Protein–RNA interactions for Protein: Q04217

ECM16, Probable ATP-dependent RNA helicase DHR1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ECM16Q04217 ADO1YJR105W 1023 nt13.14□□□□□ -0.31
ECM16Q04217 RTG1YOL067C 534 nt13.14□□□□□ -0.31
ECM16Q04217 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt13.13□□□□□ -0.31
ECM16Q04217 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt13.13□□□□□ -0.31
ECM16Q04217 STB1YNL309W 1263 nt13.13□□□□□ -0.31
ECM16Q04217 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt13.12□□□□□ -0.31
ECM16Q04217 YEL076CYEL076C 651 nt13.12□□□□□ -0.31
ECM16Q04217 YLR464WYLR464W 651 nt13.12□□□□□ -0.31
ECM16Q04217 YPR064WYPR064W 420 nt13.12□□□□□ -0.31
ECM16Q04217 YJL225CYJL225C 5277 nt13.11□□□□□ -0.31
ECM16Q04217 RAX1YOR301W 1308 nt13.09□□□□□ -0.31
ECM16Q04217 GPI16YHR188C 1833 nt13.09□□□□□ -0.31
ECM16Q04217 SPC25YER018C 666 nt13.08□□□□□ -0.32
ECM16Q04217 ANP1YEL036C 1503 nt13.07□□□□□ -0.32
ECM16Q04217 SWE1YJL187C 2460 nt13.06□□□□□ -0.32
ECM16Q04217 AHT1YHR093W 549 nt13.06□□□□□ -0.32
ECM16Q04217 BNA2YJR078W 1362 nt13.06□□□□□ -0.32
ECM16Q04217 WSC2YNL283C 1512 nt13.05□□□□□ -0.32
ECM16Q04217 HUA1YGR268C 597 nt13.04□□□□□ -0.32
ECM16Q04217 FEN2YCR028C 1539 nt13.03□□□□□ -0.32
ECM16Q04217 TAD3YLR316C 969 nt13.01□□□□□ -0.33
ECM16Q04217 CCT4YDL143W 1587 nt13.01□□□□□ -0.33
ECM16Q04217 SWC5YBR231C 912 nt13□□□□□ -0.33
ECM16Q04217 VPS60YDR486C 690 nt12.97□□□□□ -0.33
ECM16Q04217 UME6YDR207C 2511 nt12.93□□□□□ -0.34
ECM16Q04217 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt12.91□□□□□ -0.34
ECM16Q04217 YIR016WYIR016W 798 nt12.91□□□□□ -0.34
ECM16Q04217 CCA1YER168C 1641 nt12.89□□□□□ -0.35
ECM16Q04217 ALG3YBL082C 1377 nt12.88□□□□□ -0.35
ECM16Q04217 HHO1YPL127C 777 nt12.86□□□□□ -0.35
ECM16Q04217 MIC12YBR262C 321 nt12.86□□□□□ -0.35
ECM16Q04217 YLR415CYLR415C 339 nt12.83□□□□□ -0.36
ECM16Q04217 BDH1YAL060W 1149 nt12.77□□□□□ -0.37
ECM16Q04217 BOR1YNL275W 1731 nt12.74□□□□□ -0.37
ECM16Q04217 YGR201CYGR201C 678 nt12.74□□□□□ -0.37
ECM16Q04217 DUS1YML080W 1272 nt12.74□□□□□ -0.37
ECM16Q04217 UBX6YJL048C 1191 nt12.72□□□□□ -0.37
ECM16Q04217 FUR4YBR021W 1902 nt12.7□□□□□ -0.38
ECM16Q04217 XDJ1YLR090W 1380 nt12.69□□□□□ -0.38
ECM16Q04217 AGP1YCL025C 1902 nt12.66□□□□□ -0.38
ECM16Q04217 TIM17YJL143W 477 nt12.66□□□□□ -0.38
ECM16Q04217 GDH3YAL062W 1374 nt12.66□□□□□ -0.38
ECM16Q04217 YSP3YOR003W 1437 nt12.65□□□□□ -0.38
ECM16Q04217 GLK1YCL040W 1503 nt12.65□□□□□ -0.38
ECM16Q04217 HSP60YLR259C 1719 nt12.65□□□□□ -0.38
ECM16Q04217 AVT6YER119C 1347 nt12.64□□□□□ -0.39
ECM16Q04217 GOR1YNL274C 1053 nt12.63□□□□□ -0.39
ECM16Q04217 YDR094WYDR094W 336 nt12.62□□□□□ -0.39
