Protein–RNA interactions for Protein: Q01329

PTA1, Pre-tRNA-processing protein PTA1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PTA1Q01329 TRM5YHR070W 1500 nt12.2□□□□□ -0.46
PTA1Q01329 BDH1YAL060W 1149 nt12.14□□□□□ -0.47
PTA1Q01329 SBA1YKL117W 651 nt12.13□□□□□ -0.47
PTA1Q01329 STB1YNL309W 1263 nt12.13□□□□□ -0.47
PTA1Q01329 PEX25YPL112C 1185 nt12.13□□□□□ -0.47
PTA1Q01329 ATF2YGR177C 1608 nt12.11□□□□□ -0.47
PTA1Q01329 NVJ2YPR091C 2313 nt12.1□□□□□ -0.47
PTA1Q01329 DDR2YOL052C-A 186 nt12.1□□□□□ -0.47
PTA1Q01329 YSP3YOR003W 1437 nt12.1□□□□□ -0.47
PTA1Q01329 CCT4YDL143W 1587 nt12.09□□□□□ -0.47
PTA1Q01329 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt12.09□□□□□ -0.47
PTA1Q01329 SPC25YER018C 666 nt12.09□□□□□ -0.47
PTA1Q01329 YLR415CYLR415C 339 nt12.09□□□□□ -0.47
PTA1Q01329 YJL225CYJL225C 5277 nt12.09□□□□□ -0.47
PTA1Q01329 YNL115CYNL115C 1935 nt12.09□□□□□ -0.47
PTA1Q01329 ERF2YLR246W 1080 nt12.07□□□□□ -0.48
PTA1Q01329 YFL067WYFL067W 528 nt12.05□□□□□ -0.48
PTA1Q01329 PIB2YGL023C 1908 nt12.05□□□□□ -0.48
PTA1Q01329 GPI16YHR188C 1833 nt12.04□□□□□ -0.48
PTA1Q01329 SWC5YBR231C 912 nt12.04□□□□□ -0.48
PTA1Q01329 VPS60YDR486C 690 nt12.03□□□□□ -0.48
PTA1Q01329 CRR1YLR213C 1269 nt12.01□□□□□ -0.49
PTA1Q01329 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt12□□□□□ -0.49
PTA1Q01329 NAT4YMR069W 858 nt11.99□□□□□ -0.49
PTA1Q01329 ALG3YBL082C 1377 nt11.97□□□□□ -0.49
PTA1Q01329 FEN2YCR028C 1539 nt11.96□□□□□ -0.49
PTA1Q01329 NCP1YHR042W 2076 nt11.96□□□□□ -0.49
PTA1Q01329 GLK1YCL040W 1503 nt11.96□□□□□ -0.5
PTA1Q01329 ANP1YEL036C 1503 nt11.94□□□□□ -0.5
PTA1Q01329 RTF1YGL244W 1677 nt11.94□□□□□ -0.5
PTA1Q01329 SNG1YGR197C 1644 nt11.93□□□□□ -0.5
PTA1Q01329 HEM12YDR047W 1089 nt11.92□□□□□ -0.5
PTA1Q01329 MIC10YCL057C-A 294 nt11.92□□□□□ -0.5
PTA1Q01329 LYS4YDR234W 2082 nt11.9□□□□□ -0.51
PTA1Q01329 VPS75YNL246W 795 nt11.88□□□□□ -0.51
PTA1Q01329 MSF1YPR047W 1410 nt11.87□□□□□ -0.51
PTA1Q01329 MIR1YJR077C 936 nt11.87□□□□□ -0.51
PTA1Q01329 SPT8YLR055C 1809 nt11.87□□□□□ -0.51
PTA1Q01329 THI74YDR438W 1113 nt11.86□□□□□ -0.51
PTA1Q01329 BOP3YNL042W 1191 nt11.86□□□□□ -0.51
PTA1Q01329 YIR016WYIR016W 798 nt11.85□□□□□ -0.51
PTA1Q01329 PTK1YKL198C 1989 nt11.78□□□□□ -0.52
PTA1Q01329 PAU7YAR020C 168 nt11.78□□□□□ -0.52
PTA1Q01329 TIM17YJL143W 477 nt11.76□□□□□ -0.53
PTA1Q01329 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.74□□□□□ -0.53
PTA1Q01329 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.74□□□□□ -0.53
PTA1Q01329 DAT1YML113W 747 nt11.73□□□□□ -0.53
PTA1Q01329 SHM2YLR058C 1410 nt11.7□□□□□ -0.54
