Protein–RNA interactions for Protein: P52918

MSN5, Protein MSN5, yeastyeast

Predictions only

Length 1,224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSN5P52918 FTR1YER145C 1215 nt13.2□□□□□ -0.3
MSN5P52918 YGL034CYGL034C 366 nt13.2□□□□□ -0.3
MSN5P52918 GAL1YBR020W 1587 nt13.17□□□□□ -0.3
MSN5P52918 CCT4YDL143W 1587 nt13.16□□□□□ -0.3
MSN5P52918 STB1YNL309W 1263 nt13.14□□□□□ -0.31
MSN5P52918 SPC25YER018C 666 nt13.13□□□□□ -0.31
MSN5P52918 SDH1YKL148C 1923 nt13.13□□□□□ -0.31
MSN5P52918 NDI1YML120C 1542 nt13.13□□□□□ -0.31
MSN5P52918 YBR220CYBR220C 1683 nt13.1□□□□□ -0.31
MSN5P52918 YGR139WYGR139W 339 nt13.1□□□□□ -0.31
MSN5P52918 TRM5YHR070W 1500 nt13.09□□□□□ -0.31
MSN5P52918 UBA4YHR111W 1323 nt13.09□□□□□ -0.31
MSN5P52918 PAU7YAR020C 168 nt13.08□□□□□ -0.32
MSN5P52918 BIO4YNR057C 714 nt13.08□□□□□ -0.32
MSN5P52918 SCC4YER147C 1875 nt13.08□□□□□ -0.32
MSN5P52918 SAM1YLR180W 1149 nt13.06□□□□□ -0.32
MSN5P52918 SWC5YBR231C 912 nt13.06□□□□□ -0.32
MSN5P52918 GPI16YHR188C 1833 nt13.05□□□□□ -0.32
MSN5P52918 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt13.05□□□□□ -0.32
MSN5P52918 SPT8YLR055C 1809 nt13.04□□□□□ -0.32
MSN5P52918 YMR226CYMR226C 804 nt13.03□□□□□ -0.32
MSN5P52918 VPS60YDR486C 690 nt13.02□□□□□ -0.33
MSN5P52918 RBG1YAL036C 1110 nt13.02□□□□□ -0.33
MSN5P52918 RPM1RPM1 483 nt13.02□□□□□ -0.33
MSN5P52918 YSR3YKR053C 1215 nt13□□□□□ -0.33
MSN5P52918 ALG3YBL082C 1377 nt12.97□□□□□ -0.33
MSN5P52918 SHB17YKR043C 816 nt12.97□□□□□ -0.33
MSN5P52918 XYL2YLR070C 1071 nt12.97□□□□□ -0.33
MSN5P52918 SIM1YIL123W 1431 nt12.96□□□□□ -0.33
MSN5P52918 RAD51YER095W 1203 nt12.96□□□□□ -0.33
MSN5P52918 YNL195CYNL195C 786 nt12.96□□□□□ -0.33
MSN5P52918 DDR2YOL052C-A 186 nt12.95□□□□□ -0.34
MSN5P52918 BDF1YLR399C 2061 nt12.9□□□□□ -0.34
MSN5P52918 YFL067WYFL067W 528 nt12.9□□□□□ -0.34
MSN5P52918 ATF2YGR177C 1608 nt12.9□□□□□ -0.34
MSN5P52918 FEN2YCR028C 1539 nt12.88□□□□□ -0.35
MSN5P52918 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt12.87□□□□□ -0.35
MSN5P52918 TIM17YJL143W 477 nt12.85□□□□□ -0.35
MSN5P52918 YCR087WYCR087W 516 nt12.83□□□□□ -0.36
MSN5P52918 YDR010CYDR010C 333 nt12.83□□□□□ -0.36
MSN5P52918 PAC11YDR488C 1602 nt12.82□□□□□ -0.36
MSN5P52918 ERF2YLR246W 1080 nt12.81□□□□□ -0.36
MSN5P52918 AIM45YPR004C 1035 nt12.81□□□□□ -0.36
MSN5P52918 ANP1YEL036C 1503 nt12.81□□□□□ -0.36
MSN5P52918 RRT12YCR045C 1476 nt12.79□□□□□ -0.36
MSN5P52918 YNR029CYNR029C 1290 nt12.76□□□□□ -0.37
MSN5P52918 RET2YFR051C 1641 nt12.76□□□□□ -0.37
MSN5P52918 PHO89YBR296C 1725 nt12.76□□□□□ -0.37
MSN5P52918 NVJ2YPR091C 2313 nt12.75□□□□□ -0.37
