Protein–RNA interactions for Protein: Q12504

RKM4, Ribosomal lysine N-methyltransferase 4, yeastyeast

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RKM4Q12504 BDH1YAL060W 1149 nt12.26□□□□□ -0.45
RKM4Q12504 YSP3YOR003W 1437 nt12.25□□□□□ -0.45
RKM4Q12504 SBA1YKL117W 651 nt12.24□□□□□ -0.45
RKM4Q12504 SPC25YER018C 666 nt12.22□□□□□ -0.45
RKM4Q12504 GUT2YIL155C 1950 nt12.21□□□□□ -0.45
RKM4Q12504 TRM5YHR070W 1500 nt12.21□□□□□ -0.46
RKM4Q12504 YFL066CYFL066C 1179 nt12.2□□□□□ -0.46
RKM4Q12504 STB1YNL309W 1263 nt12.18□□□□□ -0.46
RKM4Q12504 ATF2YGR177C 1608 nt12.16□□□□□ -0.46
RKM4Q12504 CCT4YDL143W 1587 nt12.15□□□□□ -0.46
RKM4Q12504 ERF2YLR246W 1080 nt12.15□□□□□ -0.46
RKM4Q12504 YNL115CYNL115C 1935 nt12.14□□□□□ -0.47
RKM4Q12504 YLR415CYLR415C 339 nt12.14□□□□□ -0.47
RKM4Q12504 CRR1YLR213C 1269 nt12.13□□□□□ -0.47
RKM4Q12504 NCP1YHR042W 2076 nt12.12□□□□□ -0.47
RKM4Q12504 YFL067WYFL067W 528 nt12.12□□□□□ -0.47
RKM4Q12504 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt12.11□□□□□ -0.47
RKM4Q12504 GPI16YHR188C 1833 nt12.11□□□□□ -0.47
RKM4Q12504 VPS60YDR486C 690 nt12.07□□□□□ -0.48
RKM4Q12504 DDR2YOL052C-A 186 nt12.07□□□□□ -0.48
RKM4Q12504 ANP1YEL036C 1503 nt12.06□□□□□ -0.48
RKM4Q12504 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt12.05□□□□□ -0.48
RKM4Q12504 RTF1YGL244W 1677 nt12.05□□□□□ -0.48
RKM4Q12504 ALG3YBL082C 1377 nt12.05□□□□□ -0.48
RKM4Q12504 NAT4YMR069W 858 nt12.03□□□□□ -0.48
RKM4Q12504 BOP3YNL042W 1191 nt12.03□□□□□ -0.48
RKM4Q12504 PIB2YGL023C 1908 nt12.03□□□□□ -0.48
RKM4Q12504 VPS75YNL246W 795 nt12.02□□□□□ -0.49
RKM4Q12504 LYS4YDR234W 2082 nt12.02□□□□□ -0.49
RKM4Q12504 MIR1YJR077C 936 nt12.01□□□□□ -0.49
RKM4Q12504 SWC5YBR231C 912 nt12.01□□□□□ -0.49
RKM4Q12504 FEN2YCR028C 1539 nt12□□□□□ -0.49
RKM4Q12504 SNG1YGR197C 1644 nt11.99□□□□□ -0.49
RKM4Q12504 SPT8YLR055C 1809 nt11.97□□□□□ -0.49
RKM4Q12504 YJL225CYJL225C 5277 nt11.96□□□□□ -0.49
RKM4Q12504 GLK1YCL040W 1503 nt11.96□□□□□ -0.5
RKM4Q12504 MSF1YPR047W 1410 nt11.95□□□□□ -0.5
RKM4Q12504 HEM12YDR047W 1089 nt11.93□□□□□ -0.5
RKM4Q12504 MIC10YCL057C-A 294 nt11.93□□□□□ -0.5
RKM4Q12504 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.92□□□□□ -0.5
RKM4Q12504 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.92□□□□□ -0.5
RKM4Q12504 THI74YDR438W 1113 nt11.92□□□□□ -0.5
RKM4Q12504 YIR016WYIR016W 798 nt11.89□□□□□ -0.51
RKM4Q12504 PTK1YKL198C 1989 nt11.85□□□□□ -0.51
RKM4Q12504 DAT1YML113W 747 nt11.8□□□□□ -0.52
RKM4Q12504 TIM17YJL143W 477 nt11.79□□□□□ -0.52
RKM4Q12504 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.78□□□□□ -0.52
RKM4Q12504 MIC12YBR262C 321 nt11.77□□□□□ -0.53
