Protein–RNA interactions for Protein: P47050

RTT101, Cullin-8, yeastyeast

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Length 842 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTT101P47050 NCP1YHR042W 2076 nt11.23□□□□□ -0.61
RTT101P47050 DDR2YOL052C-A 186 nt11.21□□□□□ -0.61
RTT101P47050 YFL067WYFL067W 528 nt11.2□□□□□ -0.62
RTT101P47050 ATF2YGR177C 1608 nt11.2□□□□□ -0.62
RTT101P47050 YFR018CYFR018C 1092 nt11.19□□□□□ -0.62
RTT101P47050 STB1YNL309W 1263 nt11.19□□□□□ -0.62
RTT101P47050 SPC25YER018C 666 nt11.17□□□□□ -0.62
RTT101P47050 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.16□□□□□ -0.62
RTT101P47050 CRR1YLR213C 1269 nt11.16□□□□□ -0.62
RTT101P47050 GPI16YHR188C 1833 nt11.14□□□□□ -0.63
RTT101P47050 CCT4YDL143W 1587 nt11.13□□□□□ -0.63
RTT101P47050 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.13□□□□□ -0.63
RTT101P47050 RRT5YFR032C 870 nt11.12□□□□□ -0.63
RTT101P47050 HEM12YDR047W 1089 nt11.09□□□□□ -0.63
RTT101P47050 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.09□□□□□ -0.63
RTT101P47050 PAU16YKL224C 372 nt11.09□□□□□ -0.63
RTT101P47050 BDH1YAL060W 1149 nt11.09□□□□□ -0.63
RTT101P47050 YLR415CYLR415C 339 nt11.09□□□□□ -0.63
RTT101P47050 SWC5YBR231C 912 nt11.09□□□□□ -0.63
RTT101P47050 PRE6YOL038W 765 nt11.08□□□□□ -0.64
RTT101P47050 LYS4YDR234W 2082 nt11.08□□□□□ -0.64
RTT101P47050 VPS60YDR486C 690 nt11.07□□□□□ -0.64
RTT101P47050 PEX25YPL112C 1185 nt11.06□□□□□ -0.64
RTT101P47050 SNG1YGR197C 1644 nt11.06□□□□□ -0.64
RTT101P47050 FEN2YCR028C 1539 nt11.05□□□□□ -0.64
RTT101P47050 ANP1YEL036C 1503 nt11.05□□□□□ -0.64
RTT101P47050 YSP3YOR003W 1437 nt11.04□□□□□ -0.64
RTT101P47050 YFL066CYFL066C 1179 nt11.04□□□□□ -0.64
RTT101P47050 YFL054CYFL054C 1941 nt11.03□□□□□ -0.64
RTT101P47050 MIC10YCL057C-A 294 nt11.03□□□□□ -0.64
RTT101P47050 YNL115CYNL115C 1935 nt11.01□□□□□ -0.65
RTT101P47050 ALG3YBL082C 1377 nt11□□□□□ -0.65
RTT101P47050 YIR016WYIR016W 798 nt10.94□□□□□ -0.66
RTT101P47050 SPT8YLR055C 1809 nt10.93□□□□□ -0.66
RTT101P47050 BNA2YJR078W 1362 nt10.9□□□□□ -0.67
RTT101P47050 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.88□□□□□ -0.67
RTT101P47050 VPS75YNL246W 795 nt10.88□□□□□ -0.67
RTT101P47050 GLK1YCL040W 1503 nt10.85□□□□□ -0.67
RTT101P47050 NAT4YMR069W 858 nt10.85□□□□□ -0.67
RTT101P47050 YJL225CYJL225C 5277 nt10.84□□□□□ -0.67
RTT101P47050 TIM17YJL143W 477 nt10.84□□□□□ -0.67
RTT101P47050 RAX1YOR301W 1308 nt10.84□□□□□ -0.67
RTT101P47050 MIC12YBR262C 321 nt10.79□□□□□ -0.68
RTT101P47050 XDJ1YLR090W 1380 nt10.78□□□□□ -0.68
RTT101P47050 Q0182Q0182 405 nt10.78□□□□□ -0.68
RTT101P47050 PAU7YAR020C 168 nt10.78□□□□□ -0.68
RTT101P47050 BOR1YNL275W 1731 nt10.78□□□□□ -0.68
RTT101P47050 MIR1YJR077C 936 nt10.77□□□□□ -0.69
RTT101P47050 SHM2YLR058C 1410 nt10.76□□□□□ -0.69
