Protein–RNA interactions for Protein: P52891

NUP84, Nucleoporin NUP84, yeastyeast

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUP84P52891 SWE1YJL187C 2460 nt11.08□□□□□ -0.64
NUP84P52891 RNQ1YCL028W 1218 nt11.07□□□□□ -0.64
NUP84P52891 UME6YDR207C 2511 nt11.05□□□□□ -0.64
NUP84P52891 TAD3YLR316C 969 nt11.05□□□□□ -0.64
NUP84P52891 YIH1YCR059C 777 nt11.01□□□□□ -0.65
NUP84P52891 ERF2YLR246W 1080 nt10.99□□□□□ -0.65
NUP84P52891 PRE6YOL038W 765 nt10.98□□□□□ -0.65
NUP84P52891 CRR1YLR213C 1269 nt10.97□□□□□ -0.65
NUP84P52891 RPM1RPM1 483 nt10.96□□□□□ -0.65
NUP84P52891 AQY1YPR192W 918 nt10.96□□□□□ -0.65
NUP84P52891 AHT1YHR093W 549 nt10.95□□□□□ -0.66
NUP84P52891 SBA1YKL117W 651 nt10.95□□□□□ -0.66
NUP84P52891 WSC2YNL283C 1512 nt10.94□□□□□ -0.66
NUP84P52891 NAT4YMR069W 858 nt10.92□□□□□ -0.66
NUP84P52891 YLL053CYLL053C 459 nt10.91□□□□□ -0.66
NUP84P52891 HSP60YLR259C 1719 nt10.91□□□□□ -0.66
NUP84P52891 PEX25YPL112C 1185 nt10.9□□□□□ -0.66
NUP84P52891 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.89□□□□□ -0.67
NUP84P52891 GLK1YCL040W 1503 nt10.89□□□□□ -0.67
NUP84P52891 HEM12YDR047W 1089 nt10.88□□□□□ -0.67
NUP84P52891 FTR1YER145C 1215 nt10.87□□□□□ -0.67
NUP84P52891 YLR415CYLR415C 339 nt10.86□□□□□ -0.67
NUP84P52891 MIC10YCL057C-A 294 nt10.86□□□□□ -0.67
NUP84P52891 ATF2YGR177C 1608 nt10.85□□□□□ -0.67
NUP84P52891 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.85□□□□□ -0.67
NUP84P52891 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.85□□□□□ -0.67
NUP84P52891 YFL066CYFL066C 1179 nt10.84□□□□□ -0.67
NUP84P52891 GAL1YBR020W 1587 nt10.82□□□□□ -0.68
NUP84P52891 YFL067WYFL067W 528 nt10.81□□□□□ -0.68
NUP84P52891 SNG1YGR197C 1644 nt10.8□□□□□ -0.68
NUP84P52891 RAX1YOR301W 1308 nt10.8□□□□□ -0.68
NUP84P52891 YNL115CYNL115C 1935 nt10.8□□□□□ -0.68
NUP84P52891 TRM5YHR070W 1500 nt10.79□□□□□ -0.68
NUP84P52891 STB1YNL309W 1263 nt10.79□□□□□ -0.68
NUP84P52891 CCA1YER168C 1641 nt10.78□□□□□ -0.68
NUP84P52891 DDR2YOL052C-A 186 nt10.78□□□□□ -0.68
NUP84P52891 SWC5YBR231C 912 nt10.78□□□□□ -0.68
NUP84P52891 FUR4YBR021W 1902 nt10.78□□□□□ -0.68
NUP84P52891 GPI16YHR188C 1833 nt10.77□□□□□ -0.68
NUP84P52891 YSP3YOR003W 1437 nt10.77□□□□□ -0.68
NUP84P52891 BDH1YAL060W 1149 nt10.77□□□□□ -0.69
NUP84P52891 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.76□□□□□ -0.69
NUP84P52891 CCT4YDL143W 1587 nt10.76□□□□□ -0.69
NUP84P52891 SPC25YER018C 666 nt10.74□□□□□ -0.69
NUP84P52891 MSF1YPR047W 1410 nt10.73□□□□□ -0.69
NUP84P52891 THI74YDR438W 1113 nt10.7□□□□□ -0.7
NUP84P52891 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.69□□□□□ -0.7
NUP84P52891 VPS75YNL246W 795 nt10.69□□□□□ -0.7
