Protein–RNA interactions for Protein: Q12342

LDB17, Protein LDB17, yeastyeast

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB17Q12342 TRM5YHR070W 1500 nt11.16□□□□□ -0.62
LDB17Q12342 YFL067WYFL067W 528 nt11.16□□□□□ -0.62
LDB17Q12342 WSC2YNL283C 1512 nt11.14□□□□□ -0.63
LDB17Q12342 SPT8YLR055C 1809 nt11.14□□□□□ -0.63
LDB17Q12342 AHT1YHR093W 549 nt11.13□□□□□ -0.63
LDB17Q12342 HUA1YGR268C 597 nt11.12□□□□□ -0.63
LDB17Q12342 DDR2YOL052C-A 186 nt11.09□□□□□ -0.63
LDB17Q12342 HEM12YDR047W 1089 nt11.08□□□□□ -0.64
LDB17Q12342 SPC25YER018C 666 nt11.08□□□□□ -0.64
LDB17Q12342 YPR064WYPR064W 420 nt11.08□□□□□ -0.64
LDB17Q12342 SNG1YGR197C 1644 nt11.08□□□□□ -0.64
LDB17Q12342 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.07□□□□□ -0.64
LDB17Q12342 STB1YNL309W 1263 nt11.07□□□□□ -0.64
LDB17Q12342 MIC10YCL057C-A 294 nt11.07□□□□□ -0.64
LDB17Q12342 ANP1YEL036C 1503 nt11.04□□□□□ -0.64
LDB17Q12342 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.03□□□□□ -0.64
LDB17Q12342 TAD3YLR316C 969 nt11.03□□□□□ -0.64
LDB17Q12342 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.02□□□□□ -0.65
LDB17Q12342 GPI16YHR188C 1833 nt11□□□□□ -0.65
LDB17Q12342 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.99□□□□□ -0.65
LDB17Q12342 CCT4YDL143W 1587 nt10.99□□□□□ -0.65
LDB17Q12342 FEN2YCR028C 1539 nt10.97□□□□□ -0.65
LDB17Q12342 SWE1YJL187C 2460 nt10.96□□□□□ -0.66
LDB17Q12342 VPS60YDR486C 690 nt10.95□□□□□ -0.66
LDB17Q12342 RAX1YOR301W 1308 nt10.92□□□□□ -0.66
LDB17Q12342 BOR1YNL275W 1731 nt10.92□□□□□ -0.66
LDB17Q12342 ALG3YBL082C 1377 nt10.91□□□□□ -0.66
LDB17Q12342 BDH1YAL060W 1149 nt10.91□□□□□ -0.66
LDB17Q12342 YIR016WYIR016W 798 nt10.88□□□□□ -0.67
LDB17Q12342 MIC12YBR262C 321 nt10.88□□□□□ -0.67
LDB17Q12342 SWC5YBR231C 912 nt10.87□□□□□ -0.67
LDB17Q12342 YSP3YOR003W 1437 nt10.83□□□□□ -0.68
LDB17Q12342 BNA2YJR078W 1362 nt10.82□□□□□ -0.68
LDB17Q12342 YLR415CYLR415C 339 nt10.82□□□□□ -0.68
LDB17Q12342 UME6YDR207C 2511 nt10.82□□□□□ -0.68
LDB17Q12342 YDR094WYDR094W 336 nt10.8□□□□□ -0.68
LDB17Q12342 YFR018CYFR018C 1092 nt10.78□□□□□ -0.68
LDB17Q12342 CCA1YER168C 1641 nt10.76□□□□□ -0.69
LDB17Q12342 PEX25YPL112C 1185 nt10.74□□□□□ -0.69
LDB17Q12342 HSP60YLR259C 1719 nt10.73□□□□□ -0.69
LDB17Q12342 UBX6YJL048C 1191 nt10.73□□□□□ -0.69
LDB17Q12342 YNL115CYNL115C 1935 nt10.7□□□□□ -0.7
LDB17Q12342 YGR201CYGR201C 678 nt10.7□□□□□ -0.7
LDB17Q12342 HHO1YPL127C 777 nt10.7□□□□□ -0.7
LDB17Q12342 YFL066CYFL066C 1179 nt10.68□□□□□ -0.7
LDB17Q12342 AGP1YCL025C 1902 nt10.68□□□□□ -0.7
LDB17Q12342 XDJ1YLR090W 1380 nt10.67□□□□□ -0.7
LDB17Q12342 PRE6YOL038W 765 nt10.66□□□□□ -0.7
LDB17Q12342 FUR4YBR021W 1902 nt10.64□□□□□ -0.71
