Protein–RNA interactions for Protein: Q00362

CDC55, Protein phosphatase PP2A regulatory subunit B, yeastyeast

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Length 526 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CDC55Q00362 WSC2YNL283C 1512 nt11.4□□□□□ -0.59
CDC55Q00362 AHT1YHR093W 549 nt11.39□□□□□ -0.59
CDC55Q00362 YPR064WYPR064W 420 nt11.38□□□□□ -0.59
CDC55Q00362 YFL054CYFL054C 1941 nt11.38□□□□□ -0.59
CDC55Q00362 HEM12YDR047W 1089 nt11.36□□□□□ -0.59
CDC55Q00362 MIC10YCL057C-A 294 nt11.36□□□□□ -0.59
CDC55Q00362 STB1YNL309W 1263 nt11.35□□□□□ -0.59
CDC55Q00362 SNG1YGR197C 1644 nt11.35□□□□□ -0.59
CDC55Q00362 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.34□□□□□ -0.59
CDC55Q00362 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.32□□□□□ -0.6
CDC55Q00362 SPC25YER018C 666 nt11.32□□□□□ -0.6
CDC55Q00362 TAD3YLR316C 969 nt11.32□□□□□ -0.6
CDC55Q00362 ANP1YEL036C 1503 nt11.29□□□□□ -0.6
CDC55Q00362 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.28□□□□□ -0.6
CDC55Q00362 GPI16YHR188C 1833 nt11.27□□□□□ -0.61
CDC55Q00362 CCT4YDL143W 1587 nt11.27□□□□□ -0.61
CDC55Q00362 CSM2YIL132C 642 nt11.26□□□□□ -0.61
CDC55Q00362 FEN2YCR028C 1539 nt11.25□□□□□ -0.61
CDC55Q00362 SPT8YLR055C 1809 nt11.24□□□□□ -0.61
CDC55Q00362 VPS60YDR486C 690 nt11.24□□□□□ -0.61
CDC55Q00362 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.24□□□□□ -0.61
CDC55Q00362 SWC5YBR231C 912 nt11.19□□□□□ -0.62
CDC55Q00362 ALG3YBL082C 1377 nt11.18□□□□□ -0.62
CDC55Q00362 RAX1YOR301W 1308 nt11.17□□□□□ -0.62
CDC55Q00362 YIR016WYIR016W 798 nt11.16□□□□□ -0.62
CDC55Q00362 BDH1YAL060W 1149 nt11.16□□□□□ -0.62
CDC55Q00362 BNA2YJR078W 1362 nt11.13□□□□□ -0.63
CDC55Q00362 PAC11YDR488C 1602 nt11.13□□□□□ -0.63
CDC55Q00362 YLR415CYLR415C 339 nt11.12□□□□□ -0.63
CDC55Q00362 SWE1YJL187C 2460 nt11.11□□□□□ -0.63
CDC55Q00362 UBX6YJL048C 1191 nt11.1□□□□□ -0.63
CDC55Q00362 YDR094WYDR094W 336 nt11.09□□□□□ -0.63
CDC55Q00362 YSP3YOR003W 1437 nt11.09□□□□□ -0.63
CDC55Q00362 MIC12YBR262C 321 nt11.08□□□□□ -0.64
CDC55Q00362 MET8YBR213W 825 nt11.06□□□□□ -0.64
CDC55Q00362 YFR018CYFR018C 1092 nt11.03□□□□□ -0.64
CDC55Q00362 CCA1YER168C 1641 nt11.02□□□□□ -0.64
CDC55Q00362 YFL066CYFL066C 1179 nt11.02□□□□□ -0.65
CDC55Q00362 YNL115CYNL115C 1935 nt11.01□□□□□ -0.65
CDC55Q00362 PEX25YPL112C 1185 nt11.01□□□□□ -0.65
CDC55Q00362 HHO1YPL127C 777 nt11.01□□□□□ -0.65
CDC55Q00362 PRE6YOL038W 765 nt10.99□□□□□ -0.65
CDC55Q00362 XDJ1YLR090W 1380 nt10.96□□□□□ -0.65
CDC55Q00362 CLB6YGR109C 1143 nt10.96□□□□□ -0.65
CDC55Q00362 YGR201CYGR201C 678 nt10.92□□□□□ -0.66
CDC55Q00362 AGP1YCL025C 1902 nt10.92□□□□□ -0.66
CDC55Q00362 TIM17YJL143W 477 nt10.91□□□□□ -0.66
CDC55Q00362 SHM2YLR058C 1410 nt10.91□□□□□ -0.66
