Protein–RNA interactions for Protein: P53394

YPR003C, Putative sulfate transporter YPR003C, yeastyeast

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPR003CP53394 MRPL8YJL063C 717 nt11.15□□□□□ -0.62
YPR003CP53394 SPT8YLR055C 1809 nt11.14□□□□□ -0.63
YPR003CP53394 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.14□□□□□ -0.63
YPR003CP53394 HUA1YGR268C 597 nt11.14□□□□□ -0.63
YPR003CP53394 STB1YNL309W 1263 nt11.14□□□□□ -0.63
YPR003CP53394 YPR064WYPR064W 420 nt11.14□□□□□ -0.63
YPR003CP53394 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.13□□□□□ -0.63
YPR003CP53394 WSC2YNL283C 1512 nt11.13□□□□□ -0.63
YPR003CP53394 AHT1YHR093W 549 nt11.11□□□□□ -0.63
YPR003CP53394 ADO1YJR105W 1023 nt11.11□□□□□ -0.63
YPR003CP53394 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.1□□□□□ -0.63
YPR003CP53394 SPC25YER018C 666 nt11.08□□□□□ -0.64
YPR003CP53394 ANP1YEL036C 1503 nt11.07□□□□□ -0.64
YPR003CP53394 GPI16YHR188C 1833 nt11.07□□□□□ -0.64
YPR003CP53394 TAD3YLR316C 969 nt11.06□□□□□ -0.64
YPR003CP53394 FEN2YCR028C 1539 nt11.04□□□□□ -0.64
YPR003CP53394 CCT4YDL143W 1587 nt11.04□□□□□ -0.64
YPR003CP53394 VPS60YDR486C 690 nt11.04□□□□□ -0.64
YPR003CP53394 RAX1YOR301W 1308 nt11.03□□□□□ -0.64
YPR003CP53394 SWC5YBR231C 912 nt11.02□□□□□ -0.65
YPR003CP53394 SWE1YJL187C 2460 nt11.01□□□□□ -0.65
YPR003CP53394 BNA2YJR078W 1362 nt11.01□□□□□ -0.65
YPR003CP53394 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11□□□□□ -0.65
YPR003CP53394 ALG3YBL082C 1377 nt10.97□□□□□ -0.65
YPR003CP53394 YIR016WYIR016W 798 nt10.95□□□□□ -0.66
YPR003CP53394 NVJ2YPR091C 2313 nt10.94□□□□□ -0.66
YPR003CP53394 CCA1YER168C 1641 nt10.9□□□□□ -0.66
YPR003CP53394 BDH1YAL060W 1149 nt10.89□□□□□ -0.67
YPR003CP53394 YLR415CYLR415C 339 nt10.89□□□□□ -0.67
YPR003CP53394 MIC12YBR262C 321 nt10.88□□□□□ -0.67
YPR003CP53394 HHO1YPL127C 777 nt10.85□□□□□ -0.67
YPR003CP53394 YSP3YOR003W 1437 nt10.8□□□□□ -0.68
YPR003CP53394 XDJ1YLR090W 1380 nt10.77□□□□□ -0.68
YPR003CP53394 YNL115CYNL115C 1935 nt10.76□□□□□ -0.69
YPR003CP53394 AGP1YCL025C 1902 nt10.76□□□□□ -0.69
YPR003CP53394 YGR201CYGR201C 678 nt10.75□□□□□ -0.69
YPR003CP53394 YFL066CYFL066C 1179 nt10.74□□□□□ -0.69
YPR003CP53394 DUS1YML080W 1272 nt10.74□□□□□ -0.69
YPR003CP53394 PEX25YPL112C 1185 nt10.74□□□□□ -0.69
YPR003CP53394 GDH3YAL062W 1374 nt10.73□□□□□ -0.69
YPR003CP53394 TIM17YJL143W 477 nt10.72□□□□□ -0.69
YPR003CP53394 SHM2YLR058C 1410 nt10.7□□□□□ -0.7
YPR003CP53394 AVT6YER119C 1347 nt10.7□□□□□ -0.7
YPR003CP53394 YDR094WYDR094W 336 nt10.7□□□□□ -0.7
YPR003CP53394 YFR018CYFR018C 1092 nt10.7□□□□□ -0.7
YPR003CP53394 FUR4YBR021W 1902 nt10.68□□□□□ -0.7
YPR003CP53394 UBX6YJL048C 1191 nt10.68□□□□□ -0.7
YPR003CP53394 PRE6YOL038W 765 nt10.68□□□□□ -0.7
YPR003CP53394 DUT1YBR252W 444 nt10.67□□□□□ -0.7