RTT101P47050 THI74YDR438W 1113 nt10.76□□□□□ -0.69
RTT101P47050 SWE1YJL187C 2460 nt10.76□□□□□ -0.69
RTT101P47050 HHO1YPL127C 777 nt10.75□□□□□ -0.69
RTT101P47050 MSF1YPR047W 1410 nt10.75□□□□□ -0.69
RTT101P47050 UME6YDR207C 2511 nt10.74□□□□□ -0.69
RTT101P47050 GDH3YAL062W 1374 nt10.72□□□□□ -0.69
RTT101P47050 YGR201CYGR201C 678 nt10.71□□□□□ -0.69
RTT101P47050 SBA1YKL117W 651 nt10.71□□□□□ -0.69
RTT101P47050 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.66□□□□□ -0.7
RTT101P47050 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.66□□□□□ -0.7
RTT101P47050 SGT2YOR007C 1041 nt10.66□□□□□ -0.7
RTT101P47050 NIT1YIL164C 600 nt10.64□□□□□ -0.71
RTT101P47050 DAT1YML113W 747 nt10.64□□□□□ -0.71
RTT101P47050 AVT6YER119C 1347 nt10.63□□□□□ -0.71
RTT101P47050 SHB17YKR043C 816 nt10.63□□□□□ -0.71
RTT101P47050 UBA4YHR111W 1323 nt10.61□□□□□ -0.71
RTT101P47050 CCA1YER168C 1641 nt10.6□□□□□ -0.71
RTT101P47050 GOR1YNL274C 1053 nt10.59□□□□□ -0.71
RTT101P47050 YGL034CYGL034C 366 nt10.56□□□□□ -0.72
RTT101P47050 YSR3YKR053C 1215 nt10.56□□□□□ -0.72
RTT101P47050 YDR010CYDR010C 333 nt10.55□□□□□ -0.72
RTT101P47050 HSP60YLR259C 1719 nt10.55□□□□□ -0.72
RTT101P47050 AGP1YCL025C 1902 nt10.54□□□□□ -0.72
RTT101P47050 RET2YFR051C 1641 nt10.5□□□□□ -0.73
RTT101P47050 XYL2YLR070C 1071 nt10.49□□□□□ -0.73
RTT101P47050 DUT1YBR252W 444 nt10.49□□□□□ -0.73
RTT101P47050 PHO89YBR296C 1725 nt10.49□□□□□ -0.73
RTT101P47050 YCR102CYCR102C 1107 nt10.48□□□□□ -0.73
RTT101P47050 DUS1YML080W 1272 nt10.47□□□□□ -0.73
RTT101P47050 YCR087WYCR087W 516 nt10.46□□□□□ -0.73
RTT101P47050 FUR4YBR021W 1902 nt10.45□□□□□ -0.74
RTT101P47050 MCH5YOR306C 1566 nt10.43□□□□□ -0.74
RTT101P47050 RBG1YAL036C 1110 nt10.43□□□□□ -0.74
RTT101P47050 NDI1YML120C 1542 nt10.43□□□□□ -0.74
RTT101P47050 ALG12YNR030W 1656 nt10.42□□□□□ -0.74
RTT101P47050 GLR1YPL091W 1452 nt10.41□□□□□ -0.74
RTT101P47050 MRP20YDR405W 792 nt10.39□□□□□ -0.75
RTT101P47050 YMR244WYMR244W 1068 nt10.38□□□□□ -0.75
RTT101P47050 AIM45YPR004C 1035 nt10.38□□□□□ -0.75
RTT101P47050 AQY2YLL052C 450 nt10.35□□□□□ -0.75
RTT101P47050 YCL074WYCL074W 927 nt10.34□□□□□ -0.75
RTT101P47050 SFA1YDL168W 1161 nt10.34□□□□□ -0.75
RTT101P47050 NBP35YGL091C 987 nt10.34□□□□□ -0.75
RTT101P47050 COQ2YNR041C 1119 nt10.34□□□□□ -0.75
RTT101P47050 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.33□□□□□ -0.76
RTT101P47050 STR3YGL184C 1398 nt10.33□□□□□ -0.76
RTT101P47050 TIR3YIL011W 810 nt10.3□□□□□ -0.76
RTT101P47050 PRP4YPR178W 1398 nt10.29□□□□□ -0.76
RTT101P47050 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.28□□□□□ -0.76
RTT101P47050 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.28□□□□□ -0.76
RTT101P47050 SHH4YLR164W 507 nt10.26□□□□□ -0.77
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