Protein–RNA interactions for Protein: Q02979

GDE1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GDE1, yeastyeast

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Length 1,223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GDE1Q02979 AHT1YHR093W 549 nt12.46□□□□□ -0.41
GDE1Q02979 DDR2YOL052C-A 186 nt12.46□□□□□ -0.41
GDE1Q02979 LYS4YDR234W 2082 nt12.46□□□□□ -0.42
GDE1Q02979 PTK1YKL198C 1989 nt12.45□□□□□ -0.42
GDE1Q02979 YDR094WYDR094W 336 nt12.43□□□□□ -0.42
GDE1Q02979 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt12.42□□□□□ -0.42
GDE1Q02979 TAD3YLR316C 969 nt12.42□□□□□ -0.42
GDE1Q02979 STB1YNL309W 1263 nt12.41□□□□□ -0.42
GDE1Q02979 HEM12YDR047W 1089 nt12.38□□□□□ -0.43
GDE1Q02979 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt12.38□□□□□ -0.43
GDE1Q02979 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt12.37□□□□□ -0.43
GDE1Q02979 SPC25YER018C 666 nt12.37□□□□□ -0.43
GDE1Q02979 MIC10YCL057C-A 294 nt12.35□□□□□ -0.43
GDE1Q02979 SNG1YGR197C 1644 nt12.35□□□□□ -0.43
GDE1Q02979 GPI16YHR188C 1833 nt12.34□□□□□ -0.43
GDE1Q02979 CCT4YDL143W 1587 nt12.32□□□□□ -0.44
GDE1Q02979 ANP1YEL036C 1503 nt12.31□□□□□ -0.44
GDE1Q02979 YFL054CYFL054C 1941 nt12.31□□□□□ -0.44
GDE1Q02979 VPS60YDR486C 690 nt12.28□□□□□ -0.44
GDE1Q02979 SWC5YBR231C 912 nt12.28□□□□□ -0.44
GDE1Q02979 FEN2YCR028C 1539 nt12.27□□□□□ -0.44
GDE1Q02979 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt12.23□□□□□ -0.45
GDE1Q02979 BDH1YAL060W 1149 nt12.22□□□□□ -0.45
GDE1Q02979 ALG3YBL082C 1377 nt12.21□□□□□ -0.45
GDE1Q02979 YLR415CYLR415C 339 nt12.21□□□□□ -0.45
GDE1Q02979 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt12.2□□□□□ -0.46
GDE1Q02979 YFR018CYFR018C 1092 nt12.17□□□□□ -0.46
GDE1Q02979 YIR016WYIR016W 798 nt12.16□□□□□ -0.46
GDE1Q02979 BNA2YJR078W 1362 nt12.16□□□□□ -0.46
GDE1Q02979 RAX1YOR301W 1308 nt12.15□□□□□ -0.46
GDE1Q02979 YSP3YOR003W 1437 nt12.15□□□□□ -0.46
GDE1Q02979 PRE6YOL038W 765 nt12.15□□□□□ -0.46
GDE1Q02979 SPT8YLR055C 1809 nt12.14□□□□□ -0.47
GDE1Q02979 PAU16YKL224C 372 nt12.14□□□□□ -0.47
GDE1Q02979 PEX25YPL112C 1185 nt12.11□□□□□ -0.47
GDE1Q02979 YFL066CYFL066C 1179 nt12.09□□□□□ -0.47
GDE1Q02979 YNL115CYNL115C 1935 nt12.09□□□□□ -0.47
GDE1Q02979 RRT5YFR032C 870 nt12.07□□□□□ -0.48
GDE1Q02979 MIC12YBR262C 321 nt12.06□□□□□ -0.48
GDE1Q02979 SWE1YJL187C 2460 nt12.01□□□□□ -0.49
GDE1Q02979 HHO1YPL127C 777 nt11.99□□□□□ -0.49
GDE1Q02979 XDJ1YLR090W 1380 nt11.98□□□□□ -0.49
GDE1Q02979 TIM17YJL143W 477 nt11.97□□□□□ -0.49
GDE1Q02979 CCA1YER168C 1641 nt11.95□□□□□ -0.5
GDE1Q02979 VPS75YNL246W 795 nt11.94□□□□□ -0.5
GDE1Q02979 YGR201CYGR201C 678 nt11.93□□□□□ -0.5
GDE1Q02979 SHM2YLR058C 1410 nt11.93□□□□□ -0.5
GDE1Q02979 RPM1RPM1 483 nt11.91□□□□□ -0.5
