Protein–RNA interactions for Protein: P43607

RRT5, Regulator of rDNA transcription protein 5, yeastyeast

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRT5P43607 MIC10YCL057C-A 294 nt11.25□□□□□ -0.61
RRT5P43607 STB1YNL309W 1263 nt11.24□□□□□ -0.61
RRT5P43607 TAD3YLR316C 969 nt11.23□□□□□ -0.61
RRT5P43607 SNG1YGR197C 1644 nt11.23□□□□□ -0.61
RRT5P43607 SPC25YER018C 666 nt11.22□□□□□ -0.61
RRT5P43607 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.21□□□□□ -0.61
RRT5P43607 HEM12YDR047W 1089 nt11.21□□□□□ -0.61
RRT5P43607 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.2□□□□□ -0.62
RRT5P43607 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.2□□□□□ -0.62
RRT5P43607 YFL054CYFL054C 1941 nt11.19□□□□□ -0.62
RRT5P43607 ANP1YEL036C 1503 nt11.17□□□□□ -0.62
RRT5P43607 CCT4YDL143W 1587 nt11.16□□□□□ -0.62
RRT5P43607 GPI16YHR188C 1833 nt11.14□□□□□ -0.63
RRT5P43607 VPS60YDR486C 690 nt11.13□□□□□ -0.63
RRT5P43607 UBX6YJL048C 1191 nt11.13□□□□□ -0.63
RRT5P43607 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.12□□□□□ -0.63
RRT5P43607 FEN2YCR028C 1539 nt11.12□□□□□ -0.63
RRT5P43607 BDH1YAL060W 1149 nt11.11□□□□□ -0.63
RRT5P43607 ALG3YBL082C 1377 nt11.11□□□□□ -0.63
RRT5P43607 YDR094WYDR094W 336 nt11.09□□□□□ -0.63
RRT5P43607 SPT8YLR055C 1809 nt11.07□□□□□ -0.64
RRT5P43607 SWC5YBR231C 912 nt11.06□□□□□ -0.64
RRT5P43607 YSP3YOR003W 1437 nt11.03□□□□□ -0.64
RRT5P43607 YIR016WYIR016W 798 nt11.03□□□□□ -0.64
RRT5P43607 YFR018CYFR018C 1092 nt11.01□□□□□ -0.65
RRT5P43607 YLR415CYLR415C 339 nt11.01□□□□□ -0.65
RRT5P43607 RAX1YOR301W 1308 nt11.01□□□□□ -0.65
RRT5P43607 PRE6YOL038W 765 nt10.99□□□□□ -0.65
RRT5P43607 YFL066CYFL066C 1179 nt10.97□□□□□ -0.65
RRT5P43607 MIC12YBR262C 321 nt10.97□□□□□ -0.65
RRT5P43607 SWE1YJL187C 2460 nt10.96□□□□□ -0.65
RRT5P43607 PEX25YPL112C 1185 nt10.95□□□□□ -0.66
RRT5P43607 BNA2YJR078W 1362 nt10.94□□□□□ -0.66
RRT5P43607 YNL115CYNL115C 1935 nt10.94□□□□□ -0.66
RRT5P43607 CCA1YER168C 1641 nt10.88□□□□□ -0.67
RRT5P43607 PAU16YKL224C 372 nt10.88□□□□□ -0.67
RRT5P43607 PAC11YDR488C 1602 nt10.87□□□□□ -0.67
RRT5P43607 HHO1YPL127C 777 nt10.84□□□□□ -0.67
RRT5P43607 XDJ1YLR090W 1380 nt10.84□□□□□ -0.67
RRT5P43607 RRT5YFR032C 870 nt10.83□□□□□ -0.68
RRT5P43607 AGP1YCL025C 1902 nt10.82□□□□□ -0.68
RRT5P43607 SHM2YLR058C 1410 nt10.81□□□□□ -0.68
RRT5P43607 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.79□□□□□ -0.68
RRT5P43607 YGR201CYGR201C 678 nt10.78□□□□□ -0.68
RRT5P43607 TIM17YJL143W 477 nt10.78□□□□□ -0.68
RRT5P43607 VPS75YNL246W 795 nt10.78□□□□□ -0.68
RRT5P43607 GDH3YAL062W 1374 nt10.77□□□□□ -0.68
RRT5P43607 NIT1YIL164C 600 nt10.73□□□□□ -0.69
