Protein–RNA interactions for Protein: Q12483

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, yeastyeast

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF8Q12483 YKL030WYKL030W 606 nt10.45□□□□□ -0.74
SNF8Q12483 YLR179CYLR179C 606 nt10.45□□□□□ -0.74
SNF8Q12483 ANP1YEL036C 1503 nt10.44□□□□□ -0.74
SNF8Q12483 RTG1YOL067C 534 nt10.43□□□□□ -0.74
SNF8Q12483 SPC25YER018C 666 nt10.42□□□□□ -0.74
SNF8Q12483 WSC2YNL283C 1512 nt10.42□□□□□ -0.74
SNF8Q12483 STB1YNL309W 1263 nt10.41□□□□□ -0.74
SNF8Q12483 RAX1YOR301W 1308 nt10.4□□□□□ -0.74
SNF8Q12483 AHT1YHR093W 549 nt10.4□□□□□ -0.74
SNF8Q12483 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.39□□□□□ -0.75
SNF8Q12483 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.36□□□□□ -0.75
SNF8Q12483 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.36□□□□□ -0.75
SNF8Q12483 FEN2YCR028C 1539 nt10.34□□□□□ -0.75
SNF8Q12483 GPI16YHR188C 1833 nt10.34□□□□□ -0.75
SNF8Q12483 CCA1YER168C 1641 nt10.33□□□□□ -0.76
SNF8Q12483 YPR064WYPR064W 420 nt10.32□□□□□ -0.76
SNF8Q12483 CCT4YDL143W 1587 nt10.31□□□□□ -0.76
SNF8Q12483 VPS60YDR486C 690 nt10.31□□□□□ -0.76
SNF8Q12483 MIC12YBR262C 321 nt10.31□□□□□ -0.76
SNF8Q12483 ALG3YBL082C 1377 nt10.27□□□□□ -0.76
SNF8Q12483 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.27□□□□□ -0.77
SNF8Q12483 YEL076CYEL076C 651 nt10.27□□□□□ -0.77
SNF8Q12483 TAD3YLR316C 969 nt10.27□□□□□ -0.77
SNF8Q12483 YLR464WYLR464W 651 nt10.27□□□□□ -0.77
SNF8Q12483 BNA2YJR078W 1362 nt10.26□□□□□ -0.77
SNF8Q12483 YIR016WYIR016W 798 nt10.26□□□□□ -0.77
SNF8Q12483 BOR1YNL275W 1731 nt10.22□□□□□ -0.77
SNF8Q12483 MRPL8YJL063C 717 nt10.22□□□□□ -0.77
SNF8Q12483 SWC5YBR231C 912 nt10.22□□□□□ -0.77
SNF8Q12483 AGP1YCL025C 1902 nt10.21□□□□□ -0.77
SNF8Q12483 HSP60YLR259C 1719 nt10.21□□□□□ -0.78
SNF8Q12483 FUR4YBR021W 1902 nt10.2□□□□□ -0.78
SNF8Q12483 HUA1YGR268C 597 nt10.18□□□□□ -0.78
SNF8Q12483 BDH1YAL060W 1149 nt10.18□□□□□ -0.78
SNF8Q12483 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.17□□□□□ -0.78
SNF8Q12483 HHO1YPL127C 777 nt10.15□□□□□ -0.78
SNF8Q12483 GLK1YCL040W 1503 nt10.15□□□□□ -0.78
SNF8Q12483 YGR201CYGR201C 678 nt10.13□□□□□ -0.79
SNF8Q12483 ADO1YJR105W 1023 nt10.13□□□□□ -0.79
SNF8Q12483 XDJ1YLR090W 1380 nt10.11□□□□□ -0.79
SNF8Q12483 YLR415CYLR415C 339 nt10.09□□□□□ -0.79
SNF8Q12483 YSP3YOR003W 1437 nt10.07□□□□□ -0.8
SNF8Q12483 DUT1YBR252W 444 nt10.04□□□□□ -0.8
SNF8Q12483 YCL074WYCL074W 927 nt10.03□□□□□ -0.8
SNF8Q12483 DUS1YML080W 1272 nt10.02□□□□□ -0.81
SNF8Q12483 GDH3YAL062W 1374 nt10.01□□□□□ -0.81
SNF8Q12483 PRP4YPR178W 1398 nt10□□□□□ -0.81
