Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.89□□□□□ -0.67
SEC28P40509 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.89□□□□□ -0.67
SEC28P40509 STB1YNL309W 1263 nt10.89□□□□□ -0.67
SEC28P40509 YPR064WYPR064W 420 nt10.89□□□□□ -0.67
SEC28P40509 RTG1YOL067C 534 nt10.87□□□□□ -0.67
SEC28P40509 RAX1YOR301W 1308 nt10.86□□□□□ -0.67
SEC28P40509 GPI16YHR188C 1833 nt10.86□□□□□ -0.67
SEC28P40509 SWE1YJL187C 2460 nt10.85□□□□□ -0.67
SEC28P40509 BNA2YJR078W 1362 nt10.85□□□□□ -0.67
SEC28P40509 SPC25YER018C 666 nt10.84□□□□□ -0.67
SEC28P40509 ANP1YEL036C 1503 nt10.84□□□□□ -0.67
SEC28P40509 UME6YDR207C 2511 nt10.83□□□□□ -0.68
SEC28P40509 AHT1YHR093W 549 nt10.82□□□□□ -0.68
SEC28P40509 FEN2YCR028C 1539 nt10.81□□□□□ -0.68
SEC28P40509 WSC2YNL283C 1512 nt10.81□□□□□ -0.68
SEC28P40509 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.8□□□□□ -0.68
SEC28P40509 YEL076CYEL076C 651 nt10.8□□□□□ -0.68
SEC28P40509 HUA1YGR268C 597 nt10.8□□□□□ -0.68
SEC28P40509 YLR464WYLR464W 651 nt10.8□□□□□ -0.68
SEC28P40509 CCT4YDL143W 1587 nt10.79□□□□□ -0.68
SEC28P40509 SWC5YBR231C 912 nt10.79□□□□□ -0.68
SEC28P40509 TAD3YLR316C 969 nt10.78□□□□□ -0.68
SEC28P40509 VPS60YDR486C 690 nt10.76□□□□□ -0.69
SEC28P40509 MRPL8YJL063C 717 nt10.76□□□□□ -0.69
SEC28P40509 ADO1YJR105W 1023 nt10.76□□□□□ -0.69
SEC28P40509 CCA1YER168C 1641 nt10.7□□□□□ -0.7
SEC28P40509 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.7□□□□□ -0.7
SEC28P40509 YIR016WYIR016W 798 nt10.7□□□□□ -0.7
SEC28P40509 HHO1YPL127C 777 nt10.68□□□□□ -0.7
SEC28P40509 MIC12YBR262C 321 nt10.67□□□□□ -0.7
SEC28P40509 ALG3YBL082C 1377 nt10.66□□□□□ -0.7
SEC28P40509 RPM1RPM1 483 nt10.66□□□□□ -0.7
SEC28P40509 YLR415CYLR415C 339 nt10.64□□□□□ -0.71
SEC28P40509 BOR1YNL275W 1731 nt10.61□□□□□ -0.71
SEC28P40509 DUS1YML080W 1272 nt10.59□□□□□ -0.71
SEC28P40509 YGR201CYGR201C 678 nt10.58□□□□□ -0.72
SEC28P40509 BDH1YAL060W 1149 nt10.58□□□□□ -0.72
SEC28P40509 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.56□□□□□ -0.72
SEC28P40509 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.56□□□□□ -0.72
SEC28P40509 FUR4YBR021W 1902 nt10.54□□□□□ -0.72
SEC28P40509 XDJ1YLR090W 1380 nt10.53□□□□□ -0.72
SEC28P40509 HSP60YLR259C 1719 nt10.52□□□□□ -0.73
SEC28P40509 GLK1YCL040W 1503 nt10.52□□□□□ -0.73
SEC28P40509 AGP1YCL025C 1902 nt10.51□□□□□ -0.73
SEC28P40509 GDH3YAL062W 1374 nt10.51□□□□□ -0.73
SEC28P40509 TIM17YJL143W 477 nt10.5□□□□□ -0.73
SEC28P40509 GOR1YNL274C 1053 nt10.49□□□□□ -0.73
SEC28P40509 AVT6YER119C 1347 nt10.49□□□□□ -0.73
SEC28P40509 YSP3YOR003W 1437 nt10.48□□□□□ -0.73
SEC28P40509 YCL074WYCL074W 927 nt10.46□□□□□ -0.73
