Protein–RNA interactions for Protein: Q03691

ROT1, Protein ROT1, yeastyeast

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ROT1Q03691 RTF1YGL244W 1677 nt10.57□□□□□ -0.72
ROT1Q03691 CRR1YLR213C 1269 nt10.56□□□□□ -0.72
ROT1Q03691 BOP3YNL042W 1191 nt10.56□□□□□ -0.72
ROT1Q03691 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.55□□□□□ -0.72
ROT1Q03691 STB1YNL309W 1263 nt10.55□□□□□ -0.72
ROT1Q03691 LYS4YDR234W 2082 nt10.54□□□□□ -0.72
ROT1Q03691 SPC25YER018C 666 nt10.53□□□□□ -0.72
ROT1Q03691 YFL067WYFL067W 528 nt10.53□□□□□ -0.72
ROT1Q03691 DDR2YOL052C-A 186 nt10.53□□□□□ -0.72
ROT1Q03691 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.52□□□□□ -0.73
ROT1Q03691 PAU16YKL224C 372 nt10.51□□□□□ -0.73
ROT1Q03691 BDH1YAL060W 1149 nt10.51□□□□□ -0.73
ROT1Q03691 YGR139WYGR139W 339 nt10.5□□□□□ -0.73
ROT1Q03691 MIC10YCL057C-A 294 nt10.5□□□□□ -0.73
ROT1Q03691 CCT4YDL143W 1587 nt10.5□□□□□ -0.73
ROT1Q03691 GPI16YHR188C 1833 nt10.49□□□□□ -0.73
ROT1Q03691 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.48□□□□□ -0.73
ROT1Q03691 YFL066CYFL066C 1179 nt10.48□□□□□ -0.73
ROT1Q03691 SNG1YGR197C 1644 nt10.47□□□□□ -0.73
ROT1Q03691 VPS60YDR486C 690 nt10.47□□□□□ -0.73
ROT1Q03691 RRT5YFR032C 870 nt10.47□□□□□ -0.73
ROT1Q03691 YSP3YOR003W 1437 nt10.47□□□□□ -0.73
ROT1Q03691 ALG3YBL082C 1377 nt10.45□□□□□ -0.74
ROT1Q03691 YLR415CYLR415C 339 nt10.45□□□□□ -0.74
ROT1Q03691 NME1NME1 340 nt10.45□□□□□ -0.74
ROT1Q03691 PEX25YPL112C 1185 nt10.45□□□□□ -0.74
ROT1Q03691 ANP1YEL036C 1503 nt10.44□□□□□ -0.74
ROT1Q03691 HEM12YDR047W 1089 nt10.44□□□□□ -0.74
ROT1Q03691 PTK1YKL198C 1989 nt10.44□□□□□ -0.74
ROT1Q03691 SWC5YBR231C 912 nt10.43□□□□□ -0.74
ROT1Q03691 FEN2YCR028C 1539 nt10.43□□□□□ -0.74
ROT1Q03691 YNL115CYNL115C 1935 nt10.41□□□□□ -0.74
ROT1Q03691 YIR016WYIR016W 798 nt10.34□□□□□ -0.75
ROT1Q03691 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.31□□□□□ -0.76
ROT1Q03691 SPT8YLR055C 1809 nt10.28□□□□□ -0.76
ROT1Q03691 VPS75YNL246W 795 nt10.26□□□□□ -0.77
ROT1Q03691 YFL054CYFL054C 1941 nt10.26□□□□□ -0.77
ROT1Q03691 NAT4YMR069W 858 nt10.22□□□□□ -0.77
ROT1Q03691 MIC12YBR262C 321 nt10.21□□□□□ -0.77
ROT1Q03691 RAX1YOR301W 1308 nt10.21□□□□□ -0.78
ROT1Q03691 BNA2YJR078W 1362 nt10.21□□□□□ -0.78
ROT1Q03691 TIM17YJL143W 477 nt10.2□□□□□ -0.78
ROT1Q03691 MIR1YJR077C 936 nt10.2□□□□□ -0.78
ROT1Q03691 GLK1YCL040W 1503 nt10.19□□□□□ -0.78
ROT1Q03691 SBA1YKL117W 651 nt10.19□□□□□ -0.78
ROT1Q03691 XDJ1YLR090W 1380 nt10.18□□□□□ -0.78
ROT1Q03691 SHM2YLR058C 1410 nt10.17□□□□□ -0.78
ROT1Q03691 THI74YDR438W 1113 nt10.15□□□□□ -0.78