ECM16Q04217 SHM2YLR058C 1410 nt12.6□□□□□ -0.39
ECM16Q04217 YNL115CYNL115C 1935 nt12.6□□□□□ -0.39
ECM16Q04217 YCL074WYCL074W 927 nt12.59□□□□□ -0.39
ECM16Q04217 PEX25YPL112C 1185 nt12.58□□□□□ -0.4
ECM16Q04217 YFL066CYFL066C 1179 nt12.51□□□□□ -0.41
ECM16Q04217 YFR018CYFR018C 1092 nt12.51□□□□□ -0.41
ECM16Q04217 DUT1YBR252W 444 nt12.51□□□□□ -0.41
ECM16Q04217 PRP4YPR178W 1398 nt12.49□□□□□ -0.41
ECM16Q04217 AQY2YLL052C 450 nt12.48□□□□□ -0.41
ECM16Q04217 BMT6YLR063W 1098 nt12.47□□□□□ -0.41
ECM16Q04217 VPS75YNL246W 795 nt12.47□□□□□ -0.41
ECM16Q04217 RDN37-1RDN37-1 5354 nt12.46□□□□□ -0.42
ECM16Q04217 RDN37-2RDN37-2 5354 nt12.46□□□□□ -0.42
ECM16Q04217 STR3YGL184C 1398 nt12.44□□□□□ -0.42
ECM16Q04217 SGT2YOR007C 1041 nt12.44□□□□□ -0.42
ECM16Q04217 YKR005CYKR005C 1578 nt12.43□□□□□ -0.42
ECM16Q04217 NIT1YIL164C 600 nt12.42□□□□□ -0.42
ECM16Q04217 RRT5YFR032C 870 nt12.41□□□□□ -0.42
ECM16Q04217 PAU7YAR020C 168 nt12.41□□□□□ -0.42
ECM16Q04217 RDN18-1RDN18-1 1800 nt12.39□□□□□ -0.43
ECM16Q04217 RDN18-2RDN18-2 1800 nt12.39□□□□□ -0.43
ECM16Q04217 DPS1YLL018C 1674 nt12.39□□□□□ -0.43
ECM16Q04217 YGR259CYGR259C 441 nt12.39□□□□□ -0.43
ECM16Q04217 PRE6YOL038W 765 nt12.39□□□□□ -0.43
ECM16Q04217 DAT1YML113W 747 nt12.38□□□□□ -0.43
ECM16Q04217 YCR102CYCR102C 1107 nt12.36□□□□□ -0.43
ECM16Q04217 AAC1YMR056C 930 nt12.33□□□□□ -0.44
ECM16Q04217 PAU16YKL224C 372 nt12.3□□□□□ -0.44
ECM16Q04217 RTN2YDL204W 1182 nt12.26□□□□□ -0.45
ECM16Q04217 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt12.25□□□□□ -0.45
ECM16Q04217 MCH5YOR306C 1566 nt12.24□□□□□ -0.45
ECM16Q04217 NBP35YGL091C 987 nt12.23□□□□□ -0.45
ECM16Q04217 IRC24YIR036C 792 nt12.21□□□□□ -0.45
ECM16Q04217 SHB17YKR043C 816 nt12.19□□□□□ -0.46
ECM16Q04217 ALG12YNR030W 1656 nt12.19□□□□□ -0.46
ECM16Q04217 MIR1YJR077C 936 nt12.17□□□□□ -0.46
ECM16Q04217 THI74YDR438W 1113 nt12.13□□□□□ -0.47
ECM16Q04217 NAT4YMR069W 858 nt12.13□□□□□ -0.47
ECM16Q04217 SNF1YDR477W 1902 nt12.11□□□□□ -0.47
ECM16Q04217 YDR010CYDR010C 333 nt12.11□□□□□ -0.47
ECM16Q04217 TIR3YIL011W 810 nt12.11□□□□□ -0.47
ECM16Q04217 UBA4YHR111W 1323 nt12.09□□□□□ -0.47
ECM16Q04217 ARP6YLR085C 1317 nt12.09□□□□□ -0.47
ECM16Q04217 PLB1YMR008C 1995 nt12.09□□□□□ -0.47
ECM16Q04217 PHO89YBR296C 1725 nt12.06□□□□□ -0.48
ECM16Q04217 RET2YFR051C 1641 nt12.05□□□□□ -0.48
ECM16Q04217 LSC2YGR244C 1284 nt12.05□□□□□ -0.48
ECM16Q04217 YSR3YKR053C 1215 nt12.05□□□□□ -0.48
ECM16Q04217 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt12.03□□□□□ -0.48
ECM16Q04217 SHH4YLR164W 507 nt12.03□□□□□ -0.48
ECM16Q04217 BIO5YNR056C 1686 nt12.03□□□□□ -0.48
ECM16Q04217 MSF1YPR047W 1410 nt12.03□□□□□ -0.48
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