LDB17Q12342 SHM2YLR058C 1410 nt10.63□□□□□ -0.71
LDB17Q12342 GLK1YCL040W 1503 nt10.63□□□□□ -0.71
LDB17Q12342 TIM17YJL143W 477 nt10.62□□□□□ -0.71
LDB17Q12342 VPS75YNL246W 795 nt10.61□□□□□ -0.71
LDB17Q12342 GDH3YAL062W 1374 nt10.61□□□□□ -0.71
LDB17Q12342 RRT5YFR032C 870 nt10.58□□□□□ -0.72
LDB17Q12342 NIT1YIL164C 600 nt10.56□□□□□ -0.72
LDB17Q12342 PAU16YKL224C 372 nt10.56□□□□□ -0.72
LDB17Q12342 ALG12YNR030W 1656 nt10.54□□□□□ -0.72
LDB17Q12342 DUT1YBR252W 444 nt10.54□□□□□ -0.72
LDB17Q12342 AVT6YER119C 1347 nt10.53□□□□□ -0.72
LDB17Q12342 MCH5YOR306C 1566 nt10.52□□□□□ -0.73
LDB17Q12342 DAT1YML113W 747 nt10.5□□□□□ -0.73
LDB17Q12342 GOR1YNL274C 1053 nt10.5□□□□□ -0.73
LDB17Q12342 SGT2YOR007C 1041 nt10.49□□□□□ -0.73
LDB17Q12342 YCL074WYCL074W 927 nt10.47□□□□□ -0.73
LDB17Q12342 DUS1YML080W 1272 nt10.46□□□□□ -0.73
LDB17Q12342 PRP4YPR178W 1398 nt10.45□□□□□ -0.74
LDB17Q12342 STR3YGL184C 1398 nt10.44□□□□□ -0.74
LDB17Q12342 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.44□□□□□ -0.74
LDB17Q12342 MIR1YJR077C 936 nt10.43□□□□□ -0.74
LDB17Q12342 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.42□□□□□ -0.74
LDB17Q12342 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.42□□□□□ -0.74
LDB17Q12342 DPS1YLL018C 1674 nt10.4□□□□□ -0.74
LDB17Q12342 YCR102CYCR102C 1107 nt10.39□□□□□ -0.75
LDB17Q12342 YKR005CYKR005C 1578 nt10.37□□□□□ -0.75
LDB17Q12342 PAU7YAR020C 168 nt10.37□□□□□ -0.75
LDB17Q12342 AAC1YMR056C 930 nt10.37□□□□□ -0.75
LDB17Q12342 YDR010CYDR010C 333 nt10.35□□□□□ -0.75
LDB17Q12342 NBP35YGL091C 987 nt10.35□□□□□ -0.75
LDB17Q12342 THI74YDR438W 1113 nt10.33□□□□□ -0.76
LDB17Q12342 SHB17YKR043C 816 nt10.33□□□□□ -0.76
LDB17Q12342 AQY2YLL052C 450 nt10.31□□□□□ -0.76
LDB17Q12342 BMT6YLR063W 1098 nt10.31□□□□□ -0.76
LDB17Q12342 NAT4YMR069W 858 nt10.31□□□□□ -0.76
LDB17Q12342 UBA4YHR111W 1323 nt10.29□□□□□ -0.76
LDB17Q12342 MSF1YPR047W 1410 nt10.28□□□□□ -0.76
LDB17Q12342 SNF1YDR477W 1902 nt10.27□□□□□ -0.76
LDB17Q12342 YGR259CYGR259C 441 nt10.27□□□□□ -0.77
LDB17Q12342 RET2YFR051C 1641 nt10.25□□□□□ -0.77
LDB17Q12342 RPM1RPM1 483 nt10.25□□□□□ -0.77
LDB17Q12342 RTN2YDL204W 1182 nt10.24□□□□□ -0.77
LDB17Q12342 BIO5YNR056C 1686 nt10.23□□□□□ -0.77
LDB17Q12342 TIR3YIL011W 810 nt10.23□□□□□ -0.77
LDB17Q12342 ARP6YLR085C 1317 nt10.22□□□□□ -0.77
LDB17Q12342 NAR1YNL240C 1476 nt10.22□□□□□ -0.77
LDB17Q12342 SFA1YDL168W 1161 nt10.2□□□□□ -0.78
LDB17Q12342 IRC24YIR036C 792 nt10.2□□□□□ -0.78
LDB17Q12342 SHH4YLR164W 507 nt10.2□□□□□ -0.78
LDB17Q12342 YSR3YKR053C 1215 nt10.19□□□□□ -0.78
LDB17Q12342 LSC2YGR244C 1284 nt10.18□□□□□ -0.78
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