Protein–RNA interactions for Protein: Q08685

CLP1, mRNA cleavage and polyadenylation factor CLP1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLP1Q08685 PIB2YGL023C 1908 nt11.03□□□□□ -0.64
CLP1Q08685 GAL1YBR020W 1587 nt11□□□□□ -0.65
CLP1Q08685 DDR2YOL052C-A 186 nt10.98□□□□□ -0.65
CLP1Q08685 TRM5YHR070W 1500 nt10.98□□□□□ -0.65
CLP1Q08685 PRE6YOL038W 765 nt10.97□□□□□ -0.65
CLP1Q08685 YLR415CYLR415C 339 nt10.95□□□□□ -0.66
CLP1Q08685 STB1YNL309W 1263 nt10.94□□□□□ -0.66
CLP1Q08685 YFL067WYFL067W 528 nt10.93□□□□□ -0.66
CLP1Q08685 ERF2YLR246W 1080 nt10.93□□□□□ -0.66
CLP1Q08685 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.92□□□□□ -0.66
CLP1Q08685 PEX25YPL112C 1185 nt10.92□□□□□ -0.66
CLP1Q08685 GPI16YHR188C 1833 nt10.92□□□□□ -0.66
CLP1Q08685 YFL066CYFL066C 1179 nt10.91□□□□□ -0.66
CLP1Q08685 SWC5YBR231C 912 nt10.91□□□□□ -0.66
CLP1Q08685 RTF1YGL244W 1677 nt10.91□□□□□ -0.66
CLP1Q08685 CCT4YDL143W 1587 nt10.9□□□□□ -0.66
CLP1Q08685 SPC25YER018C 666 nt10.89□□□□□ -0.67
CLP1Q08685 NAT4YMR069W 858 nt10.88□□□□□ -0.67
CLP1Q08685 GLK1YCL040W 1503 nt10.87□□□□□ -0.67
CLP1Q08685 YNL115CYNL115C 1935 nt10.86□□□□□ -0.67
CLP1Q08685 BDH1YAL060W 1149 nt10.86□□□□□ -0.67
CLP1Q08685 ATF2YGR177C 1608 nt10.86□□□□□ -0.67
CLP1Q08685 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.85□□□□□ -0.67
CLP1Q08685 YSP3YOR003W 1437 nt10.84□□□□□ -0.67
CLP1Q08685 VPS60YDR486C 690 nt10.81□□□□□ -0.68
CLP1Q08685 BOP3YNL042W 1191 nt10.81□□□□□ -0.68
CLP1Q08685 SBA1YKL117W 651 nt10.8□□□□□ -0.68
CLP1Q08685 CRR1YLR213C 1269 nt10.79□□□□□ -0.68
CLP1Q08685 FEN2YCR028C 1539 nt10.79□□□□□ -0.68
CLP1Q08685 PTK1YKL198C 1989 nt10.78□□□□□ -0.68
CLP1Q08685 HEM12YDR047W 1089 nt10.78□□□□□ -0.68
CLP1Q08685 PAU7YAR020C 168 nt10.74□□□□□ -0.69
CLP1Q08685 ANP1YEL036C 1503 nt10.74□□□□□ -0.69
CLP1Q08685 NCP1YHR042W 2076 nt10.73□□□□□ -0.69
CLP1Q08685 VPS75YNL246W 795 nt10.73□□□□□ -0.69
CLP1Q08685 MCH5YOR306C 1566 nt10.73□□□□□ -0.69
CLP1Q08685 SNG1YGR197C 1644 nt10.72□□□□□ -0.69
CLP1Q08685 THI74YDR438W 1113 nt10.71□□□□□ -0.69
CLP1Q08685 ALG3YBL082C 1377 nt10.71□□□□□ -0.69
CLP1Q08685 MSF1YPR047W 1410 nt10.7□□□□□ -0.7
CLP1Q08685 SPT8YLR055C 1809 nt10.69□□□□□ -0.7
CLP1Q08685 TIM17YJL143W 477 nt10.68□□□□□ -0.7
CLP1Q08685 YIR016WYIR016W 798 nt10.67□□□□□ -0.7
CLP1Q08685 MIC10YCL057C-A 294 nt10.66□□□□□ -0.7
CLP1Q08685 BNA2YJR078W 1362 nt10.65□□□□□ -0.7
CLP1Q08685 MIR1YJR077C 936 nt10.65□□□□□ -0.7
CLP1Q08685 LYS4YDR234W 2082 nt10.62□□□□□ -0.71
CLP1Q08685 SSN3YPL042C 1668 nt10.59□□□□□ -0.71
CLP1Q08685 DAT1YML113W 747 nt10.55□□□□□ -0.72