ROT1Q03691 MSF1YPR047W 1410 nt10.14□□□□□ -0.79
ROT1Q03691 NIT1YIL164C 600 nt10.1□□□□□ -0.79
ROT1Q03691 PAU7YAR020C 168 nt10.1□□□□□ -0.79
ROT1Q03691 HHO1YPL127C 777 nt10.1□□□□□ -0.79
ROT1Q03691 GDH3YAL062W 1374 nt10.1□□□□□ -0.79
ROT1Q03691 YGR201CYGR201C 678 nt10.08□□□□□ -0.8
ROT1Q03691 SGT2YOR007C 1041 nt10.08□□□□□ -0.8
ROT1Q03691 CCA1YER168C 1641 nt10.07□□□□□ -0.8
ROT1Q03691 SWE1YJL187C 2460 nt10.06□□□□□ -0.8
ROT1Q03691 DAT1YML113W 747 nt10.05□□□□□ -0.8
ROT1Q03691 AGP1YCL025C 1902 nt10.05□□□□□ -0.8
ROT1Q03691 SHB17YKR043C 816 nt10.03□□□□□ -0.8
ROT1Q03691 DUT1YBR252W 444 nt10.03□□□□□ -0.8
ROT1Q03691 AVT6YER119C 1347 nt10.02□□□□□ -0.81
ROT1Q03691 UBA4YHR111W 1323 nt10.02□□□□□ -0.81
ROT1Q03691 YDR010CYDR010C 333 nt10.01□□□□□ -0.81
ROT1Q03691 YSR3YKR053C 1215 nt9.96□□□□□ -0.82
ROT1Q03691 YGL034CYGL034C 366 nt9.95□□□□□ -0.82
ROT1Q03691 GOR1YNL274C 1053 nt9.93□□□□□ -0.82
ROT1Q03691 XYL2YLR070C 1071 nt9.91□□□□□ -0.82
ROT1Q03691 RET2YFR051C 1641 nt9.91□□□□□ -0.82
ROT1Q03691 PHO89YBR296C 1725 nt9.88□□□□□ -0.83
ROT1Q03691 YCR102CYCR102C 1107 nt9.85□□□□□ -0.83
ROT1Q03691 YCR087WYCR087W 516 nt9.84□□□□□ -0.83
ROT1Q03691 DUS1YML080W 1272 nt9.84□□□□□ -0.83
ROT1Q03691 RBG1YAL036C 1110 nt9.83□□□□□ -0.84
ROT1Q03691 YMR244WYMR244W 1068 nt9.83□□□□□ -0.84
ROT1Q03691 SFA1YDL168W 1161 nt9.82□□□□□ -0.84
ROT1Q03691 NDI1YML120C 1542 nt9.82□□□□□ -0.84
ROT1Q03691 GLR1YPL091W 1452 nt9.81□□□□□ -0.84
ROT1Q03691 AIM45YPR004C 1035 nt9.8□□□□□ -0.84
ROT1Q03691 NBP35YGL091C 987 nt9.79□□□□□ -0.84
ROT1Q03691 SHH4YLR164W 507 nt9.79□□□□□ -0.84
ROT1Q03691 COQ2YNR041C 1119 nt9.79□□□□□ -0.84
ROT1Q03691 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.79□□□□□ -0.84
ROT1Q03691 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.79□□□□□ -0.84
ROT1Q03691 STR3YGL184C 1398 nt9.78□□□□□ -0.84
ROT1Q03691 MRP20YDR405W 792 nt9.76□□□□□ -0.85
ROT1Q03691 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9.76□□□□□ -0.85
ROT1Q03691 AQY2YLL052C 450 nt9.76□□□□□ -0.85
ROT1Q03691 YCL074WYCL074W 927 nt9.74□□□□□ -0.85
ROT1Q03691 YJL225CYJL225C 5277 nt9.72□□□□□ -0.85
ROT1Q03691 FUR4YBR021W 1902 nt9.72□□□□□ -0.85
ROT1Q03691 TIR3YIL011W 810 nt9.7□□□□□ -0.86
ROT1Q03691 PAC11YDR488C 1602 nt9.69□□□□□ -0.86
ROT1Q03691 CSM2YIL132C 642 nt9.69□□□□□ -0.86
ROT1Q03691 TOM6YOR045W 186 nt9.66□□□□□ -0.86
ROT1Q03691 RBG2YGR173W 1107 nt9.65□□□□□ -0.86
ROT1Q03691 RPL4BYDR012W 1089 nt9.64□□□□□ -0.87
ROT1Q03691 POM34YLR018C 900 nt9.64□□□□□ -0.87
ROT1Q03691 RPL4AYBR031W 1089 nt9.64□□□□□ -0.87
ROT1Q03691 PRO1YDR300C 1287 nt9.62□□□□□ -0.87
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