Protein–RNA interactions for Protein: Q12234

RUD3, GRIP domain-containing protein RUD3, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RUD3Q12234 AAC1YMR056C 930 nt11.43□□□□□ -0.58
RUD3Q12234 DPS1YLL018C 1674 nt11.4□□□□□ -0.58
RUD3Q12234 FTR1YER145C 1215 nt11.39□□□□□ -0.59
RUD3Q12234 FRD1YEL047C 1413 nt11.37□□□□□ -0.59
RUD3Q12234 ERV46YAL042W 1248 nt11.36□□□□□ -0.59
RUD3Q12234 LPX1YOR084W 1164 nt11.35□□□□□ -0.59
RUD3Q12234 GAL1YBR020W 1587 nt11.34□□□□□ -0.59
RUD3Q12234 YKR040CYKR040C 504 nt11.34□□□□□ -0.59
RUD3Q12234 BMT6YLR063W 1098 nt11.34□□□□□ -0.59
RUD3Q12234 DDR2YOL052C-A 186 nt11.34□□□□□ -0.59
RUD3Q12234 TRM5YHR070W 1500 nt11.34□□□□□ -0.59
RUD3Q12234 NAR1YNL240C 1476 nt11.31□□□□□ -0.6
RUD3Q12234 YKR005CYKR005C 1578 nt11.3□□□□□ -0.6
RUD3Q12234 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.3□□□□□ -0.6
RUD3Q12234 WSC2YNL283C 1512 nt11.29□□□□□ -0.6
RUD3Q12234 DIC1YLR348C 897 nt11.28□□□□□ -0.6
RUD3Q12234 BNA2YJR078W 1362 nt11.28□□□□□ -0.6
RUD3Q12234 ANP1YEL036C 1503 nt11.27□□□□□ -0.61
RUD3Q12234 MIC12YBR262C 321 nt11.24□□□□□ -0.61
RUD3Q12234 AQY1YPR192W 918 nt11.23□□□□□ -0.61
RUD3Q12234 BIO5YNR056C 1686 nt11.23□□□□□ -0.61
RUD3Q12234 SNF1YDR477W 1902 nt11.22□□□□□ -0.61
RUD3Q12234 YCL074WYCL074W 927 nt11.21□□□□□ -0.61
RUD3Q12234 AGP1YCL025C 1902 nt11.2□□□□□ -0.62
RUD3Q12234 MOT3YMR070W 1473 nt11.19□□□□□ -0.62
RUD3Q12234 YGR259CYGR259C 441 nt11.17□□□□□ -0.62
RUD3Q12234 DUS1YML080W 1272 nt11.17□□□□□ -0.62
RUD3Q12234 PBP1YGR178C 2169 nt11.16□□□□□ -0.62
RUD3Q12234 IRC24YIR036C 792 nt11.16□□□□□ -0.62
RUD3Q12234 SPC25YER018C 666 nt11.14□□□□□ -0.63
RUD3Q12234 STB1YNL309W 1263 nt11.14□□□□□ -0.63
RUD3Q12234 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.13□□□□□ -0.63
RUD3Q12234 CYT2YKL087C 675 nt11.13□□□□□ -0.63
RUD3Q12234 FEN2YCR028C 1539 nt11.12□□□□□ -0.63
RUD3Q12234 HHO1YPL127C 777 nt11.11□□□□□ -0.63
RUD3Q12234 GPI16YHR188C 1833 nt11.09□□□□□ -0.63
RUD3Q12234 SPP1YPL138C 1062 nt11.06□□□□□ -0.64
RUD3Q12234 YGR201CYGR201C 678 nt11.04□□□□□ -0.64
RUD3Q12234 YIR016WYIR016W 798 nt11.04□□□□□ -0.64
RUD3Q12234 TIM23YNR017W 669 nt11.02□□□□□ -0.65
RUD3Q12234 XDJ1YLR090W 1380 nt11.01□□□□□ -0.65
RUD3Q12234 VPS60YDR486C 690 nt11□□□□□ -0.65
RUD3Q12234 YLR179CYLR179C 606 nt11□□□□□ -0.65
RUD3Q12234 YLR235CYLR235C 399 nt10.99□□□□□ -0.65
RUD3Q12234 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.99□□□□□ -0.65
RUD3Q12234 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.99□□□□□ -0.65
RUD3Q12234 PTH1YHR189W 573 nt10.97□□□□□ -0.65
RUD3Q12234 STR3YGL184C 1398 nt10.97□□□□□ -0.65
RUD3Q12234 CCT4YDL143W 1587 nt10.97□□□□□ -0.65
