Protein–RNA interactions for Protein: P53104

ATG1, Serine/threonine-protein kinase ATG1, yeastyeast

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Length 897 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG1P53104 YMR244WYMR244W 1068 nt12.32□□□□□ -0.44
ATG1P53104 PAC11YDR488C 1602 nt12.32□□□□□ -0.44
ATG1P53104 YSP3YOR003W 1437 nt12.3□□□□□ -0.44
ATG1P53104 YNL115CYNL115C 1935 nt12.29□□□□□ -0.44
ATG1P53104 AQY1YPR192W 918 nt12.29□□□□□ -0.44
ATG1P53104 THI74YDR438W 1113 nt12.27□□□□□ -0.45
ATG1P53104 BDH1YAL060W 1149 nt12.27□□□□□ -0.45
ATG1P53104 YLR415CYLR415C 339 nt12.25□□□□□ -0.45
ATG1P53104 MIR1YJR077C 936 nt12.23□□□□□ -0.45
ATG1P53104 NVJ2YPR091C 2313 nt12.2□□□□□ -0.46
ATG1P53104 GLR1YPL091W 1452 nt12.19□□□□□ -0.46
ATG1P53104 YLL053CYLL053C 459 nt12.16□□□□□ -0.46
ATG1P53104 YNL195CYNL195C 786 nt12.16□□□□□ -0.46
ATG1P53104 VPS75YNL246W 795 nt12.16□□□□□ -0.46
ATG1P53104 FTR1YER145C 1215 nt12.15□□□□□ -0.46
ATG1P53104 RTF1YGL244W 1677 nt12.14□□□□□ -0.47
ATG1P53104 GAL1YBR020W 1587 nt12.12□□□□□ -0.47
ATG1P53104 RBG2YGR173W 1107 nt12.1□□□□□ -0.47
ATG1P53104 SPC25YER018C 666 nt12.09□□□□□ -0.47
ATG1P53104 CCT4YDL143W 1587 nt12.09□□□□□ -0.47
ATG1P53104 DAT1YML113W 747 nt12.07□□□□□ -0.48
ATG1P53104 STB1YNL309W 1263 nt12.07□□□□□ -0.48
ATG1P53104 BIO4YNR057C 714 nt12.07□□□□□ -0.48
ATG1P53104 NCP1YHR042W 2076 nt12.07□□□□□ -0.48
ATG1P53104 BOP3YNL042W 1191 nt12.04□□□□□ -0.48
ATG1P53104 TRM5YHR070W 1500 nt12.04□□□□□ -0.48
ATG1P53104 GPI16YHR188C 1833 nt12.04□□□□□ -0.48
ATG1P53104 PTK1YKL198C 1989 nt12.03□□□□□ -0.48
ATG1P53104 YGL034CYGL034C 366 nt12.03□□□□□ -0.48
ATG1P53104 SWC5YBR231C 912 nt12.02□□□□□ -0.49
ATG1P53104 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt12□□□□□ -0.49
ATG1P53104 PAU7YAR020C 168 nt12□□□□□ -0.49
ATG1P53104 SIM1YIL123W 1431 nt11.98□□□□□ -0.49
ATG1P53104 SPT8YLR055C 1809 nt11.97□□□□□ -0.49
ATG1P53104 VPS60YDR486C 690 nt11.96□□□□□ -0.49
ATG1P53104 DDR2YOL052C-A 186 nt11.95□□□□□ -0.5
ATG1P53104 NDI1YML120C 1542 nt11.95□□□□□ -0.5
ATG1P53104 UBA4YHR111W 1323 nt11.94□□□□□ -0.5
ATG1P53104 YFL067WYFL067W 528 nt11.93□□□□□ -0.5
ATG1P53104 YMR226CYMR226C 804 nt11.89□□□□□ -0.51
ATG1P53104 YSR3YKR053C 1215 nt11.88□□□□□ -0.51
ATG1P53104 ATF2YGR177C 1608 nt11.88□□□□□ -0.51
ATG1P53104 ALG3YBL082C 1377 nt11.88□□□□□ -0.51
ATG1P53104 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.87□□□□□ -0.51
ATG1P53104 ERF2YLR246W 1080 nt11.87□□□□□ -0.51
ATG1P53104 FEN2YCR028C 1539 nt11.86□□□□□ -0.51
ATG1P53104 SHB17YKR043C 816 nt11.85□□□□□ -0.51
ATG1P53104 TIM17YJL143W 477 nt11.84□□□□□ -0.51
ATG1P53104 RBG1YAL036C 1110 nt11.83□□□□□ -0.52