YPR003CP53394 GOR1YNL274C 1053 nt10.66□□□□□ -0.7
YPR003CP53394 BOR1YNL275W 1731 nt10.64□□□□□ -0.71
YPR003CP53394 HSP60YLR259C 1719 nt10.61□□□□□ -0.71
YPR003CP53394 RRT5YFR032C 870 nt10.61□□□□□ -0.71
YPR003CP53394 GLK1YCL040W 1503 nt10.61□□□□□ -0.71
YPR003CP53394 YCL074WYCL074W 927 nt10.59□□□□□ -0.71
YPR003CP53394 VPS75YNL246W 795 nt10.59□□□□□ -0.71
YPR003CP53394 SGT2YOR007C 1041 nt10.58□□□□□ -0.72
YPR003CP53394 NIT1YIL164C 600 nt10.57□□□□□ -0.72
YPR003CP53394 PAU16YKL224C 372 nt10.56□□□□□ -0.72
YPR003CP53394 AQY2YLL052C 450 nt10.55□□□□□ -0.72
YPR003CP53394 PAU7YAR020C 168 nt10.53□□□□□ -0.72
YPR003CP53394 STR3YGL184C 1398 nt10.52□□□□□ -0.72
YPR003CP53394 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.51□□□□□ -0.73
YPR003CP53394 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.51□□□□□ -0.73
YPR003CP53394 DAT1YML113W 747 nt10.49□□□□□ -0.73
YPR003CP53394 PRP4YPR178W 1398 nt10.49□□□□□ -0.73
YPR003CP53394 YJL225CYJL225C 5277 nt10.48□□□□□ -0.73
YPR003CP53394 YKR005CYKR005C 1578 nt10.45□□□□□ -0.74
YPR003CP53394 YCR102CYCR102C 1107 nt10.45□□□□□ -0.74
YPR003CP53394 YGR259CYGR259C 441 nt10.41□□□□□ -0.74
YPR003CP53394 MIR1YJR077C 936 nt10.41□□□□□ -0.74
YPR003CP53394 BMT6YLR063W 1098 nt10.41□□□□□ -0.74
YPR003CP53394 DPS1YLL018C 1674 nt10.41□□□□□ -0.74
YPR003CP53394 SHB17YKR043C 816 nt10.39□□□□□ -0.75
YPR003CP53394 THI74YDR438W 1113 nt10.36□□□□□ -0.75
YPR003CP53394 NBP35YGL091C 987 nt10.36□□□□□ -0.75
YPR003CP53394 NAT4YMR069W 858 nt10.36□□□□□ -0.75
YPR003CP53394 RTN2YDL204W 1182 nt10.33□□□□□ -0.76
YPR003CP53394 YDR010CYDR010C 333 nt10.33□□□□□ -0.76
YPR003CP53394 AAC1YMR056C 930 nt10.32□□□□□ -0.76
YPR003CP53394 UBA4YHR111W 1323 nt10.32□□□□□ -0.76
YPR003CP53394 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.3□□□□□ -0.76
YPR003CP53394 MSF1YPR047W 1410 nt10.29□□□□□ -0.76
YPR003CP53394 YSR3YKR053C 1215 nt10.28□□□□□ -0.76
YPR003CP53394 PHO89YBR296C 1725 nt10.27□□□□□ -0.76
YPR003CP53394 SHH4YLR164W 507 nt10.27□□□□□ -0.77
YPR003CP53394 RET2YFR051C 1641 nt10.25□□□□□ -0.77
YPR003CP53394 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.25□□□□□ -0.77
YPR003CP53394 TIR3YIL011W 810 nt10.25□□□□□ -0.77
YPR003CP53394 IRC24YIR036C 792 nt10.23□□□□□ -0.77
YPR003CP53394 SNF1YDR477W 1902 nt10.23□□□□□ -0.77
YPR003CP53394 PLB1YMR008C 1995 nt10.23□□□□□ -0.77
YPR003CP53394 SFA1YDL168W 1161 nt10.22□□□□□ -0.77
YPR003CP53394 ARP6YLR085C 1317 nt10.21□□□□□ -0.78
YPR003CP53394 XYL2YLR070C 1071 nt10.2□□□□□ -0.78
YPR003CP53394 PRO1YDR300C 1287 nt10.19□□□□□ -0.78
YPR003CP53394 ALG12YNR030W 1656 nt10.18□□□□□ -0.78
YPR003CP53394 YGL034CYGL034C 366 nt10.18□□□□□ -0.78
YPR003CP53394 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.16□□□□□ -0.78
YPR003CP53394 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.2 ms