Protein–RNA interactions for Protein: P38722

YHL049C, Uncharacterized protein YHL049C, yeastyeast

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL049CP38722 ANP1YEL036C 1503 nt11.45□□□□□ -0.58
YHL049CP38722 RAX1YOR301W 1308 nt11.44□□□□□ -0.58
YHL049CP38722 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.44□□□□□ -0.58
YHL049CP38722 RTG1YOL067C 534 nt11.44□□□□□ -0.58
YHL049CP38722 SPC25YER018C 666 nt11.43□□□□□ -0.58
YHL049CP38722 WSC2YNL283C 1512 nt11.43□□□□□ -0.58
YHL049CP38722 AHT1YHR093W 549 nt11.41□□□□□ -0.58
YHL049CP38722 FEN2YCR028C 1539 nt11.38□□□□□ -0.59
YHL049CP38722 GPI16YHR188C 1833 nt11.37□□□□□ -0.59
YHL049CP38722 YPR064WYPR064W 420 nt11.37□□□□□ -0.59
YHL049CP38722 CCA1YER168C 1641 nt11.35□□□□□ -0.59
YHL049CP38722 NVJ2YPR091C 2313 nt11.35□□□□□ -0.59
YHL049CP38722 CCT4YDL143W 1587 nt11.34□□□□□ -0.59
YHL049CP38722 VPS60YDR486C 690 nt11.34□□□□□ -0.59
YHL049CP38722 BNA2YJR078W 1362 nt11.33□□□□□ -0.6
YHL049CP38722 YJL225CYJL225C 5277 nt11.29□□□□□ -0.6
YHL049CP38722 ALG3YBL082C 1377 nt11.29□□□□□ -0.6
YHL049CP38722 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.29□□□□□ -0.6
YHL049CP38722 YEL076CYEL076C 651 nt11.29□□□□□ -0.6
YHL049CP38722 YIR016WYIR016W 798 nt11.29□□□□□ -0.6
YHL049CP38722 TAD3YLR316C 969 nt11.29□□□□□ -0.6
YHL049CP38722 YLR464WYLR464W 651 nt11.29□□□□□ -0.6
YHL049CP38722 MIC12YBR262C 321 nt11.29□□□□□ -0.6
YHL049CP38722 SWC5YBR231C 912 nt11.27□□□□□ -0.61
YHL049CP38722 BOR1YNL275W 1731 nt11.26□□□□□ -0.61
YHL049CP38722 HUA1YGR268C 597 nt11.22□□□□□ -0.61
YHL049CP38722 FUR4YBR021W 1902 nt11.21□□□□□ -0.62
YHL049CP38722 HSP60YLR259C 1719 nt11.21□□□□□ -0.62
YHL049CP38722 AGP1YCL025C 1902 nt11.2□□□□□ -0.62
YHL049CP38722 MRPL8YJL063C 717 nt11.2□□□□□ -0.62
YHL049CP38722 HHO1YPL127C 777 nt11.2□□□□□ -0.62
YHL049CP38722 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.17□□□□□ -0.62
YHL049CP38722 BDH1YAL060W 1149 nt11.17□□□□□ -0.62
YHL049CP38722 GLK1YCL040W 1503 nt11.15□□□□□ -0.62
YHL049CP38722 ADO1YJR105W 1023 nt11.14□□□□□ -0.63
YHL049CP38722 YGR201CYGR201C 678 nt11.11□□□□□ -0.63
YHL049CP38722 YLR415CYLR415C 339 nt11.11□□□□□ -0.63
YHL049CP38722 XDJ1YLR090W 1380 nt11.08□□□□□ -0.64
YHL049CP38722 DUS1YML080W 1272 nt11.08□□□□□ -0.64
YHL049CP38722 YSP3YOR003W 1437 nt11.06□□□□□ -0.64
YHL049CP38722 DUT1YBR252W 444 nt11.04□□□□□ -0.64
YHL049CP38722 GDH3YAL062W 1374 nt11.03□□□□□ -0.64
YHL049CP38722 YCL074WYCL074W 927 nt11.03□□□□□ -0.64
YHL049CP38722 PRP4YPR178W 1398 nt11.01□□□□□ -0.65
YHL049CP38722 AVT6YER119C 1347 nt11□□□□□ -0.65
YHL049CP38722 SHM2YLR058C 1410 nt11□□□□□ -0.65
YHL049CP38722 GOR1YNL274C 1053 nt10.97□□□□□ -0.65
YHL049CP38722 YNL115CYNL115C 1935 nt10.96□□□□□ -0.65
YHL049CP38722 TIM17YJL143W 477 nt10.96□□□□□ -0.65
