62
ATG11Q12527 COQ2YNR041C 1119 nt11.15□□□□□ -0.62
ATG11Q12527 AVT6YER119C 1347 nt11.13□□□□□ -0.63
ATG11Q12527 SFA1YDL168W 1161 nt11.09□□□□□ -0.63
ATG11Q12527 YLR111WYLR111W 333 nt11.08□□□□□ -0.64
ATG11Q12527 GOR1YNL274C 1053 nt11.06□□□□□ -0.64
ATG11Q12527 YCR102CYCR102C 1107 nt11.05□□□□□ -0.64
ATG11Q12527 RPL4BYDR012W 1089 nt11.02□□□□□ -0.65
ATG11Q12527 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt11.02□□□□□ -0.65
ATG11Q12527 RPL4AYBR031W 1089 nt11.02□□□□□ -0.65
ATG11Q12527 SWE1YJL187C 2460 nt11.01□□□□□ -0.65
ATG11Q12527 DUT1YBR252W 444 nt11□□□□□ -0.65
ATG11Q12527 AGP1YCL025C 1902 nt10.97□□□□□ -0.65
ATG11Q12527 RAD51YER095W 1203 nt10.97□□□□□ -0.65
ATG11Q12527 RPS14BYJL191W 417 nt10.96□□□□□ -0.65
ATG11Q12527 SDH5YOL071W 489 nt10.96□□□□□ -0.65
ATG11Q12527 CLB6YGR109C 1143 nt10.94□□□□□ -0.66
ATG11Q12527 RAD23YEL037C 1197 nt10.93□□□□□ -0.66
ATG11Q12527 SHH4YLR164W 507 nt10.92□□□□□ -0.66
ATG11Q12527 HSP60YLR259C 1719 nt10.92□□□□□ -0.66
ATG11Q12527 CCA1YER168C 1641 nt10.91□□□□□ -0.66
ATG11Q12527 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt10.9□□□□□ -0.66
ATG11Q12527 NBP35YGL091C 987 nt10.89□□□□□ -0.67
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