Protein–RNA interactions for Protein: Q12048

ATG41, Autophagy-related protein 41, yeastyeast

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG41Q12048 DDR2YOL052C-A 186 nt9.68□□□□□ -0.86
ATG41Q12048 PRP4YPR178W 1398 nt9.67□□□□□ -0.86
ATG41Q12048 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.65□□□□□ -0.86
ATG41Q12048 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt9.65□□□□□ -0.86
ATG41Q12048 YEL076CYEL076C 651 nt9.65□□□□□ -0.86
ATG41Q12048 YLR464WYLR464W 651 nt9.65□□□□□ -0.86
ATG41Q12048 DPS1YLL018C 1674 nt9.63□□□□□ -0.87
ATG41Q12048 ANP1YEL036C 1503 nt9.62□□□□□ -0.87
ATG41Q12048 AAC1YMR056C 930 nt9.6□□□□□ -0.87
ATG41Q12048 AGP1YCL025C 1902 nt9.59□□□□□ -0.87
ATG41Q12048 BNA2YJR078W 1362 nt9.59□□□□□ -0.87
ATG41Q12048 YKR005CYKR005C 1578 nt9.56□□□□□ -0.88
ATG41Q12048 MIC12YBR262C 321 nt9.56□□□□□ -0.88
ATG41Q12048 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.55□□□□□ -0.88
ATG41Q12048 AQY1YPR192W 918 nt9.55□□□□□ -0.88
ATG41Q12048 WSC2YNL283C 1512 nt9.53□□□□□ -0.88
ATG41Q12048 SNF1YDR477W 1902 nt9.53□□□□□ -0.88
ATG41Q12048 PTH1YHR189W 573 nt9.53□□□□□ -0.88
ATG41Q12048 BMT6YLR063W 1098 nt9.53□□□□□ -0.88
ATG41Q12048 DUS1YML080W 1272 nt9.53□□□□□ -0.88
ATG41Q12048 STB1YNL309W 1263 nt9.53□□□□□ -0.88
ATG41Q12048 FEN2YCR028C 1539 nt9.52□□□□□ -0.88
ATG41Q12048 NAR1YNL240C 1476 nt9.52□□□□□ -0.89
ATG41Q12048 SPC25YER018C 666 nt9.51□□□□□ -0.89
ATG41Q12048 BIO5YNR056C 1686 nt9.51□□□□□ -0.89
ATG41Q12048 YCL074WYCL074W 927 nt9.5□□□□□ -0.89
ATG41Q12048 YLR179CYLR179C 606 nt9.48□□□□□ -0.89
ATG41Q12048 TIM23YNR017W 669 nt9.48□□□□□ -0.89
ATG41Q12048 HHO1YPL127C 777 nt9.47□□□□□ -0.89
ATG41Q12048 GPI16YHR188C 1833 nt9.47□□□□□ -0.89
ATG41Q12048 YGR259CYGR259C 441 nt9.45□□□□□ -0.9
ATG41Q12048 SPP1YPL138C 1062 nt9.45□□□□□ -0.9
ATG41Q12048 VPS60YDR486C 690 nt9.44□□□□□ -0.9
ATG41Q12048 YIR016WYIR016W 798 nt9.44□□□□□ -0.9
ATG41Q12048 YLR235CYLR235C 399 nt9.44□□□□□ -0.9
ATG41Q12048 PBP1YGR178C 2169 nt9.41□□□□□ -0.9
ATG41Q12048 XDJ1YLR090W 1380 nt9.41□□□□□ -0.9
ATG41Q12048 CCT4YDL143W 1587 nt9.41□□□□□ -0.9
ATG41Q12048 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.4□□□□□ -0.9
ATG41Q12048 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.4□□□□□ -0.9
ATG41Q12048 ALG3YBL082C 1377 nt9.4□□□□□ -0.9
ATG41Q12048 AHT1YHR093W 549 nt9.38□□□□□ -0.91
ATG41Q12048 IRC24YIR036C 792 nt9.38□□□□□ -0.91
ATG41Q12048 YGR201CYGR201C 678 nt9.37□□□□□ -0.91
ATG41Q12048 DUT1YBR252W 444 nt9.37□□□□□ -0.91
ATG41Q12048 SWC5YBR231C 912 nt9.36□□□□□ -0.91
ATG41Q12048 STR3YGL184C 1398 nt9.35□□□□□ -0.91
ATG41Q12048 CYT2YKL087C 675 nt9.34□□□□□ -0.91