CLP1Q08685 FRE6YLL051C 2139 nt10.55□□□□□ -0.72
CLP1Q08685 YFL054CYFL054C 1941 nt10.53□□□□□ -0.72
CLP1Q08685 SHM2YLR058C 1410 nt10.53□□□□□ -0.72
CLP1Q08685 XDJ1YLR090W 1380 nt10.52□□□□□ -0.72
CLP1Q08685 YSR3YKR053C 1215 nt10.5□□□□□ -0.73
CLP1Q08685 UBA4YHR111W 1323 nt10.5□□□□□ -0.73
CLP1Q08685 RAX1YOR301W 1308 nt10.5□□□□□ -0.73
CLP1Q08685 YGL034CYGL034C 366 nt10.49□□□□□ -0.73
CLP1Q08685 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.49□□□□□ -0.73
CLP1Q08685 SHB17YKR043C 816 nt10.49□□□□□ -0.73
CLP1Q08685 HHO1YPL127C 777 nt10.49□□□□□ -0.73
CLP1Q08685 BOR1YNL275W 1731 nt10.49□□□□□ -0.73
CLP1Q08685 GDH3YAL062W 1374 nt10.49□□□□□ -0.73
CLP1Q08685 GLR1YPL091W 1452 nt10.45□□□□□ -0.74
CLP1Q08685 SGT2YOR007C 1041 nt10.44□□□□□ -0.74
CLP1Q08685 YGR201CYGR201C 678 nt10.43□□□□□ -0.74
CLP1Q08685 MIC12YBR262C 321 nt10.43□□□□□ -0.74
CLP1Q08685 NDI1YML120C 1542 nt10.42□□□□□ -0.74
CLP1Q08685 YMR244WYMR244W 1068 nt10.41□□□□□ -0.74
CLP1Q08685 XYL2YLR070C 1071 nt10.4□□□□□ -0.74
CLP1Q08685 AVT6YER119C 1347 nt10.39□□□□□ -0.75
CLP1Q08685 YCR087WYCR087W 516 nt10.39□□□□□ -0.75
CLP1Q08685 RBG1YAL036C 1110 nt10.39□□□□□ -0.75
CLP1Q08685 GOR1YNL274C 1053 nt10.38□□□□□ -0.75
CLP1Q08685 PHO89YBR296C 1725 nt10.37□□□□□ -0.75
CLP1Q08685 NIT1YIL164C 600 nt10.36□□□□□ -0.75
CLP1Q08685 YDR010CYDR010C 333 nt10.34□□□□□ -0.75
CLP1Q08685 RET2YFR051C 1641 nt10.33□□□□□ -0.76
CLP1Q08685 MRP20YDR405W 792 nt10.31□□□□□ -0.76
CLP1Q08685 SWE1YJL187C 2460 nt10.29□□□□□ -0.76
CLP1Q08685 AIM45YPR004C 1035 nt10.28□□□□□ -0.76
CLP1Q08685 RBG2YGR173W 1107 nt10.27□□□□□ -0.77
CLP1Q08685 GID7YCL039W 2238 nt10.27□□□□□ -0.77
CLP1Q08685 YCR102CYCR102C 1107 nt10.26□□□□□ -0.77
CLP1Q08685 YMR226CYMR226C 804 nt10.23□□□□□ -0.77
CLP1Q08685 YJL225CYJL225C 5277 nt10.19□□□□□ -0.78
CLP1Q08685 DUS1YML080W 1272 nt10.19□□□□□ -0.78
CLP1Q08685 BSP1YPR171W 1731 nt10.19□□□□□ -0.78
CLP1Q08685 CCA1YER168C 1641 nt10.18□□□□□ -0.78
CLP1Q08685 YLR111WYLR111W 333 nt10.18□□□□□ -0.78
CLP1Q08685 COQ2YNR041C 1119 nt10.17□□□□□ -0.78
CLP1Q08685 CLB6YGR109C 1143 nt10.15□□□□□ -0.78
CLP1Q08685 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.15□□□□□ -0.78
CLP1Q08685 SDH5YOL071W 489 nt10.14□□□□□ -0.79
CLP1Q08685 AGP1YCL025C 1902 nt10.12□□□□□ -0.79
CLP1Q08685 RPL4BYDR012W 1089 nt10.12□□□□□ -0.79
CLP1Q08685 RPL4AYBR031W 1089 nt10.12□□□□□ -0.79
CLP1Q08685 DUT1YBR252W 444 nt10.12□□□□□ -0.79
CLP1Q08685 HSP60YLR259C 1719 nt10.12□□□□□ -0.79
CLP1Q08685 SFA1YDL168W 1161 nt10.1□□□□□ -0.79
CLP1Q08685 ALG12YNR030W 1656 nt10.09□□□□□ -0.79
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