Protein–RNA interactions for Protein: Q04007

SND1, SRP-independent targeting protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SND1Q04007 WSC2YNL283C 1512 nt11.32□□□□□ -0.6
SND1Q04007 CRR1YLR213C 1269 nt11.32□□□□□ -0.6
SND1Q04007 YFL054CYFL054C 1941 nt11.32□□□□□ -0.6
SND1Q04007 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.31□□□□□ -0.6
SND1Q04007 TAD3YLR316C 969 nt11.31□□□□□ -0.6
SND1Q04007 SPT8YLR055C 1809 nt11.3□□□□□ -0.6
SND1Q04007 STB1YNL309W 1263 nt11.28□□□□□ -0.6
SND1Q04007 SPC25YER018C 666 nt11.26□□□□□ -0.61
SND1Q04007 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.25□□□□□ -0.61
SND1Q04007 HEM12YDR047W 1089 nt11.25□□□□□ -0.61
SND1Q04007 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.25□□□□□ -0.61
SND1Q04007 GPI16YHR188C 1833 nt11.23□□□□□ -0.61
SND1Q04007 NVJ2YPR091C 2313 nt11.21□□□□□ -0.61
SND1Q04007 SNG1YGR197C 1644 nt11.21□□□□□ -0.61
SND1Q04007 CCT4YDL143W 1587 nt11.21□□□□□ -0.61
SND1Q04007 YDR094WYDR094W 336 nt11.2□□□□□ -0.62
SND1Q04007 UBX6YJL048C 1191 nt11.19□□□□□ -0.62
SND1Q04007 MIC10YCL057C-A 294 nt11.19□□□□□ -0.62
SND1Q04007 ANP1YEL036C 1503 nt11.19□□□□□ -0.62
SND1Q04007 FEN2YCR028C 1539 nt11.16□□□□□ -0.62
SND1Q04007 SWC5YBR231C 912 nt11.16□□□□□ -0.62
SND1Q04007 VPS60YDR486C 690 nt11.14□□□□□ -0.63
SND1Q04007 RPM1RPM1 483 nt11.14□□□□□ -0.63
SND1Q04007 SWE1YJL187C 2460 nt11.13□□□□□ -0.63
SND1Q04007 BDH1YAL060W 1149 nt11.11□□□□□ -0.63
SND1Q04007 YLR415CYLR415C 339 nt11.11□□□□□ -0.63
SND1Q04007 YJL225CYJL225C 5277 nt11.1□□□□□ -0.63
SND1Q04007 YFR018CYFR018C 1092 nt11.09□□□□□ -0.63
SND1Q04007 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.09□□□□□ -0.63
SND1Q04007 ALG3YBL082C 1377 nt11.07□□□□□ -0.64
SND1Q04007 BNA2YJR078W 1362 nt11.05□□□□□ -0.64
SND1Q04007 YIR016WYIR016W 798 nt11.05□□□□□ -0.64
SND1Q04007 YSP3YOR003W 1437 nt11.05□□□□□ -0.64
SND1Q04007 RAX1YOR301W 1308 nt11.05□□□□□ -0.64
SND1Q04007 FRE6YLL051C 2139 nt11.01□□□□□ -0.65
SND1Q04007 PEX25YPL112C 1185 nt11.01□□□□□ -0.65
SND1Q04007 RRT5YFR032C 870 nt11□□□□□ -0.65
SND1Q04007 YNL115CYNL115C 1935 nt10.99□□□□□ -0.65
SND1Q04007 YFL066CYFL066C 1179 nt10.98□□□□□ -0.65
SND1Q04007 PRE6YOL038W 765 nt10.96□□□□□ -0.65
SND1Q04007 MIC12YBR262C 321 nt10.95□□□□□ -0.66
SND1Q04007 PAU16YKL224C 372 nt10.93□□□□□ -0.66
SND1Q04007 TIM17YJL143W 477 nt10.9□□□□□ -0.66
SND1Q04007 HHO1YPL127C 777 nt10.9□□□□□ -0.66
SND1Q04007 CCA1YER168C 1641 nt10.88□□□□□ -0.67
SND1Q04007 VPS75YNL246W 795 nt10.88□□□□□ -0.67
SND1Q04007 XDJ1YLR090W 1380 nt10.88□□□□□ -0.67
SND1Q04007 YGR201CYGR201C 678 nt10.85□□□□□ -0.67
SND1Q04007 BOR1YNL275W 1731 nt10.84□□□□□ -0.67
SND1Q04007 SHM2YLR058C 1410 nt10.84□□□□□ -0.67