ATG41Q12048 YKL030WYKL030W 606 nt9.3□□□□□ -0.92
ATG41Q12048 AQY2YLL052C 450 nt9.28□□□□□ -0.92
ATG41Q12048 YPR064WYPR064W 420 nt9.28□□□□□ -0.92
ATG41Q12048 AVT6YER119C 1347 nt9.27□□□□□ -0.93
ATG41Q12048 GOR1YNL274C 1053 nt9.24□□□□□ -0.93
ATG41Q12048 GDH3YAL062W 1374 nt9.23□□□□□ -0.93
ATG41Q12048 TAD3YLR316C 969 nt9.22□□□□□ -0.93
ATG41Q12048 RTN2YDL204W 1182 nt9.19□□□□□ -0.94
ATG41Q12048 MOT3YMR070W 1473 nt9.19□□□□□ -0.94
ATG41Q12048 YAT1YAR035W 2064 nt9.19□□□□□ -0.94
ATG41Q12048 BDH1YAL060W 1149 nt9.16□□□□□ -0.94
ATG41Q12048 CMP2YML057W 1815 nt9.15□□□□□ -0.94
ATG41Q12048 SHM2YLR058C 1410 nt9.14□□□□□ -0.95
ATG41Q12048 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.13□□□□□ -0.95
ATG41Q12048 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.13□□□□□ -0.95
ATG41Q12048 YLR415CYLR415C 339 nt9.1□□□□□ -0.95
ATG41Q12048 PLB1YMR008C 1995 nt9.07□□□□□ -0.96
ATG41Q12048 NIT1YIL164C 600 nt9.05□□□□□ -0.96
ATG41Q12048 TIM17YJL143W 477 nt9.05□□□□□ -0.96
ATG41Q12048 DAT1YML113W 747 nt9.05□□□□□ -0.96
ATG41Q12048 RTG1YOL067C 534 nt9.04□□□□□ -0.96
ATG41Q12048 NDI1YML120C 1542 nt9.03□□□□□ -0.96
ATG41Q12048 HSL7YBR133C 2484 nt9.03□□□□□ -0.96
ATG41Q12048 NBP35YGL091C 987 nt9.02□□□□□ -0.97
ATG41Q12048 YSP3YOR003W 1437 nt9.02□□□□□ -0.97
ATG41Q12048 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.01□□□□□ -0.97
ATG41Q12048 PRM5YIL117C 957 nt9.01□□□□□ -0.97
ATG41Q12048 HIF1YLL022C 1158 nt9.01□□□□□ -0.97
ATG41Q12048 ARP6YLR085C 1317 nt9□□□□□ -0.97
ATG41Q12048 SGT2YOR007C 1041 nt8.99□□□□□ -0.97
ATG41Q12048 YCR102CYCR102C 1107 nt8.98□□□□□ -0.97
ATG41Q12048 ALD4YOR374W 1560 nt8.96□□□□□ -0.97
ATG41Q12048 RPC82YPR190C 1965 nt8.95□□□□□ -0.98
ATG41Q12048 SPT20YOL148C 1815 nt8.94□□□□□ -0.98
ATG41Q12048 UTR1YJR049C 1593 nt8.91□□□□□ -0.98
ATG41Q12048 INA1YLR413W 2028 nt8.91□□□□□ -0.98
ATG41Q12048 YNL115CYNL115C 1935 nt8.91□□□□□ -0.98
ATG41Q12048 HUA1YGR268C 597 nt8.85□□□□□ -0.99
ATG41Q12048 SHH4YLR164W 507 nt8.84□□□□□ -0.99
ATG41Q12048 PEX25YPL112C 1185 nt8.84□□□□□ -0.99
ATG41Q12048 GAP1YKR039W 1809 nt8.84□□□□□ -0.99
ATG41Q12048 TIR3YIL011W 810 nt8.82□□□□□ -1
ATG41Q12048 RDN25-1RDN25-1 3396 nt8.81□□□□□ -1
ATG41Q12048 RDN25-2RDN25-2 3396 nt8.81□□□□□ -1
ATG41Q12048 LSC2YGR244C 1284 nt8.8□□□□□ -1
ATG41Q12048 PRO1YDR300C 1287 nt8.79□□□□□ -1
ATG41Q12048 YFL066CYFL066C 1179 nt8.79□□□□□ -1
ATG41Q12048 VPS75YNL246W 795 nt8.79□□□□□ -1
ATG41Q12048 ZRT3YKL175W 1512 nt8.79□□□□□ -1
ATG41Q12048 SAM35YHR083W 990 nt8.78□□□□□ -1
ATG41Q12048 YJL067WYJL067W 351 nt8.73□□□□□ -1.01
ATG41Q12048 POM34YLR018C 900 nt8.73□□□□□ -1.01
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