ATG1P53104 SAM1YLR180W 1149 nt11.83□□□□□ -0.52
ATG1P53104 ANP1YEL036C 1503 nt11.82□□□□□ -0.52
ATG1P53104 YCR087WYCR087W 516 nt11.79□□□□□ -0.52
ATG1P53104 XYL2YLR070C 1071 nt11.79□□□□□ -0.52
ATG1P53104 CRR1YLR213C 1269 nt11.76□□□□□ -0.53
ATG1P53104 LYS4YDR234W 2082 nt11.73□□□□□ -0.53
ATG1P53104 YFL054CYFL054C 1941 nt11.72□□□□□ -0.53
ATG1P53104 YIR016WYIR016W 798 nt11.72□□□□□ -0.53
ATG1P53104 AIM45YPR004C 1035 nt11.71□□□□□ -0.53
ATG1P53104 YDR010CYDR010C 333 nt11.7□□□□□ -0.54
ATG1P53104 RET2YFR051C 1641 nt11.69□□□□□ -0.54
ATG1P53104 SNG1YGR197C 1644 nt11.68□□□□□ -0.54
ATG1P53104 SHM2YLR058C 1410 nt11.67□□□□□ -0.54
ATG1P53104 RPM1RPM1 483 nt11.66□□□□□ -0.54
ATG1P53104 PHO89YBR296C 1725 nt11.66□□□□□ -0.54
ATG1P53104 HEM12YDR047W 1089 nt11.65□□□□□ -0.54
ATG1P53104 CSM2YIL132C 642 nt11.61□□□□□ -0.55
ATG1P53104 YLR111WYLR111W 333 nt11.61□□□□□ -0.55
ATG1P53104 SGT2YOR007C 1041 nt11.6□□□□□ -0.55
ATG1P53104 RAD51YER095W 1203 nt11.59□□□□□ -0.55
ATG1P53104 XDJ1YLR090W 1380 nt11.57□□□□□ -0.56
ATG1P53104 MRP20YDR405W 792 nt11.57□□□□□ -0.56
ATG1P53104 NIT1YIL164C 600 nt11.56□□□□□ -0.56
ATG1P53104 MIC10YCL057C-A 294 nt11.55□□□□□ -0.56
ATG1P53104 MET8YBR213W 825 nt11.52□□□□□ -0.57
ATG1P53104 SWE1YJL187C 2460 nt11.5□□□□□ -0.57
ATG1P53104 GDH3YAL062W 1374 nt11.47□□□□□ -0.57
ATG1P53104 YNR029CYNR029C 1290 nt11.47□□□□□ -0.57
ATG1P53104 COQ2YNR041C 1119 nt11.47□□□□□ -0.57
ATG1P53104 STE4YOR212W 1272 nt11.47□□□□□ -0.57
ATG1P53104 CLB6YGR109C 1143 nt11.46□□□□□ -0.57
ATG1P53104 BNA2YJR078W 1362 nt11.45□□□□□ -0.58
ATG1P53104 YLR349WYLR349W 507 nt11.43□□□□□ -0.58
ATG1P53104 RAD23YEL037C 1197 nt11.41□□□□□ -0.58
ATG1P53104 MIC12YBR262C 321 nt11.41□□□□□ -0.58
ATG1P53104 RPL4BYDR012W 1089 nt11.4□□□□□ -0.58
ATG1P53104 YGR201CYGR201C 678 nt11.4□□□□□ -0.58
ATG1P53104 RPL4AYBR031W 1089 nt11.4□□□□□ -0.58
ATG1P53104 FRE6YLL051C 2139 nt11.39□□□□□ -0.59
ATG1P53104 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.39□□□□□ -0.59
ATG1P53104 SDH5YOL071W 489 nt11.38□□□□□ -0.59
ATG1P53104 ADH7YCR105W 1086 nt11.35□□□□□ -0.59
ATG1P53104 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt11.35□□□□□ -0.59
ATG1P53104 UME6YDR207C 2511 nt11.34□□□□□ -0.59
ATG1P53104 FUN14YAL008W 597 nt11.34□□□□□ -0.59
ATG1P53104 SFA1YDL168W 1161 nt11.33□□□□□ -0.6
ATG1P53104 PAU15YIR041W 375 nt11.31□□□□□ -0.6
ATG1P53104 RPS14BYJL191W 417 nt11.31□□□□□ -0.6
ATG1P53104 HHO1YPL127C 777 nt11.3□□□□□ -0.6
ATG1P53104 YCR102CYCR102C 1107 nt11.27□□□□□ -0.61
ATG1P53104 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt11.27□□□□□ -0.61
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