NUP84P52891 PAU7YAR020C 168 nt10.68□□□□□ -0.7
NUP84P52891 VPS60YDR486C 690 nt10.66□□□□□ -0.7
NUP84P52891 ALG12YNR030W 1656 nt10.66□□□□□ -0.7
NUP84P52891 BNA2YJR078W 1362 nt10.65□□□□□ -0.71
NUP84P52891 ANP1YEL036C 1503 nt10.64□□□□□ -0.71
NUP84P52891 MIR1YJR077C 936 nt10.63□□□□□ -0.71
NUP84P52891 PRP4YPR178W 1398 nt10.63□□□□□ -0.71
NUP84P52891 FEN2YCR028C 1539 nt10.6□□□□□ -0.71
NUP84P52891 MCH5YOR306C 1566 nt10.57□□□□□ -0.72
NUP84P52891 TIM17YJL143W 477 nt10.57□□□□□ -0.72
NUP84P52891 MIC12YBR262C 321 nt10.57□□□□□ -0.72
NUP84P52891 DPS1YLL018C 1674 nt10.57□□□□□ -0.72
NUP84P52891 ALG3YBL082C 1377 nt10.56□□□□□ -0.72
NUP84P52891 AAC1YMR056C 930 nt10.55□□□□□ -0.72
NUP84P52891 DUS1YML080W 1272 nt10.54□□□□□ -0.72
NUP84P52891 AGP1YCL025C 1902 nt10.53□□□□□ -0.72
NUP84P52891 DAT1YML113W 747 nt10.53□□□□□ -0.72
NUP84P52891 BMT6YLR063W 1098 nt10.52□□□□□ -0.73
NUP84P52891 GLR1YPL091W 1452 nt10.52□□□□□ -0.73
NUP84P52891 YMR244WYMR244W 1068 nt10.5□□□□□ -0.73
NUP84P52891 YKR005CYKR005C 1578 nt10.5□□□□□ -0.73
NUP84P52891 HHO1YPL127C 777 nt10.49□□□□□ -0.73
NUP84P52891 YCL074WYCL074W 927 nt10.48□□□□□ -0.73
NUP84P52891 YGL034CYGL034C 366 nt10.48□□□□□ -0.73
NUP84P52891 YIR016WYIR016W 798 nt10.48□□□□□ -0.73
NUP84P52891 YSR3YKR053C 1215 nt10.46□□□□□ -0.73
NUP84P52891 UBA4YHR111W 1323 nt10.46□□□□□ -0.73
NUP84P52891 SHB17YKR043C 816 nt10.43□□□□□ -0.74
NUP84P52891 NDI1YML120C 1542 nt10.43□□□□□ -0.74
NUP84P52891 YGR259CYGR259C 441 nt10.41□□□□□ -0.74
NUP84P52891 YGR201CYGR201C 678 nt10.4□□□□□ -0.74
NUP84P52891 NAR1YNL240C 1476 nt10.4□□□□□ -0.74
NUP84P52891 SNF1YDR477W 1902 nt10.4□□□□□ -0.74
NUP84P52891 YCR087WYCR087W 516 nt10.39□□□□□ -0.75
NUP84P52891 SHM2YLR058C 1410 nt10.39□□□□□ -0.75
NUP84P52891 BIO5YNR056C 1686 nt10.38□□□□□ -0.75
NUP84P52891 XDJ1YLR090W 1380 nt10.38□□□□□ -0.75
NUP84P52891 RBG1YAL036C 1110 nt10.37□□□□□ -0.75
NUP84P52891 RBG2YGR173W 1107 nt10.35□□□□□ -0.75
NUP84P52891 XYL2YLR070C 1071 nt10.34□□□□□ -0.75
NUP84P52891 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.33□□□□□ -0.76
NUP84P52891 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.33□□□□□ -0.76
NUP84P52891 IRC24YIR036C 792 nt10.32□□□□□ -0.76
NUP84P52891 SGT2YOR007C 1041 nt10.32□□□□□ -0.76
NUP84P52891 PHO89YBR296C 1725 nt10.31□□□□□ -0.76
NUP84P52891 GDH3YAL062W 1374 nt10.3□□□□□ -0.76
NUP84P52891 FRE6YLL051C 2139 nt10.3□□□□□ -0.76
NUP84P52891 DUT1YBR252W 444 nt10.3□□□□□ -0.76
NUP84P52891 STR3YGL184C 1398 nt10.29□□□□□ -0.76
NUP84P52891 RET2YFR051C 1641 nt10.27□□□□□ -0.77
NUP84P52891 YMR226CYMR226C 804 nt10.27□□□□□ -0.77
NUP84P52891 AIM45YPR004C 1035 nt10.27□□□□□ -0.77
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