Protein–RNA interactions for Protein: P39986

SPF1, Manganese-transporting ATPase 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPF1P39986 YFL054CYFL054C 1941 nt10.72□□□□□ -0.69
SPF1P39986 YFL067WYFL067W 528 nt10.72□□□□□ -0.69
SPF1P39986 CRR1YLR213C 1269 nt10.72□□□□□ -0.69
SPF1P39986 TRM5YHR070W 1500 nt10.71□□□□□ -0.69
SPF1P39986 AHT1YHR093W 549 nt10.71□□□□□ -0.69
SPF1P39986 SPT8YLR055C 1809 nt10.7□□□□□ -0.7
SPF1P39986 WSC2YNL283C 1512 nt10.69□□□□□ -0.7
SPF1P39986 ATF2YGR177C 1608 nt10.69□□□□□ -0.7
SPF1P39986 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.68□□□□□ -0.7
SPF1P39986 TAD3YLR316C 969 nt10.68□□□□□ -0.7
SPF1P39986 DDR2YOL052C-A 186 nt10.68□□□□□ -0.7
SPF1P39986 UME6YDR207C 2511 nt10.67□□□□□ -0.7
SPF1P39986 LYS4YDR234W 2082 nt10.66□□□□□ -0.7
SPF1P39986 STB1YNL309W 1263 nt10.65□□□□□ -0.7
SPF1P39986 SPC25YER018C 666 nt10.64□□□□□ -0.71
SPF1P39986 BOR1YNL275W 1731 nt10.63□□□□□ -0.71
SPF1P39986 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.62□□□□□ -0.71
SPF1P39986 HEM12YDR047W 1089 nt10.62□□□□□ -0.71
SPF1P39986 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.61□□□□□ -0.71
SPF1P39986 GPI16YHR188C 1833 nt10.61□□□□□ -0.71
SPF1P39986 RPM1RPM1 483 nt10.59□□□□□ -0.71
SPF1P39986 SNG1YGR197C 1644 nt10.58□□□□□ -0.72
SPF1P39986 YGR139WYGR139W 339 nt10.58□□□□□ -0.72
SPF1P39986 CCT4YDL143W 1587 nt10.57□□□□□ -0.72
SPF1P39986 YDR094WYDR094W 336 nt10.56□□□□□ -0.72
SPF1P39986 ANP1YEL036C 1503 nt10.56□□□□□ -0.72
SPF1P39986 MIC10YCL057C-A 294 nt10.55□□□□□ -0.72
SPF1P39986 UBX6YJL048C 1191 nt10.53□□□□□ -0.72
SPF1P39986 FEN2YCR028C 1539 nt10.53□□□□□ -0.72
SPF1P39986 VPS60YDR486C 690 nt10.52□□□□□ -0.73
SPF1P39986 MET8YBR213W 825 nt10.52□□□□□ -0.73
SPF1P39986 SWC5YBR231C 912 nt10.52□□□□□ -0.73
SPF1P39986 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.5□□□□□ -0.73
SPF1P39986 BDH1YAL060W 1149 nt10.49□□□□□ -0.73
SPF1P39986 SWE1YJL187C 2460 nt10.49□□□□□ -0.73
SPF1P39986 CLB6YGR109C 1143 nt10.48□□□□□ -0.73
SPF1P39986 YLR415CYLR415C 339 nt10.48□□□□□ -0.73
SPF1P39986 YFR018CYFR018C 1092 nt10.47□□□□□ -0.73
SPF1P39986 ALG3YBL082C 1377 nt10.45□□□□□ -0.74
SPF1P39986 RAX1YOR301W 1308 nt10.44□□□□□ -0.74
SPF1P39986 YSP3YOR003W 1437 nt10.43□□□□□ -0.74
SPF1P39986 YIR016WYIR016W 798 nt10.43□□□□□ -0.74
SPF1P39986 BNA2YJR078W 1362 nt10.42□□□□□ -0.74
SPF1P39986 PEX25YPL112C 1185 nt10.41□□□□□ -0.74
SPF1P39986 Q0010Q0010 387 nt10.41□□□□□ -0.74
SPF1P39986 HSP60YLR259C 1719 nt10.4□□□□□ -0.74
SPF1P39986 RRT5YFR032C 870 nt10.37□□□□□ -0.75
SPF1P39986 MIC12YBR262C 321 nt10.37□□□□□ -0.75