CDC55Q00362 GDH3YAL062W 1374 nt10.9□□□□□ -0.66
CDC55Q00362 RRT5YFR032C 870 nt10.9□□□□□ -0.66
CDC55Q00362 PAU16YKL224C 372 nt10.88□□□□□ -0.67
CDC55Q00362 VPS75YNL246W 795 nt10.86□□□□□ -0.67
CDC55Q00362 AVT6YER119C 1347 nt10.84□□□□□ -0.67
CDC55Q00362 PAU21YOR394W 495 nt10.84□□□□□ -0.67
CDC55Q00362 PAU22YPL282C 495 nt10.84□□□□□ -0.67
CDC55Q00362 DUT1YBR252W 444 nt10.84□□□□□ -0.67
CDC55Q00362 NIT1YIL164C 600 nt10.81□□□□□ -0.68
CDC55Q00362 DUS1YML080W 1272 nt10.8□□□□□ -0.68
CDC55Q00362 GOR1YNL274C 1053 nt10.8□□□□□ -0.68
CDC55Q00362 YJL225CYJL225C 5277 nt10.79□□□□□ -0.68
CDC55Q00362 SGT2YOR007C 1041 nt10.78□□□□□ -0.68
CDC55Q00362 FUR4YBR021W 1902 nt10.77□□□□□ -0.69
CDC55Q00362 ARO7YPR060C 771 nt10.74□□□□□ -0.69
CDC55Q00362 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.73□□□□□ -0.69
CDC55Q00362 PAU7YAR020C 168 nt10.72□□□□□ -0.69
CDC55Q00362 YCL074WYCL074W 927 nt10.71□□□□□ -0.69
CDC55Q00362 MIR1YJR077C 936 nt10.7□□□□□ -0.7
CDC55Q00362 DAT1YML113W 747 nt10.7□□□□□ -0.7
CDC55Q00362 STR3YGL184C 1398 nt10.68□□□□□ -0.7
CDC55Q00362 GLK1YCL040W 1503 nt10.68□□□□□ -0.7
CDC55Q00362 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.67□□□□□ -0.7
CDC55Q00362 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.67□□□□□ -0.7
CDC55Q00362 HSP60YLR259C 1719 nt10.67□□□□□ -0.7
CDC55Q00362 YCR102CYCR102C 1107 nt10.64□□□□□ -0.71
CDC55Q00362 THI74YDR438W 1113 nt10.64□□□□□ -0.71
CDC55Q00362 AQY2YLL052C 450 nt10.64□□□□□ -0.71
CDC55Q00362 NAT4YMR069W 858 nt10.64□□□□□ -0.71
CDC55Q00362 SHB17YKR043C 816 nt10.63□□□□□ -0.71
CDC55Q00362 BOR1YNL275W 1731 nt10.62□□□□□ -0.71
CDC55Q00362 YDR010CYDR010C 333 nt10.6□□□□□ -0.71
CDC55Q00362 MSF1YPR047W 1410 nt10.58□□□□□ -0.72
CDC55Q00362 NBP35YGL091C 987 nt10.58□□□□□ -0.72
CDC55Q00362 YJR154WYJR154W 1041 nt10.58□□□□□ -0.72
CDC55Q00362 UBA4YHR111W 1323 nt10.58□□□□□ -0.72
CDC55Q00362 PRP4YPR178W 1398 nt10.54□□□□□ -0.72
CDC55Q00362 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.54□□□□□ -0.72
CDC55Q00362 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.54□□□□□ -0.72
CDC55Q00362 YKR005CYKR005C 1578 nt10.53□□□□□ -0.72
CDC55Q00362 YSR3YKR053C 1215 nt10.51□□□□□ -0.73
CDC55Q00362 Q0010Q0010 387 nt10.51□□□□□ -0.73
CDC55Q00362 RET2YFR051C 1641 nt10.51□□□□□ -0.73
CDC55Q00362 FRE6YLL051C 2139 nt10.49□□□□□ -0.73
CDC55Q00362 YGR259CYGR259C 441 nt10.49□□□□□ -0.73
CDC55Q00362 PHO89YBR296C 1725 nt10.49□□□□□ -0.73
CDC55Q00362 DPS1YLL018C 1674 nt10.47□□□□□ -0.73
CDC55Q00362 SHH4YLR164W 507 nt10.47□□□□□ -0.73
CDC55Q00362 NVJ2YPR091C 2313 nt10.46□□□□□ -0.73
CDC55Q00362 SFA1YDL168W 1161 nt10.46□□□□□ -0.73
CDC55Q00362 YGL034CYGL034C 366 nt10.45□□□□□ -0.74
CDC55Q00362 TIR3YIL011W 810 nt10.45□□□□□ -0.74
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