RNAct
Search
Pairwise
Browse
Proteins
RNAs
Download
About
Search
Protein–RNA interactions for Protein: Q08490
SGO1, Shugoshin, yeast
Predictions only
Length
590 aa
.
Download Table
Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
SGO1
Q08490
YSP3
YOR003W
1437 nt
11.31
□□□□□ -0.6
SGO1
Q08490
YNL115C
YNL115C
1935 nt
11.3
□□□□□ -0.6
SGO1
Q08490
YHL050C
YHL050C
2094 nt
11.29
□□□□□ -0.6
SGO1
Q08490
BDH1
YAL060W
1149 nt
11.28
□□□□□ -0.6
SGO1
Q08490
THI74
YDR438W
1113 nt
11.24
□□□□□ -0.61
SGO1
Q08490
MIR1
YJR077C
936 nt
11.24
□□□□□ -0.61
SGO1
Q08490
UME6
YDR207C
2511 nt
11.24
□□□□□ -0.61
SGO1
Q08490
PTK1
YKL198C
1989 nt
11.22
□□□□□ -0.61
SGO1
Q08490
YLR415C
YLR415C
339 nt
11.19
□□□□□ -0.62
SGO1
Q08490
AQY1
YPR192W
918 nt
11.18
□□□□□ -0.62
SGO1
Q08490
YLL053C
YLL053C
459 nt
11.17
□□□□□ -0.62
SGO1
Q08490
BOP3
YNL042W
1191 nt
11.16
□□□□□ -0.62
SGO1
Q08490
RRT12
YCR045C
1476 nt
11.15
□□□□□ -0.62
SGO1
Q08490
GLR1
YPL091W
1452 nt
11.14
□□□□□ -0.63
SGO1
Q08490
FTR1
YER145C
1215 nt
11.14
□□□□□ -0.63
SGO1
Q08490
BOR1
YNL275W
1731 nt
11.13
□□□□□ -0.63
SGO1
Q08490
GAL1
YBR020W
1587 nt
11.11
□□□□□ -0.63
SGO1
Q08490
YJL225C
YJL225C
5277 nt
11.11
□□□□□ -0.63
SGO1
Q08490
VPS75
YNL246W
795 nt
11.1
□□□□□ -0.63
SGO1
Q08490
DAT1
YML113W
747 nt
11.09
□□□□□ -0.63
SGO1
Q08490
BIO4
YNR057C
714 nt
11.09
□□□□□ -0.63
SGO1
Q08490
RBG2
YGR173W
1107 nt
11.08
□□□□□ -0.64
SGO1
Q08490
CCT4
YDL143W
1587 nt
11.07
□□□□□ -0.64
SGO1
Q08490
TRM5
YHR070W
1500 nt
11.06
□□□□□ -0.64
SGO1
Q08490
STB1
YNL309W
1263 nt
11.06
□□□□□ -0.64
SGO1
Q08490
SPC25
YER018C
666 nt
11.05
□□□□□ -0.64
SGO1
Q08490
YGL034C
YGL034C
366 nt
11.02
□□□□□ -0.65
SGO1
Q08490
YDR524C-B
YDR524C-B
201 nt
11
□□□□□ -0.65
SGO1
Q08490
SWC5
YBR231C
912 nt
10.99
□□□□□ -0.65
SGO1
Q08490
SIM1
YIL123W
1431 nt
10.99
□□□□□ -0.65
SGO1
Q08490
VPS60
YDR486C
690 nt
10.98
□□□□□ -0.65
SGO1
Q08490
YNL195C
YNL195C
786 nt
10.98
□□□□□ -0.65
SGO1
Q08490
GPI16
YHR188C
1833 nt
10.98
□□□□□ -0.65
SGO1
Q08490
ALG3
YBL082C
1377 nt
10.96
□□□□□ -0.65
SGO1
Q08490
SPT8
YLR055C
1809 nt
10.95
□□□□□ -0.66
SGO1
Q08490
UBA4
YHR111W
1323 nt
10.94
□□□□□ -0.66
SGO1
Q08490
NCP1
YHR042W
2076 nt
10.94
□□□□□ -0.66
SGO1
Q08490
NDI1
YML120C
1542 nt
10.94
□□□□□ -0.66
SGO1
Q08490
PAU7
YAR020C
168 nt
10.93
□□□□□ -0.66
SGO1
Q08490
ATF2
YGR177C
1608 nt
10.93
□□□□□ -0.66
SGO1
Q08490
YFL054C
YFL054C
1941 nt
10.92
□□□□□ -0.66
SGO1
Q08490
DDR2
YOL052C-A
186 nt
10.91
□□□□□ -0.66
SGO1
Q08490
RBG1
YAL036C
1110 nt
10.87
□□□□□ -0.67
SGO1
Q08490
SHB17
YKR043C
816 nt
10.87
□□□□□ -0.67
SGO1
Q08490
YSR3
YKR053C
1215 nt
10.87
□□□□□ -0.67
SGO1
Q08490
MCH5
YOR306C
1566 nt
10.86
□□□□□ -0.67
SGO1
Q08490
YFL067W
YFL067W
528 nt
10.86
□□□□□ -0.67
SGO1
Q08490
XYL2
YLR070C
1071 nt
10.86
□□□□□ -0.67
SGO1
Q08490
FEN2
YCR028C
1539 nt