YHL049CP38722 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.95□□□□□ -0.66
YHL049CP38722 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.95□□□□□ -0.66
YHL049CP38722 YKR005CYKR005C 1578 nt10.94□□□□□ -0.66
YHL049CP38722 STR3YGL184C 1398 nt10.94□□□□□ -0.66
YHL049CP38722 DPS1YLL018C 1674 nt10.94□□□□□ -0.66
YHL049CP38722 PEX25YPL112C 1185 nt10.92□□□□□ -0.66
YHL049CP38722 YFL066CYFL066C 1179 nt10.91□□□□□ -0.66
YHL049CP38722 NIT1YIL164C 600 nt10.89□□□□□ -0.67
YHL049CP38722 AQY2YLL052C 450 nt10.88□□□□□ -0.67
YHL049CP38722 YGR259CYGR259C 441 nt10.87□□□□□ -0.67
YHL049CP38722 BMT6YLR063W 1098 nt10.87□□□□□ -0.67
YHL049CP38722 AAC1YMR056C 930 nt10.86□□□□□ -0.67
YHL049CP38722 ALG12YNR030W 1656 nt10.85□□□□□ -0.67
YHL049CP38722 YFR018CYFR018C 1092 nt10.85□□□□□ -0.67
YHL049CP38722 SGT2YOR007C 1041 nt10.84□□□□□ -0.67
YHL049CP38722 DAT1YML113W 747 nt10.83□□□□□ -0.68
YHL049CP38722 VPS75YNL246W 795 nt10.81□□□□□ -0.68
YHL049CP38722 PRE6YOL038W 765 nt10.81□□□□□ -0.68
YHL049CP38722 SNF1YDR477W 1902 nt10.78□□□□□ -0.68
YHL049CP38722 YCR102CYCR102C 1107 nt10.76□□□□□ -0.69
YHL049CP38722 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.76□□□□□ -0.69
YHL049CP38722 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.76□□□□□ -0.69
YHL049CP38722 YDR094WYDR094W 336 nt10.75□□□□□ -0.69
YHL049CP38722 IRC24YIR036C 792 nt10.74□□□□□ -0.69
YHL049CP38722 NBP35YGL091C 987 nt10.73□□□□□ -0.69
YHL049CP38722 RTN2YDL204W 1182 nt10.72□□□□□ -0.69
YHL049CP38722 BIO5YNR056C 1686 nt10.7□□□□□ -0.7
YHL049CP38722 UME6YDR207C 2511 nt10.67□□□□□ -0.7
YHL049CP38722 RRT5YFR032C 870 nt10.67□□□□□ -0.7
YHL049CP38722 PAU7YAR020C 168 nt10.66□□□□□ -0.7
YHL049CP38722 UBX6YJL048C 1191 nt10.63□□□□□ -0.71
YHL049CP38722 PLB1YMR008C 1995 nt10.63□□□□□ -0.71
YHL049CP38722 PAU16YKL224C 372 nt10.62□□□□□ -0.71
YHL049CP38722 ARP6YLR085C 1317 nt10.61□□□□□ -0.71
YHL049CP38722 MCH5YOR306C 1566 nt10.6□□□□□ -0.71
YHL049CP38722 YDR010CYDR010C 333 nt10.58□□□□□ -0.72
YHL049CP38722 MIR1YJR077C 936 nt10.58□□□□□ -0.72
YHL049CP38722 SHB17YKR043C 816 nt10.58□□□□□ -0.72
YHL049CP38722 NAR1YNL240C 1476 nt10.57□□□□□ -0.72
YHL049CP38722 TIR3YIL011W 810 nt10.57□□□□□ -0.72
YHL049CP38722 SHH4YLR164W 507 nt10.57□□□□□ -0.72
YHL049CP38722 PBP1YGR178C 2169 nt10.53□□□□□ -0.72
YHL049CP38722 LSC2YGR244C 1284 nt10.52□□□□□ -0.73
YHL049CP38722 PRO1YDR300C 1287 nt10.5□□□□□ -0.73
YHL049CP38722 SFA1YDL168W 1161 nt10.49□□□□□ -0.73
YHL049CP38722 UBA4YHR111W 1323 nt10.49□□□□□ -0.73
YHL049CP38722 RET2YFR051C 1641 nt10.48□□□□□ -0.73
YHL049CP38722 THI74YDR438W 1113 nt10.48□□□□□ -0.73
YHL049CP38722 POM34YLR018C 900 nt10.48□□□□□ -0.73
YHL049CP38722 GAP1YKR039W 1809 nt10.48□□□□□ -0.73
YHL049CP38722 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.9 ms