GDE1Q02979 GDH3YAL062W 1374 nt11.91□□□□□ -0.5
GDE1Q02979 YJL225CYJL225C 5277 nt11.88□□□□□ -0.51
GDE1Q02979 NME1NME1 340 nt11.86□□□□□ -0.51
GDE1Q02979 SBA1YKL117W 651 nt11.85□□□□□ -0.51
GDE1Q02979 AVT6YER119C 1347 nt11.85□□□□□ -0.51
GDE1Q02979 AGP1YCL025C 1902 nt11.84□□□□□ -0.51
GDE1Q02979 PAU7YAR020C 168 nt11.82□□□□□ -0.52
GDE1Q02979 GLK1YCL040W 1503 nt11.81□□□□□ -0.52
GDE1Q02979 NIT1YIL164C 600 nt11.8□□□□□ -0.52
GDE1Q02979 GOR1YNL274C 1053 nt11.8□□□□□ -0.52
GDE1Q02979 SGT2YOR007C 1041 nt11.8□□□□□ -0.52
GDE1Q02979 NAT4YMR069W 858 nt11.79□□□□□ -0.52
GDE1Q02979 MIR1YJR077C 936 nt11.78□□□□□ -0.52
GDE1Q02979 DUS1YML080W 1272 nt11.76□□□□□ -0.53
GDE1Q02979 DUT1YBR252W 444 nt11.75□□□□□ -0.53
GDE1Q02979 UME6YDR207C 2511 nt11.74□□□□□ -0.53
GDE1Q02979 THI74YDR438W 1113 nt11.73□□□□□ -0.53
GDE1Q02979 DAT1YML113W 747 nt11.69□□□□□ -0.54
GDE1Q02979 MSF1YPR047W 1410 nt11.69□□□□□ -0.54
GDE1Q02979 SHB17YKR043C 816 nt11.68□□□□□ -0.54
GDE1Q02979 FUR4YBR021W 1902 nt11.64□□□□□ -0.55
GDE1Q02979 YCL074WYCL074W 927 nt11.63□□□□□ -0.55
GDE1Q02979 YCR102CYCR102C 1107 nt11.63□□□□□ -0.55
GDE1Q02979 UBA4YHR111W 1323 nt11.62□□□□□ -0.55
GDE1Q02979 YDR010CYDR010C 333 nt11.61□□□□□ -0.55
GDE1Q02979 STR3YGL184C 1398 nt11.59□□□□□ -0.55
GDE1Q02979 AQY2YLL052C 450 nt11.59□□□□□ -0.55
GDE1Q02979 YSR3YKR053C 1215 nt11.57□□□□□ -0.56
GDE1Q02979 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.56□□□□□ -0.56
GDE1Q02979 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.56□□□□□ -0.56
GDE1Q02979 RET2YFR051C 1641 nt11.53□□□□□ -0.56
GDE1Q02979 PHO89YBR296C 1725 nt11.53□□□□□ -0.56
GDE1Q02979 YGL034CYGL034C 366 nt11.52□□□□□ -0.57
GDE1Q02979 NBP35YGL091C 987 nt11.51□□□□□ -0.57
GDE1Q02979 XYL2YLR070C 1071 nt11.48□□□□□ -0.57
GDE1Q02979 HSP60YLR259C 1719 nt11.48□□□□□ -0.57
GDE1Q02979 YCR087WYCR087W 516 nt11.45□□□□□ -0.58
GDE1Q02979 SFA1YDL168W 1161 nt11.43□□□□□ -0.58
GDE1Q02979 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt11.43□□□□□ -0.58
GDE1Q02979 TIR3YIL011W 810 nt11.43□□□□□ -0.58
GDE1Q02979 BOR1YNL275W 1731 nt11.42□□□□□ -0.58
GDE1Q02979 SHH4YLR164W 507 nt11.41□□□□□ -0.58
GDE1Q02979 YKR005CYKR005C 1578 nt11.41□□□□□ -0.58
GDE1Q02979 MRP20YDR405W 792 nt11.4□□□□□ -0.58
GDE1Q02979 PRP4YPR178W 1398 nt11.4□□□□□ -0.59
GDE1Q02979 RTN2YDL204W 1182 nt11.38□□□□□ -0.59
GDE1Q02979 RBG1YAL036C 1110 nt11.38□□□□□ -0.59
GDE1Q02979 COQ2YNR041C 1119 nt11.38□□□□□ -0.59
GDE1Q02979 AIM45YPR004C 1035 nt11.38□□□□□ -0.59
GDE1Q02979 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.38□□□□□ -0.59
GDE1Q02979 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.38□□□□□ -0.59
GDE1Q02979 YGR259CYGR259C 441 nt11.37□□□□□ -0.59
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