Protein–RNA interactions for Protein: Q03785

VHS1, Serine/threonine-protein kinase VHS1, yeastyeast

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1Q03785 DDR2YOL052C-A 186 nt10.68□□□□□ -0.7
VHS1Q03785 ATF2YGR177C 1608 nt10.66□□□□□ -0.7
VHS1Q03785 LYS4YDR234W 2082 nt10.66□□□□□ -0.7
VHS1Q03785 YFL067WYFL067W 528 nt10.66□□□□□ -0.7
VHS1Q03785 CRR1YLR213C 1269 nt10.65□□□□□ -0.7
VHS1Q03785 YPR064WYPR064W 420 nt10.65□□□□□ -0.7
VHS1Q03785 AQY1YPR192W 918 nt10.65□□□□□ -0.7
VHS1Q03785 YFL054CYFL054C 1941 nt10.63□□□□□ -0.71
VHS1Q03785 HEM12YDR047W 1089 nt10.61□□□□□ -0.71
VHS1Q03785 STB1YNL309W 1263 nt10.59□□□□□ -0.71
VHS1Q03785 AHT1YHR093W 549 nt10.58□□□□□ -0.72
VHS1Q03785 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.57□□□□□ -0.72
VHS1Q03785 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.57□□□□□ -0.72
VHS1Q03785 WSC2YNL283C 1512 nt10.57□□□□□ -0.72
VHS1Q03785 SNG1YGR197C 1644 nt10.56□□□□□ -0.72
VHS1Q03785 TAD3YLR316C 969 nt10.56□□□□□ -0.72
VHS1Q03785 MIC10YCL057C-A 294 nt10.56□□□□□ -0.72
VHS1Q03785 YFR018CYFR018C 1092 nt10.54□□□□□ -0.72
VHS1Q03785 PAU16YKL224C 372 nt10.54□□□□□ -0.72
VHS1Q03785 BOR1YNL275W 1731 nt10.53□□□□□ -0.72
VHS1Q03785 SPC25YER018C 666 nt10.53□□□□□ -0.72
VHS1Q03785 SBA1YKL117W 651 nt10.53□□□□□ -0.72
VHS1Q03785 GPI16YHR188C 1833 nt10.52□□□□□ -0.73
VHS1Q03785 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.51□□□□□ -0.73
VHS1Q03785 CCT4YDL143W 1587 nt10.5□□□□□ -0.73
VHS1Q03785 FEN2YCR028C 1539 nt10.49□□□□□ -0.73
VHS1Q03785 ANP1YEL036C 1503 nt10.49□□□□□ -0.73
VHS1Q03785 SWC5YBR231C 912 nt10.48□□□□□ -0.73
VHS1Q03785 VPS60YDR486C 690 nt10.47□□□□□ -0.73
VHS1Q03785 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.46□□□□□ -0.73
VHS1Q03785 SPT8YLR055C 1809 nt10.46□□□□□ -0.74
VHS1Q03785 RRT5YFR032C 870 nt10.45□□□□□ -0.74
VHS1Q03785 BNA2YJR078W 1362 nt10.44□□□□□ -0.74
VHS1Q03785 RAX1YOR301W 1308 nt10.44□□□□□ -0.74
VHS1Q03785 PRE6YOL038W 765 nt10.44□□□□□ -0.74
VHS1Q03785 YIR016WYIR016W 798 nt10.4□□□□□ -0.74
VHS1Q03785 ALG3YBL082C 1377 nt10.39□□□□□ -0.75
VHS1Q03785 YLR415CYLR415C 339 nt10.39□□□□□ -0.75
VHS1Q03785 BDH1YAL060W 1149 nt10.36□□□□□ -0.75
VHS1Q03785 MCH5YOR306C 1566 nt10.34□□□□□ -0.75
VHS1Q03785 SWE1YJL187C 2460 nt10.33□□□□□ -0.76
VHS1Q03785 HHO1YPL127C 777 nt10.3□□□□□ -0.76
VHS1Q03785 YSP3YOR003W 1437 nt10.28□□□□□ -0.76
VHS1Q03785 MIC12YBR262C 321 nt10.28□□□□□ -0.76
VHS1Q03785 YNL115CYNL115C 1935 nt10.25□□□□□ -0.77
VHS1Q03785 YFL066CYFL066C 1179 nt10.25□□□□□ -0.77
VHS1Q03785 CCA1YER168C 1641 nt10.25□□□□□ -0.77
VHS1Q03785 PEX25YPL112C 1185 nt10.24□□□□□ -0.77