10.85
□□□□□ -0.67
SGO1
Q08490
YDL086C-A
YDL086C-A
435 nt
10.85
□□□□□ -0.67
SGO1
Q08490
ERF2
YLR246W
1080 nt
10.82
□□□□□ -0.68
SGO1
Q08490
ANP1
YEL036C
1503 nt
10.82
□□□□□ -0.68
SGO1
Q08490
SAM1
YLR180W
1149 nt
10.81
□□□□□ -0.68
SGO1
Q08490
TIM17
YJL143W
477 nt
10.79
□□□□□ -0.68
SGO1
Q08490
CRR1
YLR213C
1269 nt
10.79
□□□□□ -0.68
SGO1
Q08490
YDR010C
YDR010C
333 nt
10.78
□□□□□ -0.68
SGO1
Q08490
RAD51
YER095W
1203 nt
10.78
□□□□□ -0.68
SGO1
Q08490
YMR226C
YMR226C
804 nt
10.78
□□□□□ -0.68
SGO1
Q08490
HSP60
YLR259C
1719 nt
10.75
□□□□□ -0.69
SGO1
Q08490
ALG12
YNR030W
1656 nt
10.74
□□□□□ -0.69
SGO1
Q08490
YIR016W
YIR016W
798 nt
10.74
□□□□□ -0.69
SGO1
Q08490
RPM1
RPM1
483 nt
10.72
□□□□□ -0.69
SGO1
Q08490
SNG1
YGR197C
1644 nt
10.72
□□□□□ -0.69
SGO1
Q08490
AIM45
YPR004C
1035 nt
10.71
□□□□□ -0.69
SGO1
Q08490
SHM2
YLR058C
1410 nt
10.7
□□□□□ -0.7
SGO1
Q08490
PHO89
YBR296C
1725 nt
10.7
□□□□□ -0.7
SGO1
Q08490
YCR087W
YCR087W
516 nt
10.69
□□□□□ -0.7
SGO1
Q08490
RET2
YFR051C
1641 nt
10.69
□□□□□ -0.7
SGO1
Q08490
MIC10
YCL057C-A
294 nt
10.67
□□□□□ -0.7
SGO1
Q08490
SGT2
YOR007C
1041 nt
10.66
□□□□□ -0.7
SGO1
Q08490
HEM12
YDR047W
1089 nt
10.64
□□□□□ -0.71
SGO1
Q08490
NIT1
YIL164C
600 nt
10.64
□□□□□ -0.71
SGO1
Q08490
SWE1
YJL187C
2460 nt
10.64
□□□□□ -0.71
SGO1
Q08490
RDN37-1
RDN37-1
5354 nt
10.62
□□□□□ -0.71
SGO1
Q08490
RDN37-2
RDN37-2
5354 nt
10.62
□□□□□ -0.71
SGO1
Q08490
XDJ1
YLR090W
1380 nt
10.61
□□□□□ -0.71
SGO1
Q08490
YNR029C
YNR029C
1290 nt
10.58
□□□□□ -0.72
SGO1
Q08490
YLR111W
YLR111W
333 nt
10.57
□□□□□ -0.72
SGO1
Q08490
LYS4
YDR234W
2082 nt
10.56
□□□□□ -0.72
SGO1
Q08490
COQ2
YNR041C
1119 nt
10.55
□□□□□ -0.72
SGO1
Q08490
MRP20
YDR405W
792 nt
10.54
□□□□□ -0.72
SGO1
Q08490
YLR349W
YLR349W
507 nt
10.52
□□□□□ -0.73
SGO1
Q08490
STE4
YOR212W
1272 nt
10.51
□□□□□ -0.73
SGO1
Q08490
GDH3
YAL062W
1374 nt
10.5
□□□□□ -0.73
SGO1
Q08490
MIC12
YBR262C
321 nt
10.45
□□□□□ -0.74
SGO1
Q08490
NAR1
YNL240C
1476 nt
10.43
□□□□□ -0.74
SGO1
Q08490
SFA1
YDL168W
1161 nt
10.43
□□□□□ -0.74
SGO1
Q08490
YLR437C-A
YLR437C-A
228 nt
10.43
□□□□□ -0.74
SGO1
Q08490
BNA2
YJR078W
1362 nt
10.42
□□□□□ -0.74
SGO1
Q08490
ADH7
YCR105W
1086 nt
10.41
□□□□□ -0.74
SGO1
Q08490
SDH5
YOL071W
489 nt
10.41
□□□□□ -0.74
SGO1
Q08490
CAB5
YDR196C
726 nt
10.4
□□□□□ -0.74
SGO1
Q08490
FUR4
YBR021W
1902 nt
10.39
□□□□□ -0.75
SGO1
Q08490
RPL4B
YDR012W
1089 nt
10.38
□□□□□ -0.75
SGO1
Q08490
RAD23
YEL037C
1197 nt
10.38
□□□□□ -0.75
SGO1
Q08490
PAU15
YIR041W
375 nt
10.38
□□□□□ -0.75
SGO1
Q08490
RPL4A
YBR031W
1089 nt
10.38
□□□□□ -0.75
SGO1
Q08490
YHR056W-A
YHR056W-A
435 nt
10.37
□□□□□ -0.75
SGO1
Q08490
YGR201C
YGR201C
678 nt
10.36
□□□□□ -0.75
SGO1
Q08490
FUN14
YAL008W
597 nt
10.36
□□□□□ -0.75
First
Previous
3
Next
Last
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.3 ms