Protein–RNA interactions for Protein: P40202

CCS1, Superoxide dismutase 1 copper chaperone, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CCS1P40202 YKL030WYKL030W 606 nt9.28□□□□□ -0.92
CCS1P40202 RAX1YOR301W 1308 nt9.26□□□□□ -0.93
CCS1P40202 STB1YNL309W 1263 nt9.24□□□□□ -0.93
CCS1P40202 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.23□□□□□ -0.93
CCS1P40202 ANP1YEL036C 1503 nt9.21□□□□□ -0.93
CCS1P40202 BNA2YJR078W 1362 nt9.21□□□□□ -0.94
CCS1P40202 GPI16YHR188C 1833 nt9.2□□□□□ -0.94
CCS1P40202 SPC25YER018C 666 nt9.2□□□□□ -0.94
CCS1P40202 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.2□□□□□ -0.94
CCS1P40202 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.2□□□□□ -0.94
CCS1P40202 YPR064WYPR064W 420 nt9.19□□□□□ -0.94
CCS1P40202 FEN2YCR028C 1539 nt9.17□□□□□ -0.94
CCS1P40202 AHT1YHR093W 549 nt9.17□□□□□ -0.94
CCS1P40202 CCT4YDL143W 1587 nt9.15□□□□□ -0.95
CCS1P40202 WSC2YNL283C 1512 nt9.15□□□□□ -0.95
CCS1P40202 RTG1YOL067C 534 nt9.14□□□□□ -0.95
CCS1P40202 CCA1YER168C 1641 nt9.13□□□□□ -0.95
CCS1P40202 BOR1YNL275W 1731 nt9.12□□□□□ -0.95
CCS1P40202 VPS60YDR486C 690 nt9.12□□□□□ -0.95
CCS1P40202 SWC5YBR231C 912 nt9.12□□□□□ -0.95
CCS1P40202 TAD3YLR316C 969 nt9.11□□□□□ -0.95
CCS1P40202 UME6YDR207C 2511 nt9.11□□□□□ -0.95
CCS1P40202 YIR016WYIR016W 798 nt9.09□□□□□ -0.95
CCS1P40202 MIC12YBR262C 321 nt9.08□□□□□ -0.96
CCS1P40202 HHO1YPL127C 777 nt9.07□□□□□ -0.96
CCS1P40202 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt9.06□□□□□ -0.96
CCS1P40202 YEL076CYEL076C 651 nt9.06□□□□□ -0.96
CCS1P40202 HUA1YGR268C 597 nt9.06□□□□□ -0.96
CCS1P40202 YLR464WYLR464W 651 nt9.06□□□□□ -0.96
CCS1P40202 ALG3YBL082C 1377 nt9.05□□□□□ -0.96
CCS1P40202 FUR4YBR021W 1902 nt9.03□□□□□ -0.96
CCS1P40202 HSP60YLR259C 1719 nt9.02□□□□□ -0.96
CCS1P40202 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.02□□□□□ -0.97
CCS1P40202 GLK1YCL040W 1503 nt9.01□□□□□ -0.97
CCS1P40202 MRPL8YJL063C 717 nt9.01□□□□□ -0.97
CCS1P40202 ADO1YJR105W 1023 nt9.01□□□□□ -0.97
CCS1P40202 DUS1YML080W 1272 nt9□□□□□ -0.97
CCS1P40202 YGR201CYGR201C 678 nt8.98□□□□□ -0.97
CCS1P40202 YLR415CYLR415C 339 nt8.98□□□□□ -0.97
CCS1P40202 AGP1YCL025C 1902 nt8.95□□□□□ -0.98
CCS1P40202 BDH1YAL060W 1149 nt8.95□□□□□ -0.98
CCS1P40202 XDJ1YLR090W 1380 nt8.93□□□□□ -0.98
CCS1P40202 GDH3YAL062W 1374 nt8.91□□□□□ -0.98
CCS1P40202 YCL074WYCL074W 927 nt8.91□□□□□ -0.98
CCS1P40202 AVT6YER119C 1347 nt8.9□□□□□ -0.98
CCS1P40202 GOR1YNL274C 1053 nt8.9□□□□□ -0.98
CCS1P40202 PRP4YPR178W 1398 nt8.89□□□□□ -0.99