VHS1Q03785 XDJ1YLR090W 1380 nt10.22□□□□□ -0.77
VHS1Q03785 TIM17YJL143W 477 nt10.2□□□□□ -0.78
VHS1Q03785 GDH3YAL062W 1374 nt10.2□□□□□ -0.78
VHS1Q03785 YGR201CYGR201C 678 nt10.19□□□□□ -0.78
VHS1Q03785 NAT4YMR069W 858 nt10.18□□□□□ -0.78
VHS1Q03785 SHM2YLR058C 1410 nt10.16□□□□□ -0.78
VHS1Q03785 HSP60YLR259C 1719 nt10.15□□□□□ -0.78
VHS1Q03785 AVT6YER119C 1347 nt10.14□□□□□ -0.79
VHS1Q03785 DUS1YML080W 1272 nt10.14□□□□□ -0.79
VHS1Q03785 GOR1YNL274C 1053 nt10.13□□□□□ -0.79
VHS1Q03785 AGP1YCL025C 1902 nt10.12□□□□□ -0.79
VHS1Q03785 VPS75YNL246W 795 nt10.11□□□□□ -0.79
VHS1Q03785 GLK1YCL040W 1503 nt10.1□□□□□ -0.79
VHS1Q03785 ALG12YNR030W 1656 nt10.09□□□□□ -0.79
VHS1Q03785 PAU7YAR020C 168 nt10.08□□□□□ -0.8
VHS1Q03785 MSF1YPR047W 1410 nt10.07□□□□□ -0.8
VHS1Q03785 DUT1YBR252W 444 nt10.06□□□□□ -0.8
VHS1Q03785 MIR1YJR077C 936 nt10.05□□□□□ -0.8
VHS1Q03785 SGT2YOR007C 1041 nt10.04□□□□□ -0.8
VHS1Q03785 THI74YDR438W 1113 nt10.03□□□□□ -0.8
VHS1Q03785 NIT1YIL164C 600 nt10.03□□□□□ -0.8
VHS1Q03785 FUR4YBR021W 1902 nt10.02□□□□□ -0.81
VHS1Q03785 YCL074WYCL074W 927 nt10□□□□□ -0.81
VHS1Q03785 YMR244WYMR244W 1068 nt9.99□□□□□ -0.81
VHS1Q03785 AQY2YLL052C 450 nt9.97□□□□□ -0.81
VHS1Q03785 STR3YGL184C 1398 nt9.94□□□□□ -0.82
VHS1Q03785 YCR102CYCR102C 1107 nt9.94□□□□□ -0.82
VHS1Q03785 DAT1YML113W 747 nt9.94□□□□□ -0.82
VHS1Q03785 SHB17YKR043C 816 nt9.9□□□□□ -0.82
VHS1Q03785 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.9□□□□□ -0.82
VHS1Q03785 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.9□□□□□ -0.82
VHS1Q03785 GLR1YPL091W 1452 nt9.86□□□□□ -0.83
VHS1Q03785 UBA4YHR111W 1323 nt9.85□□□□□ -0.83
VHS1Q03785 PRP4YPR178W 1398 nt9.85□□□□□ -0.83
VHS1Q03785 YDR010CYDR010C 333 nt9.84□□□□□ -0.83
VHS1Q03785 NBP35YGL091C 987 nt9.83□□□□□ -0.84
VHS1Q03785 YKR005CYKR005C 1578 nt9.83□□□□□ -0.84
VHS1Q03785 YGL034CYGL034C 366 nt9.82□□□□□ -0.84
VHS1Q03785 YSR3YKR053C 1215 nt9.82□□□□□ -0.84
VHS1Q03785 AAC1YMR056C 930 nt9.82□□□□□ -0.84
VHS1Q03785 NAR1YNL240C 1476 nt9.8□□□□□ -0.84
VHS1Q03785 PHO89YBR296C 1725 nt9.8□□□□□ -0.84
VHS1Q03785 RBG2YGR173W 1107 nt9.8□□□□□ -0.84
VHS1Q03785 YGR259CYGR259C 441 nt9.8□□□□□ -0.84
VHS1Q03785 BMT6YLR063W 1098 nt9.8□□□□□ -0.84
VHS1Q03785 RET2YFR051C 1641 nt9.78□□□□□ -0.84
VHS1Q03785 DPS1YLL018C 1674 nt9.77□□□□□ -0.85
VHS1Q03785 RTN2YDL204W 1182 nt9.74□□□□□ -0.85
VHS1Q03785 TIR3YIL011W 810 nt9.74□□□□□ -0.85
VHS1Q03785 XYL2YLR070C 1071 nt9.74□□□□□ -0.85
VHS1Q03785 NDI1YML120C 1542 nt9.73□□□□□ -0.85
VHS1Q03785 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.7 ms