RUD3Q12234 AHT1YHR093W 549 nt10.93□□□□□ -0.66
RUD3Q12234 ALG3YBL082C 1377 nt10.92□□□□□ -0.66
RUD3Q12234 CMP2YML057W 1815 nt10.91□□□□□ -0.66
RUD3Q12234 SWC5YBR231C 912 nt10.9□□□□□ -0.66
RUD3Q12234 DUT1YBR252W 444 nt10.88□□□□□ -0.67
RUD3Q12234 RTN2YDL204W 1182 nt10.86□□□□□ -0.67
RUD3Q12234 AQY2YLL052C 450 nt10.84□□□□□ -0.67
RUD3Q12234 GOR1YNL274C 1053 nt10.84□□□□□ -0.67
RUD3Q12234 YKL030WYKL030W 606 nt10.83□□□□□ -0.68
RUD3Q12234 AVT6YER119C 1347 nt10.82□□□□□ -0.68
RUD3Q12234 YPR064WYPR064W 420 nt10.81□□□□□ -0.68
RUD3Q12234 YAT1YAR035W 2064 nt10.81□□□□□ -0.68
RUD3Q12234 HSL7YBR133C 2484 nt10.8□□□□□ -0.68
RUD3Q12234 RTG1YOL067C 534 nt10.8□□□□□ -0.68
RUD3Q12234 NDI1YML120C 1542 nt10.79□□□□□ -0.68
RUD3Q12234 GDH3YAL062W 1374 nt10.77□□□□□ -0.68
RUD3Q12234 MRPL8YJL063C 717 nt10.74□□□□□ -0.69
RUD3Q12234 TAD3YLR316C 969 nt10.72□□□□□ -0.69
RUD3Q12234 ADO1YJR105W 1023 nt10.69□□□□□ -0.7
RUD3Q12234 HUA1YGR268C 597 nt10.68□□□□□ -0.7
RUD3Q12234 SPT20YOL148C 1815 nt10.65□□□□□ -0.7
RUD3Q12234 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.64□□□□□ -0.71
RUD3Q12234 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.64□□□□□ -0.71
RUD3Q12234 SHM2YLR058C 1410 nt10.64□□□□□ -0.71
RUD3Q12234 BDH1YAL060W 1149 nt10.62□□□□□ -0.71
RUD3Q12234 DAT1YML113W 747 nt10.62□□□□□ -0.71
RUD3Q12234 PLB1YMR008C 1995 nt10.62□□□□□ -0.71
RUD3Q12234 SSN3YPL042C 1668 nt10.61□□□□□ -0.71
RUD3Q12234 HIF1YLL022C 1158 nt10.61□□□□□ -0.71
RUD3Q12234 YLR415CYLR415C 339 nt10.6□□□□□ -0.71
RUD3Q12234 INA1YLR413W 2028 nt10.6□□□□□ -0.71
RUD3Q12234 ARP6YLR085C 1317 nt10.59□□□□□ -0.71
RUD3Q12234 ALD4YOR374W 1560 nt10.59□□□□□ -0.71
RUD3Q12234 TIM17YJL143W 477 nt10.58□□□□□ -0.72
RUD3Q12234 RPC82YPR190C 1965 nt10.57□□□□□ -0.72
RUD3Q12234 NBP35YGL091C 987 nt10.56□□□□□ -0.72
RUD3Q12234 FRE6YLL051C 2139 nt10.55□□□□□ -0.72
RUD3Q12234 PRM5YIL117C 957 nt10.55□□□□□ -0.72
RUD3Q12234 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.54□□□□□ -0.72
RUD3Q12234 YCR102CYCR102C 1107 nt10.53□□□□□ -0.72
RUD3Q12234 NIT1YIL164C 600 nt10.53□□□□□ -0.72
RUD3Q12234 YSP3YOR003W 1437 nt10.45□□□□□ -0.74
RUD3Q12234 UTR1YJR049C 1593 nt10.43□□□□□ -0.74
RUD3Q12234 ZRT3YKL175W 1512 nt10.43□□□□□ -0.74
RUD3Q12234 SGT2YOR007C 1041 nt10.43□□□□□ -0.74
RUD3Q12234 GID7YCL039W 2238 nt10.41□□□□□ -0.74
RUD3Q12234 SAM35YHR083W 990 nt10.4□□□□□ -0.74
RUD3Q12234 HEL2YDR266C 1920 nt10.39□□□□□ -0.75
RUD3Q12234 LSC2YGR244C 1284 nt10.39□□□□□ -0.75
RUD3Q12234 GAP1YKR039W 1809 nt10.36□□□□□ -0.75
RUD3Q12234 TIR3YIL011W 810 nt10.34□□□□□ -0.75
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