SEC28P40509 SHM2YLR058C 1410 nt10.44□□□□□ -0.74
SEC28P40509 YNL115CYNL115C 1935 nt10.44□□□□□ -0.74
SEC28P40509 PEX25YPL112C 1185 nt10.42□□□□□ -0.74
SEC28P40509 PRP4YPR178W 1398 nt10.39□□□□□ -0.75
SEC28P40509 BMT6YLR063W 1098 nt10.37□□□□□ -0.75
SEC28P40509 DUT1YBR252W 444 nt10.37□□□□□ -0.75
SEC28P40509 YFL066CYFL066C 1179 nt10.36□□□□□ -0.75
SEC28P40509 AQY2YLL052C 450 nt10.36□□□□□ -0.75
SEC28P40509 YFR018CYFR018C 1092 nt10.35□□□□□ -0.75
SEC28P40509 VPS75YNL246W 795 nt10.33□□□□□ -0.76
SEC28P40509 YKR005CYKR005C 1578 nt10.32□□□□□ -0.76
SEC28P40509 STR3YGL184C 1398 nt10.32□□□□□ -0.76
SEC28P40509 YDR094WYDR094W 336 nt10.3□□□□□ -0.76
SEC28P40509 SGT2YOR007C 1041 nt10.3□□□□□ -0.76
SEC28P40509 DPS1YLL018C 1674 nt10.3□□□□□ -0.76
SEC28P40509 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.29□□□□□ -0.76
SEC28P40509 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.29□□□□□ -0.76
SEC28P40509 YGR259CYGR259C 441 nt10.29□□□□□ -0.76
SEC28P40509 NIT1YIL164C 600 nt10.29□□□□□ -0.76
SEC28P40509 PAU7YAR020C 168 nt10.29□□□□□ -0.76
SEC28P40509 RRT5YFR032C 870 nt10.28□□□□□ -0.76
SEC28P40509 DAT1YML113W 747 nt10.27□□□□□ -0.77
SEC28P40509 YCR102CYCR102C 1107 nt10.26□□□□□ -0.77
SEC28P40509 AAC1YMR056C 930 nt10.25□□□□□ -0.77
SEC28P40509 PRE6YOL038W 765 nt10.24□□□□□ -0.77
SEC28P40509 FRE6YLL051C 2139 nt10.22□□□□□ -0.77
SEC28P40509 RTN2YDL204W 1182 nt10.19□□□□□ -0.78
SEC28P40509 UBX6YJL048C 1191 nt10.17□□□□□ -0.78
SEC28P40509 IRC24YIR036C 792 nt10.15□□□□□ -0.78
SEC28P40509 PAU16YKL224C 372 nt10.15□□□□□ -0.78
SEC28P40509 NBP35YGL091C 987 nt10.14□□□□□ -0.79
SEC28P40509 ALG12YNR030W 1656 nt10.14□□□□□ -0.79
SEC28P40509 SHB17YKR043C 816 nt10.09□□□□□ -0.79
SEC28P40509 MCH5YOR306C 1566 nt10.09□□□□□ -0.79
SEC28P40509 MIR1YJR077C 936 nt10.07□□□□□ -0.8
SEC28P40509 SNF1YDR477W 1902 nt10.06□□□□□ -0.8
SEC28P40509 TIR3YIL011W 810 nt10.05□□□□□ -0.8
SEC28P40509 NAT4YMR069W 858 nt10.05□□□□□ -0.8
SEC28P40509 THI74YDR438W 1113 nt10.04□□□□□ -0.8
SEC28P40509 PLB1YMR008C 1995 nt10.03□□□□□ -0.8
SEC28P40509 ARP6YLR085C 1317 nt10.03□□□□□ -0.8
SEC28P40509 YDR010CYDR010C 333 nt10.02□□□□□ -0.81
SEC28P40509 UBA4YHR111W 1323 nt10.02□□□□□ -0.81
SEC28P40509 LSC2YGR244C 1284 nt10□□□□□ -0.81
SEC28P40509 BIO5YNR056C 1686 nt9.99□□□□□ -0.81
SEC28P40509 YSR3YKR053C 1215 nt9.99□□□□□ -0.81
SEC28P40509 RET2YFR051C 1641 nt9.99□□□□□ -0.81
SEC28P40509 PHO89YBR296C 1725 nt9.99□□□□□ -0.81
SEC28P40509 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9.98□□□□□ -0.81
SEC28P40509 SHH4YLR164W 507 nt9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 32.3 ms