RKM4Q12504 SHM2YLR058C 1410 nt11.75□□□□□ -0.53
RKM4Q12504 UBA4YHR111W 1323 nt11.73□□□□□ -0.53
RKM4Q12504 YMR244WYMR244W 1068 nt11.73□□□□□ -0.53
RKM4Q12504 XDJ1YLR090W 1380 nt11.71□□□□□ -0.53
RKM4Q12504 YGL034CYGL034C 366 nt11.7□□□□□ -0.54
RKM4Q12504 NIT1YIL164C 600 nt11.7□□□□□ -0.54
RKM4Q12504 SHB17YKR043C 816 nt11.7□□□□□ -0.54
RKM4Q12504 PAU7YAR020C 168 nt11.7□□□□□ -0.54
RKM4Q12504 YFL054CYFL054C 1941 nt11.69□□□□□ -0.54
RKM4Q12504 YDR010CYDR010C 333 nt11.68□□□□□ -0.54
RKM4Q12504 SGT2YOR007C 1041 nt11.65□□□□□ -0.54
RKM4Q12504 BNA2YJR078W 1362 nt11.64□□□□□ -0.55
RKM4Q12504 RAX1YOR301W 1308 nt11.62□□□□□ -0.55
RKM4Q12504 YGR201CYGR201C 678 nt11.62□□□□□ -0.55
RKM4Q12504 GLR1YPL091W 1452 nt11.62□□□□□ -0.55
RKM4Q12504 UME6YDR207C 2511 nt11.61□□□□□ -0.55
RKM4Q12504 YSR3YKR053C 1215 nt11.61□□□□□ -0.55
RKM4Q12504 RET2YFR051C 1641 nt11.59□□□□□ -0.55
RKM4Q12504 GDH3YAL062W 1374 nt11.58□□□□□ -0.56
RKM4Q12504 XYL2YLR070C 1071 nt11.54□□□□□ -0.56
RKM4Q12504 YCR087WYCR087W 516 nt11.53□□□□□ -0.56
RKM4Q12504 NDI1YML120C 1542 nt11.51□□□□□ -0.57
RKM4Q12504 HHO1YPL127C 777 nt11.51□□□□□ -0.57
RKM4Q12504 RBG2YGR173W 1107 nt11.5□□□□□ -0.57
RKM4Q12504 AIM45YPR004C 1035 nt11.49□□□□□ -0.57
RKM4Q12504 PHO89YBR296C 1725 nt11.49□□□□□ -0.57
RKM4Q12504 RBG1YAL036C 1110 nt11.48□□□□□ -0.57
RKM4Q12504 NME1NME1 340 nt11.47□□□□□ -0.57
RKM4Q12504 AVT6YER119C 1347 nt11.43□□□□□ -0.58
RKM4Q12504 AGP1YCL025C 1902 nt11.43□□□□□ -0.58
RKM4Q12504 SWE1YJL187C 2460 nt11.42□□□□□ -0.58
RKM4Q12504 SFA1YDL168W 1161 nt11.39□□□□□ -0.59
RKM4Q12504 COQ2YNR041C 1119 nt11.39□□□□□ -0.59
RKM4Q12504 CCA1YER168C 1641 nt11.38□□□□□ -0.59
RKM4Q12504 YCR102CYCR102C 1107 nt11.37□□□□□ -0.59
RKM4Q12504 YMR226CYMR226C 804 nt11.36□□□□□ -0.59
RKM4Q12504 GOR1YNL274C 1053 nt11.35□□□□□ -0.59
RKM4Q12504 DUT1YBR252W 444 nt11.35□□□□□ -0.59
RKM4Q12504 MRP20YDR405W 792 nt11.33□□□□□ -0.6
RKM4Q12504 NBP35YGL091C 987 nt11.26□□□□□ -0.61
RKM4Q12504 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt11.26□□□□□ -0.61
RKM4Q12504 RPL4BYDR012W 1089 nt11.25□□□□□ -0.61
RKM4Q12504 RPL4AYBR031W 1089 nt11.25□□□□□ -0.61
RKM4Q12504 TIR3YIL011W 810 nt11.24□□□□□ -0.61
RKM4Q12504 SHH4YLR164W 507 nt11.24□□□□□ -0.61
RKM4Q12504 RPS14BYJL191W 417 nt11.22□□□□□ -0.61
RKM4Q12504 SAM1YLR180W 1149 nt11.21□□□□□ -0.61
RKM4Q12504 RPM1RPM1 483 nt11.18□□□□□ -0.62
RKM4Q12504 CLB6YGR109C 1143 nt11.15□□□□□ -0.62
RKM4Q12504 POM34YLR018C 900 nt11.15□□□□□ -0.62
RKM4Q12504 YLR111WYLR111W 333 nt11.15□□□□□ -0.62
RKM4Q12504 DUS1YML080W 1272 nt11.15□□□□□ -0.62
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