RRT5P43607 DUT1YBR252W 444 nt10.73□□□□□ -0.69
RRT5P43607 AVT6YER119C 1347 nt10.71□□□□□ -0.69
RRT5P43607 SGT2YOR007C 1041 nt10.69□□□□□ -0.7
RRT5P43607 MIR1YJR077C 936 nt10.67□□□□□ -0.7
RRT5P43607 GOR1YNL274C 1053 nt10.63□□□□□ -0.71
RRT5P43607 FUR4YBR021W 1902 nt10.6□□□□□ -0.71
RRT5P43607 DUS1YML080W 1272 nt10.6□□□□□ -0.71
RRT5P43607 DAT1YML113W 747 nt10.6□□□□□ -0.71
RRT5P43607 PAU7YAR020C 168 nt10.59□□□□□ -0.71
RRT5P43607 GLK1YCL040W 1503 nt10.58□□□□□ -0.72
RRT5P43607 THI74YDR438W 1113 nt10.57□□□□□ -0.72
RRT5P43607 NAT4YMR069W 858 nt10.57□□□□□ -0.72
RRT5P43607 YDR010CYDR010C 333 nt10.56□□□□□ -0.72
RRT5P43607 SHB17YKR043C 816 nt10.56□□□□□ -0.72
RRT5P43607 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.55□□□□□ -0.72
RRT5P43607 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.55□□□□□ -0.72
RRT5P43607 STR3YGL184C 1398 nt10.54□□□□□ -0.72
RRT5P43607 YCL074WYCL074W 927 nt10.54□□□□□ -0.72
RRT5P43607 MSF1YPR047W 1410 nt10.53□□□□□ -0.72
RRT5P43607 YCR102CYCR102C 1107 nt10.51□□□□□ -0.73
RRT5P43607 UBA4YHR111W 1323 nt10.51□□□□□ -0.73
RRT5P43607 HSP60YLR259C 1719 nt10.48□□□□□ -0.73
RRT5P43607 AQY2YLL052C 450 nt10.48□□□□□ -0.73
RRT5P43607 NBP35YGL091C 987 nt10.47□□□□□ -0.73
RRT5P43607 Q0182Q0182 405 nt10.44□□□□□ -0.74
RRT5P43607 RET2YFR051C 1641 nt10.43□□□□□ -0.74
RRT5P43607 YSR3YKR053C 1215 nt10.42□□□□□ -0.74
RRT5P43607 YJL225CYJL225C 5277 nt10.42□□□□□ -0.74
RRT5P43607 SFA1YDL168W 1161 nt10.4□□□□□ -0.74
RRT5P43607 SHH4YLR164W 507 nt10.4□□□□□ -0.74
RRT5P43607 PHO89YBR296C 1725 nt10.4□□□□□ -0.74
RRT5P43607 YGL034CYGL034C 366 nt10.39□□□□□ -0.75
RRT5P43607 SBA1YKL117W 651 nt10.38□□□□□ -0.75
RRT5P43607 XYL2YLR070C 1071 nt10.38□□□□□ -0.75
RRT5P43607 YKR005CYKR005C 1578 nt10.38□□□□□ -0.75
RRT5P43607 BOR1YNL275W 1731 nt10.38□□□□□ -0.75
RRT5P43607 PRP4YPR178W 1398 nt10.36□□□□□ -0.75
RRT5P43607 TIR3YIL011W 810 nt10.34□□□□□ -0.75
RRT5P43607 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.33□□□□□ -0.76
RRT5P43607 YGR259CYGR259C 441 nt10.32□□□□□ -0.76
RRT5P43607 COQ2YNR041C 1119 nt10.31□□□□□ -0.76
RRT5P43607 RTN2YDL204W 1182 nt10.3□□□□□ -0.76
RRT5P43607 DPS1YLL018C 1674 nt10.29□□□□□ -0.76
RRT5P43607 ARP6YLR085C 1317 nt10.29□□□□□ -0.76
RRT5P43607 YCR087WYCR087W 516 nt10.27□□□□□ -0.77
RRT5P43607 POM34YLR018C 900 nt10.27□□□□□ -0.77
RRT5P43607 PRO1YDR300C 1287 nt10.26□□□□□ -0.77
RRT5P43607 RBG1YAL036C 1110 nt10.26□□□□□ -0.77
RRT5P43607 AIM45YPR004C 1035 nt10.26□□□□□ -0.77
RRT5P43607 TOM6YOR045W 186 nt10.25□□□□□ -0.77
RRT5P43607 MRP20YDR405W 792 nt10.24□□□□□ -0.77
RRT5P43607 LSC2YGR244C 1284 nt10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 82.5 ms