SPF1P39986 YNL115CYNL115C 1935 nt10.36□□□□□ -0.75
SPF1P39986 YFL066CYFL066C 1179 nt10.33□□□□□ -0.76
SPF1P39986 YJR154WYJR154W 1041 nt10.33□□□□□ -0.76
SPF1P39986 PRE6YOL038W 765 nt10.32□□□□□ -0.76
SPF1P39986 PAU16YKL224C 372 nt10.3□□□□□ -0.76
SPF1P39986 MCH5YOR306C 1566 nt10.3□□□□□ -0.76
SPF1P39986 TIM17YJL143W 477 nt10.28□□□□□ -0.76
SPF1P39986 VPS75YNL246W 795 nt10.28□□□□□ -0.76
SPF1P39986 HHO1YPL127C 777 nt10.28□□□□□ -0.76
SPF1P39986 ALG12YNR030W 1656 nt10.28□□□□□ -0.76
SPF1P39986 GLK1YCL040W 1503 nt10.28□□□□□ -0.76
SPF1P39986 YGR201CYGR201C 678 nt10.27□□□□□ -0.77
SPF1P39986 XDJ1YLR090W 1380 nt10.26□□□□□ -0.77
SPF1P39986 SHM2YLR058C 1410 nt10.23□□□□□ -0.77
SPF1P39986 CCA1YER168C 1641 nt10.22□□□□□ -0.77
SPF1P39986 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.21□□□□□ -0.77
SPF1P39986 GDH3YAL062W 1374 nt10.21□□□□□ -0.78
SPF1P39986 FUR4YBR021W 1902 nt10.2□□□□□ -0.78
SPF1P39986 CSM2YIL132C 642 nt10.16□□□□□ -0.78
SPF1P39986 AVT6YER119C 1347 nt10.13□□□□□ -0.79
SPF1P39986 PAU7YAR020C 168 nt10.13□□□□□ -0.79
SPF1P39986 AGP1YCL025C 1902 nt10.12□□□□□ -0.79
SPF1P39986 NIT1YIL164C 600 nt10.12□□□□□ -0.79
SPF1P39986 GOR1YNL274C 1053 nt10.12□□□□□ -0.79
SPF1P39986 NAT4YMR069W 858 nt10.11□□□□□ -0.79
SPF1P39986 MIR1YJR077C 936 nt10.1□□□□□ -0.79
SPF1P39986 SGT2YOR007C 1041 nt10.1□□□□□ -0.79
SPF1P39986 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt10.08□□□□□ -0.8
SPF1P39986 PRP4YPR178W 1398 nt10.08□□□□□ -0.8
SPF1P39986 DAT1YML113W 747 nt10.07□□□□□ -0.8
SPF1P39986 THI74YDR438W 1113 nt10.06□□□□□ -0.8
SPF1P39986 DUS1YML080W 1272 nt10.04□□□□□ -0.8
SPF1P39986 AAC1YMR056C 930 nt10.03□□□□□ -0.8
SPF1P39986 MSF1YPR047W 1410 nt10.03□□□□□ -0.8
SPF1P39986 DUT1YBR252W 444 nt10.02□□□□□ -0.81
SPF1P39986 DPS1YLL018C 1674 nt10.02□□□□□ -0.81
SPF1P39986 YCR102CYCR102C 1107 nt10□□□□□ -0.81
SPF1P39986 SHB17YKR043C 816 nt10□□□□□ -0.81
SPF1P39986 YCL074WYCL074W 927 nt9.99□□□□□ -0.81
SPF1P39986 UBA4YHR111W 1323 nt9.98□□□□□ -0.81
SPF1P39986 YDR010CYDR010C 333 nt9.96□□□□□ -0.82
SPF1P39986 NAR1YNL240C 1476 nt9.95□□□□□ -0.82
SPF1P39986 PAB1YER165W 1734 nt9.95□□□□□ -0.82
SPF1P39986 STR3YGL184C 1398 nt9.93□□□□□ -0.82
SPF1P39986 YKR005CYKR005C 1578 nt9.92□□□□□ -0.82
SPF1P39986 YSR3YKR053C 1215 nt9.92□□□□□ -0.82
SPF1P39986 BSP1YPR171W 1731 nt9.92□□□□□ -0.82
SPF1P39986 RET2YFR051C 1641 nt9.92□□□□□ -0.82
SPF1P39986 BIO5YNR056C 1686 nt9.9□□□□□ -0.82
SPF1P39986 SNF1YDR477W 1902 nt9.9□□□□□ -0.82
SPF1P39986 AQY2YLL052C 450 nt9.9□□□□□ -0.82
SPF1P39986 NBP35YGL091C 987 nt9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.9 ms