SNF8Q12483 SHM2YLR058C 1410 nt9.99□□□□□ -0.81
SNF8Q12483 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.98□□□□□ -0.81
SNF8Q12483 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.98□□□□□ -0.81
SNF8Q12483 AVT6YER119C 1347 nt9.97□□□□□ -0.81
SNF8Q12483 YKR005CYKR005C 1578 nt9.97□□□□□ -0.81
SNF8Q12483 STR3YGL184C 1398 nt9.96□□□□□ -0.82
SNF8Q12483 YNL115CYNL115C 1935 nt9.95□□□□□ -0.82
SNF8Q12483 TIM17YJL143W 477 nt9.95□□□□□ -0.82
SNF8Q12483 PEX25YPL112C 1185 nt9.95□□□□□ -0.82
SNF8Q12483 DPS1YLL018C 1674 nt9.95□□□□□ -0.82
SNF8Q12483 NIT1YIL164C 600 nt9.93□□□□□ -0.82
SNF8Q12483 GOR1YNL274C 1053 nt9.93□□□□□ -0.82
SNF8Q12483 ALG12YNR030W 1656 nt9.9□□□□□ -0.82
SNF8Q12483 YFL066CYFL066C 1179 nt9.9□□□□□ -0.82
SNF8Q12483 YFR018CYFR018C 1092 nt9.9□□□□□ -0.82
SNF8Q12483 DAT1YML113W 747 nt9.89□□□□□ -0.83
SNF8Q12483 YGR259CYGR259C 441 nt9.88□□□□□ -0.83
SNF8Q12483 AAC1YMR056C 930 nt9.88□□□□□ -0.83
SNF8Q12483 UME6YDR207C 2511 nt9.86□□□□□ -0.83
SNF8Q12483 BMT6YLR063W 1098 nt9.85□□□□□ -0.83
SNF8Q12483 VPS75YNL246W 795 nt9.85□□□□□ -0.83
SNF8Q12483 SGT2YOR007C 1041 nt9.85□□□□□ -0.83
SNF8Q12483 AQY2YLL052C 450 nt9.84□□□□□ -0.83
SNF8Q12483 SNF1YDR477W 1902 nt9.84□□□□□ -0.83
SNF8Q12483 RPM1RPM1 483 nt9.83□□□□□ -0.84
SNF8Q12483 PRE6YOL038W 765 nt9.83□□□□□ -0.84
SNF8Q12483 YDR094WYDR094W 336 nt9.8□□□□□ -0.84
SNF8Q12483 RTN2YDL204W 1182 nt9.78□□□□□ -0.84
SNF8Q12483 NBP35YGL091C 987 nt9.78□□□□□ -0.84
SNF8Q12483 IRC24YIR036C 792 nt9.78□□□□□ -0.84
SNF8Q12483 YCR102CYCR102C 1107 nt9.77□□□□□ -0.85
SNF8Q12483 BIO5YNR056C 1686 nt9.76□□□□□ -0.85
SNF8Q12483 ARP6YLR085C 1317 nt9.7□□□□□ -0.86
SNF8Q12483 RRT5YFR032C 870 nt9.68□□□□□ -0.86
SNF8Q12483 MCH5YOR306C 1566 nt9.67□□□□□ -0.86
SNF8Q12483 UBX6YJL048C 1191 nt9.66□□□□□ -0.86
SNF8Q12483 PLB1YMR008C 1995 nt9.66□□□□□ -0.86
SNF8Q12483 YDR010CYDR010C 333 nt9.65□□□□□ -0.86
SNF8Q12483 PAU16YKL224C 372 nt9.65□□□□□ -0.86
SNF8Q12483 MIR1YJR077C 936 nt9.64□□□□□ -0.87
SNF8Q12483 PBP1YGR178C 2169 nt9.64□□□□□ -0.87
SNF8Q12483 TIR3YIL011W 810 nt9.63□□□□□ -0.87
SNF8Q12483 PAU7YAR020C 168 nt9.63□□□□□ -0.87
SNF8Q12483 SHH4YLR164W 507 nt9.62□□□□□ -0.87
SNF8Q12483 NAR1YNL240C 1476 nt9.61□□□□□ -0.87
SNF8Q12483 SHB17YKR043C 816 nt9.61□□□□□ -0.87
SNF8Q12483 LSC2YGR244C 1284 nt9.59□□□□□ -0.87
SNF8Q12483 SFA1YDL168W 1161 nt9.56□□□□□ -0.88
SNF8Q12483 CYT2YKL087C 675 nt9.55□□□□□ -0.88
SNF8Q12483 POM34YLR018C 900 nt9.55□□□□□ -0.88
SNF8Q12483 RET2YFR051C 1641 nt9.55□□□□□ -0.88
SNF8Q12483 PRO1YDR300C 1287 nt9.54□□□□□ -0.88
SNF8Q12483 UBA4YHR111W 1323 nt9.54□□□□□ -0.88
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