PTA1Q01329 BNA2YJR078W 1362 nt11.69□□□□□ -0.54
PTA1Q01329 XDJ1YLR090W 1380 nt11.67□□□□□ -0.54
PTA1Q01329 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.67□□□□□ -0.54
PTA1Q01329 UBA4YHR111W 1323 nt11.66□□□□□ -0.54
PTA1Q01329 SHB17YKR043C 816 nt11.65□□□□□ -0.54
PTA1Q01329 YGL034CYGL034C 366 nt11.64□□□□□ -0.55
PTA1Q01329 YMR244WYMR244W 1068 nt11.61□□□□□ -0.55
PTA1Q01329 SGT2YOR007C 1041 nt11.61□□□□□ -0.55
PTA1Q01329 MIC12YBR262C 321 nt11.61□□□□□ -0.55
PTA1Q01329 RAX1YOR301W 1308 nt11.6□□□□□ -0.55
PTA1Q01329 GDH3YAL062W 1374 nt11.6□□□□□ -0.55
PTA1Q01329 YSR3YKR053C 1215 nt11.6□□□□□ -0.55
PTA1Q01329 NIT1YIL164C 600 nt11.59□□□□□ -0.55
PTA1Q01329 YDR010CYDR010C 333 nt11.56□□□□□ -0.56
PTA1Q01329 XYL2YLR070C 1071 nt11.56□□□□□ -0.56
PTA1Q01329 HHO1YPL127C 777 nt11.56□□□□□ -0.56
PTA1Q01329 GLR1YPL091W 1452 nt11.56□□□□□ -0.56
PTA1Q01329 NDI1YML120C 1542 nt11.52□□□□□ -0.57
PTA1Q01329 RBG1YAL036C 1110 nt11.52□□□□□ -0.57
PTA1Q01329 YFL054CYFL054C 1941 nt11.51□□□□□ -0.57
PTA1Q01329 YGR201CYGR201C 678 nt11.5□□□□□ -0.57
PTA1Q01329 PHO89YBR296C 1725 nt11.49□□□□□ -0.57
PTA1Q01329 AVT6YER119C 1347 nt11.48□□□□□ -0.57
PTA1Q01329 RET2YFR051C 1641 nt11.46□□□□□ -0.57
PTA1Q01329 YCR087WYCR087W 516 nt11.42□□□□□ -0.58
PTA1Q01329 GOR1YNL274C 1053 nt11.4□□□□□ -0.58
PTA1Q01329 RBG2YGR173W 1107 nt11.39□□□□□ -0.59
PTA1Q01329 AIM45YPR004C 1035 nt11.39□□□□□ -0.59
PTA1Q01329 DUT1YBR252W 444 nt11.38□□□□□ -0.59
PTA1Q01329 CCA1YER168C 1641 nt11.35□□□□□ -0.59
PTA1Q01329 AGP1YCL025C 1902 nt11.35□□□□□ -0.59
PTA1Q01329 MRP20YDR405W 792 nt11.35□□□□□ -0.59
PTA1Q01329 BOR1YNL275W 1731 nt11.33□□□□□ -0.6
PTA1Q01329 COQ2YNR041C 1119 nt11.33□□□□□ -0.6
PTA1Q01329 YCR102CYCR102C 1107 nt11.32□□□□□ -0.6
PTA1Q01329 SFA1YDL168W 1161 nt11.3□□□□□ -0.6
PTA1Q01329 UME6YDR207C 2511 nt11.29□□□□□ -0.6
PTA1Q01329 SWE1YJL187C 2460 nt11.26□□□□□ -0.61
PTA1Q01329 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt11.26□□□□□ -0.61
PTA1Q01329 YMR226CYMR226C 804 nt11.23□□□□□ -0.61
PTA1Q01329 DUS1YML080W 1272 nt11.19□□□□□ -0.62
PTA1Q01329 SHH4YLR164W 507 nt11.18□□□□□ -0.62
PTA1Q01329 RPL4BYDR012W 1089 nt11.17□□□□□ -0.62
PTA1Q01329 NBP35YGL091C 987 nt11.17□□□□□ -0.62
PTA1Q01329 YLR111WYLR111W 333 nt11.17□□□□□ -0.62
PTA1Q01329 RPL4AYBR031W 1089 nt11.17□□□□□ -0.62
PTA1Q01329 TIR3YIL011W 810 nt11.13□□□□□ -0.63
PTA1Q01329 AQY2YLL052C 450 nt11.13□□□□□ -0.63
PTA1Q01329 SDH5YOL071W 489 nt11.13□□□□□ -0.63
PTA1Q01329 CLB6YGR109C 1143 nt11.12□□□□□ -0.63
PTA1Q01329 TOM6YOR045W 186 nt11.12□□□□□ -0.63
PTA1Q01329 RPM1RPM1 483 nt11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.3 ms