MSN5P52918 YIR016WYIR016W 798 nt12.74□□□□□ -0.37
MSN5P52918 CRR1YLR213C 1269 nt12.73□□□□□ -0.37
MSN5P52918 TAT1YBR069C 1860 nt12.73□□□□□ -0.37
MSN5P52918 YLR111WYLR111W 333 nt12.72□□□□□ -0.37
MSN5P52918 SHM2YLR058C 1410 nt12.71□□□□□ -0.38
MSN5P52918 STE4YOR212W 1272 nt12.69□□□□□ -0.38
MSN5P52918 YLR349WYLR349W 507 nt12.67□□□□□ -0.38
MSN5P52918 YHL050CYHL050C 2094 nt12.66□□□□□ -0.38
MSN5P52918 SGT2YOR007C 1041 nt12.65□□□□□ -0.38
MSN5P52918 SNG1YGR197C 1644 nt12.65□□□□□ -0.38
MSN5P52918 SEC11YIR022W 504 nt12.64□□□□□ -0.39
MSN5P52918 MRP20YDR405W 792 nt12.61□□□□□ -0.39
MSN5P52918 NIT1YIL164C 600 nt12.61□□□□□ -0.39
MSN5P52918 HEM12YDR047W 1089 nt12.59□□□□□ -0.39
MSN5P52918 XDJ1YLR090W 1380 nt12.57□□□□□ -0.4
MSN5P52918 COQ2YNR041C 1119 nt12.57□□□□□ -0.4
MSN5P52918 NME1NME1 340 nt12.57□□□□□ -0.4
MSN5P52918 ADH7YCR105W 1086 nt12.56□□□□□ -0.4
MSN5P52918 MIC10YCL057C-A 294 nt12.55□□□□□ -0.4
MSN5P52918 PAU15YIR041W 375 nt12.53□□□□□ -0.4
MSN5P52918 PCH2YBR186W 1695 nt12.53□□□□□ -0.4
MSN5P52918 FUN14YAL008W 597 nt12.5□□□□□ -0.41
MSN5P52918 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt12.48□□□□□ -0.41
MSN5P52918 RAD23YEL037C 1197 nt12.47□□□□□ -0.41
MSN5P52918 GDH3YAL062W 1374 nt12.46□□□□□ -0.41
MSN5P52918 SDH5YOL071W 489 nt12.45□□□□□ -0.42
MSN5P52918 GUT2YIL155C 1950 nt12.44□□□□□ -0.42
MSN5P52918 YLR279WYLR279W 390 nt12.43□□□□□ -0.42
MSN5P52918 RPL4BYDR012W 1089 nt12.42□□□□□ -0.42
MSN5P52918 RPL4AYBR031W 1089 nt12.42□□□□□ -0.42
MSN5P52918 YJL195CYJL195C 702 nt12.4□□□□□ -0.42
MSN5P52918 LYS4YDR234W 2082 nt12.4□□□□□ -0.42
MSN5P52918 SFA1YDL168W 1161 nt12.39□□□□□ -0.43
MSN5P52918 CAB5YDR196C 726 nt12.36□□□□□ -0.43
MSN5P52918 RPS14BYJL191W 417 nt12.36□□□□□ -0.43
MSN5P52918 MIC12YBR262C 321 nt12.35□□□□□ -0.43
MSN5P52918 BNA2YJR078W 1362 nt12.34□□□□□ -0.43
MSN5P52918 CLB6YGR109C 1143 nt12.33□□□□□ -0.44
MSN5P52918 RIB3YDR487C 627 nt12.32□□□□□ -0.44
MSN5P52918 ESS1YJR017C 513 nt12.32□□□□□ -0.44
MSN5P52918 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt12.3□□□□□ -0.44
MSN5P52918 NCP1YHR042W 2076 nt12.3□□□□□ -0.44
MSN5P52918 YGR201CYGR201C 678 nt12.29□□□□□ -0.44
MSN5P52918 BOP3YNL042W 1191 nt12.29□□□□□ -0.44
MSN5P52918 RTF1YGL244W 1677 nt12.29□□□□□ -0.44
MSN5P52918 GPN2YOR262W 1044 nt12.27□□□□□ -0.45
MSN5P52918 YGR012WYGR012W 1182 nt12.25□□□□□ -0.45
MSN5P52918 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt12.25□□□□□ -0.45
MSN5P52918 ADH1YOL086C 1047 nt12.25□□□□□ -0.45
MSN5P52918 PIB2YGL023C 1908 nt12.24□□□□□ -0.45
MSN5P52918 TSC10YBR265W 963 nt12.24□□□□□ -0.45
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