CCS1P40202 TIM17YJL143W 477 nt8.88□□□□□ -0.99
CCS1P40202 BMT6YLR063W 1098 nt8.86□□□□□ -0.99
CCS1P40202 YSP3YOR003W 1437 nt8.86□□□□□ -0.99
CCS1P40202 SHM2YLR058C 1410 nt8.85□□□□□ -0.99
CCS1P40202 YKR005CYKR005C 1578 nt8.83□□□□□ -1
CCS1P40202 DUT1YBR252W 444 nt8.83□□□□□ -1
CCS1P40202 DPS1YLL018C 1674 nt8.82□□□□□ -1
CCS1P40202 AQY2YLL052C 450 nt8.81□□□□□ -1
CCS1P40202 YNL115CYNL115C 1935 nt8.81□□□□□ -1
CCS1P40202 STR3YGL184C 1398 nt8.8□□□□□ -1
CCS1P40202 YGR259CYGR259C 441 nt8.79□□□□□ -1
CCS1P40202 AAC1YMR056C 930 nt8.79□□□□□ -1
CCS1P40202 PEX25YPL112C 1185 nt8.79□□□□□ -1
CCS1P40202 RDN18-1RDN18-1 1800 nt8.77□□□□□ -1.01
CCS1P40202 RDN18-2RDN18-2 1800 nt8.77□□□□□ -1.01
CCS1P40202 YFL066CYFL066C 1179 nt8.74□□□□□ -1.01
CCS1P40202 ALG12YNR030W 1656 nt8.74□□□□□ -1.01
CCS1P40202 NIT1YIL164C 600 nt8.73□□□□□ -1.01
CCS1P40202 MCH5YOR306C 1566 nt8.73□□□□□ -1.01
CCS1P40202 DAT1YML113W 747 nt8.72□□□□□ -1.01
CCS1P40202 VPS75YNL246W 795 nt8.72□□□□□ -1.01
CCS1P40202 SGT2YOR007C 1041 nt8.72□□□□□ -1.01
CCS1P40202 YFR018CYFR018C 1092 nt8.71□□□□□ -1.02
CCS1P40202 YCR102CYCR102C 1107 nt8.7□□□□□ -1.02
CCS1P40202 IRC24YIR036C 792 nt8.69□□□□□ -1.02
CCS1P40202 RTN2YDL204W 1182 nt8.67□□□□□ -1.02
CCS1P40202 PAU7YAR020C 168 nt8.66□□□□□ -1.02
CCS1P40202 SNF1YDR477W 1902 nt8.63□□□□□ -1.03
CCS1P40202 YDR094WYDR094W 336 nt8.63□□□□□ -1.03
CCS1P40202 NBP35YGL091C 987 nt8.63□□□□□ -1.03
CCS1P40202 RRT5YFR032C 870 nt8.62□□□□□ -1.03
CCS1P40202 PRE6YOL038W 765 nt8.61□□□□□ -1.03
CCS1P40202 BIO5YNR056C 1686 nt8.58□□□□□ -1.04
CCS1P40202 ARP6YLR085C 1317 nt8.54□□□□□ -1.04
CCS1P40202 PLB1YMR008C 1995 nt8.54□□□□□ -1.04
CCS1P40202 NAR1YNL240C 1476 nt8.52□□□□□ -1.05
CCS1P40202 TIR3YIL011W 810 nt8.52□□□□□ -1.05
CCS1P40202 SHB17YKR043C 816 nt8.52□□□□□ -1.05
CCS1P40202 LSC2YGR244C 1284 nt8.5□□□□□ -1.05
CCS1P40202 PAU16YKL224C 372 nt8.5□□□□□ -1.05
CCS1P40202 MIR1YJR077C 936 nt8.49□□□□□ -1.05
CCS1P40202 YDR010CYDR010C 333 nt8.48□□□□□ -1.05
CCS1P40202 UBX6YJL048C 1191 nt8.48□□□□□ -1.05
CCS1P40202 GAP1YKR039W 1809 nt8.45□□□□□ -1.06
CCS1P40202 PRO1YDR300C 1287 nt8.45□□□□□ -1.06
CCS1P40202 SHH4YLR164W 507 nt8.45□□□□□ -1.06
CCS1P40202 UBA4YHR111W 1323 nt8.45□□□□□ -1.06
CCS1P40202 RET2YFR051C 1641 nt8.44□□□□□ -1.06
CCS1P40202 THI74YDR438W 1113 nt8.44□□□□□ -1.06
CCS1P40202 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt8.43□□□□□ -1.06
CCS1P40202 CYT2YKL087C 675 nt8.43□□□□□ -1.06
CCS1P40202 POM34YLR018C 900 nt8.43□□□□□ -1.06
CCS1P40202 ATG15YCR068W 1563 nt8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.3 ms