SND1Q04007 GDH3YAL062W 1374 nt10.83□□□□□ -0.68
SND1Q04007 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.83□□□□□ -0.68
SND1Q04007 HSP60YLR259C 1719 nt10.83□□□□□ -0.68
SND1Q04007 PAU7YAR020C 168 nt10.77□□□□□ -0.69
SND1Q04007 FUR4YBR021W 1902 nt10.77□□□□□ -0.69
SND1Q04007 AGP1YCL025C 1902 nt10.77□□□□□ -0.69
SND1Q04007 GLK1YCL040W 1503 nt10.76□□□□□ -0.69
SND1Q04007 AVT6YER119C 1347 nt10.76□□□□□ -0.69
SND1Q04007 NAT4YMR069W 858 nt10.73□□□□□ -0.69
SND1Q04007 GOR1YNL274C 1053 nt10.73□□□□□ -0.69
SND1Q04007 NIT1YIL164C 600 nt10.71□□□□□ -0.69
SND1Q04007 MIR1YJR077C 936 nt10.71□□□□□ -0.69
SND1Q04007 SGT2YOR007C 1041 nt10.71□□□□□ -0.69
SND1Q04007 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.71□□□□□ -0.7
SND1Q04007 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.71□□□□□ -0.7
SND1Q04007 THI74YDR438W 1113 nt10.68□□□□□ -0.7
SND1Q04007 DUS1YML080W 1272 nt10.67□□□□□ -0.7
SND1Q04007 DUT1YBR252W 444 nt10.64□□□□□ -0.71
SND1Q04007 MSF1YPR047W 1410 nt10.64□□□□□ -0.71
SND1Q04007 DAT1YML113W 747 nt10.63□□□□□ -0.71
SND1Q04007 SHB17YKR043C 816 nt10.62□□□□□ -0.71
SND1Q04007 YCR102CYCR102C 1107 nt10.59□□□□□ -0.71
SND1Q04007 UBA4YHR111W 1323 nt10.58□□□□□ -0.71
SND1Q04007 YCL074WYCL074W 927 nt10.58□□□□□ -0.72
SND1Q04007 UME6YDR207C 2511 nt10.58□□□□□ -0.72
SND1Q04007 YDR010CYDR010C 333 nt10.55□□□□□ -0.72
SND1Q04007 ALG12YNR030W 1656 nt10.53□□□□□ -0.72
SND1Q04007 PRP4YPR178W 1398 nt10.53□□□□□ -0.72
SND1Q04007 STR3YGL184C 1398 nt10.52□□□□□ -0.72
SND1Q04007 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.52□□□□□ -0.73
SND1Q04007 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.52□□□□□ -0.73
SND1Q04007 YSR3YKR053C 1215 nt10.52□□□□□ -0.73
SND1Q04007 AQY2YLL052C 450 nt10.51□□□□□ -0.73
SND1Q04007 DPS1YLL018C 1674 nt10.5□□□□□ -0.73
SND1Q04007 RET2YFR051C 1641 nt10.5□□□□□ -0.73
SND1Q04007 YKR005CYKR005C 1578 nt10.49□□□□□ -0.73
SND1Q04007 PHO89YBR296C 1725 nt10.48□□□□□ -0.73
SND1Q04007 YGL034CYGL034C 366 nt10.48□□□□□ -0.73
SND1Q04007 NBP35YGL091C 987 nt10.46□□□□□ -0.73
SND1Q04007 SNF1YDR477W 1902 nt10.46□□□□□ -0.74
SND1Q04007 YCR087WYCR087W 516 nt10.45□□□□□ -0.74
SND1Q04007 XYL2YLR070C 1071 nt10.43□□□□□ -0.74
SND1Q04007 SBA1YKL117W 651 nt10.41□□□□□ -0.74
SND1Q04007 AAC1YMR056C 930 nt10.41□□□□□ -0.74
SND1Q04007 TIR3YIL011W 810 nt10.4□□□□□ -0.74
SND1Q04007 SFA1YDL168W 1161 nt10.38□□□□□ -0.75
SND1Q04007 MRP20YDR405W 792 nt10.38□□□□□ -0.75
SND1Q04007 YGR259CYGR259C 441 nt10.38□□□□□ -0.75
SND1Q04007 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.37□□□□□ -0.75
SND1Q04007 MCH5YOR306C 1566 nt10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.4 ms