Protein–RNA interactions for Protein: P38324

SLX1, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, yeastyeast

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLX1P38324 GAL1YBR020W 1587 nt11.6□□□□□ -0.55
SLX1P38324 RRT12YCR045C 1476 nt11.6□□□□□ -0.55
SLX1P38324 YLR415CYLR415C 339 nt11.6□□□□□ -0.55
SLX1P38324 SIM1YIL123W 1431 nt11.58□□□□□ -0.56
SLX1P38324 TRM5YHR070W 1500 nt11.56□□□□□ -0.56
SLX1P38324 MSF1YPR047W 1410 nt11.56□□□□□ -0.56
SLX1P38324 PCH2YBR186W 1695 nt11.55□□□□□ -0.56
SLX1P38324 YJL225CYJL225C 5277 nt11.54□□□□□ -0.56
SLX1P38324 STB1YNL309W 1263 nt11.54□□□□□ -0.56
SLX1P38324 SEC11YIR022W 504 nt11.52□□□□□ -0.57
SLX1P38324 CCT4YDL143W 1587 nt11.52□□□□□ -0.57
SLX1P38324 THI74YDR438W 1113 nt11.51□□□□□ -0.57
SLX1P38324 SPC25YER018C 666 nt11.5□□□□□ -0.57
SLX1P38324 MIR1YJR077C 936 nt11.5□□□□□ -0.57
SLX1P38324 GUT2YIL155C 1950 nt11.5□□□□□ -0.57
SLX1P38324 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.48□□□□□ -0.57
SLX1P38324 DDR2YOL052C-A 186 nt11.46□□□□□ -0.57
SLX1P38324 SWC5YBR231C 912 nt11.46□□□□□ -0.57
SLX1P38324 GPI16YHR188C 1833 nt11.45□□□□□ -0.58
SLX1P38324 YMR244WYMR244W 1068 nt11.44□□□□□ -0.58
SLX1P38324 ATF2YGR177C 1608 nt11.44□□□□□ -0.58
SLX1P38324 VPS60YDR486C 690 nt11.43□□□□□ -0.58
SLX1P38324 VPS75YNL246W 795 nt11.43□□□□□ -0.58
SLX1P38324 YHL050CYHL050C 2094 nt11.42□□□□□ -0.58
SLX1P38324 YFL067WYFL067W 528 nt11.39□□□□□ -0.59
SLX1P38324 ALG3YBL082C 1377 nt11.38□□□□□ -0.59
SLX1P38324 ERF2YLR246W 1080 nt11.37□□□□□ -0.59
SLX1P38324 DAT1YML113W 747 nt11.37□□□□□ -0.59
SLX1P38324 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.36□□□□□ -0.59
SLX1P38324 Q0182Q0182 405 nt11.36□□□□□ -0.59
SLX1P38324 FEN2YCR028C 1539 nt11.35□□□□□ -0.59
SLX1P38324 PAU7YAR020C 168 nt11.34□□□□□ -0.59
SLX1P38324 SPT8YLR055C 1809 nt11.34□□□□□ -0.59
SLX1P38324 GLR1YPL091W 1452 nt11.33□□□□□ -0.6
SLX1P38324 YGL034CYGL034C 366 nt11.3□□□□□ -0.6
SLX1P38324 CRR1YLR213C 1269 nt11.29□□□□□ -0.6
SLX1P38324 ANP1YEL036C 1503 nt11.29□□□□□ -0.6
SLX1P38324 PIB2YGL023C 1908 nt11.26□□□□□ -0.61
SLX1P38324 UBA4YHR111W 1323 nt11.26□□□□□ -0.61
SLX1P38324 YIR016WYIR016W 798 nt11.24□□□□□ -0.61
SLX1P38324 SNG1YGR197C 1644 nt11.23□□□□□ -0.61
SLX1P38324 TIM17YJL143W 477 nt11.22□□□□□ -0.61
SLX1P38324 NDI1YML120C 1542 nt11.22□□□□□ -0.61
SLX1P38324 HEM12YDR047W 1089 nt11.21□□□□□ -0.61
SLX1P38324 RBG2YGR173W 1107 nt11.21□□□□□ -0.61
SLX1P38324 SHB17YKR043C 816 nt11.21□□□□□ -0.61
SLX1P38324 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.21□□□□□ -0.62
SLX1P38324 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.21□□□□□ -0.62
SLX1P38324 YSR3YKR053C 1215 nt11.2□□□□□ -0.62
SLX1P38324 MIC10YCL057C-A 294 nt11.2□□□□□ -0.62
SLX1P38324 RTF1YGL244W 1677 nt11.19□□□□□ -0.62
SLX1P38324 RBG1YAL036C 1110 nt11.18□□□□□ -0.62
SLX1P38324 XYL2YLR070C 1071 nt11.18□□□□□ -0.62
SLX1P38324 UME6YDR207C 2511 nt11.18□□□□□ -0.62
SLX1P38324 SHM2YLR058C 1410 nt11.14□□□□□ -0.63
SLX1P38324 YDR010CYDR010C 333 nt11.11□□□□□ -0.63
SLX1P38324 LYS4YDR234W 2082 nt11.11□□□□□ -0.63
SLX1P38324 NCP1YHR042W 2076 nt11.1□□□□□ -0.63
SLX1P38324 BOP3YNL042W 1191 nt11.08□□□□□ -0.64
SLX1P38324 XDJ1YLR090W 1380 nt11.07□□□□□ -0.64
SLX1P38324 SGT2YOR007C 1041 nt11.07□□□□□ -0.64
SLX1P38324 PHO89YBR296C 1725 nt11.06□□□□□ -0.64
SLX1P38324 NIT1YIL164C 600 nt11.03□□□□□ -0.64
SLX1P38324 RET2YFR051C 1641 nt11.02□□□□□ -0.65
SLX1P38324 YCR087WYCR087W 516 nt11.01□□□□□ -0.65
SLX1P38324 PTK1YKL198C 1989 nt11.01□□□□□ -0.65
SLX1P38324 BNA2YJR078W 1362 nt11.01□□□□□ -0.65
SLX1P38324 GDH3YAL062W 1374 nt11.01□□□□□ -0.65
SLX1P38324 YMR226CYMR226C 804 nt11□□□□□ -0.65
SLX1P38324 AIM45YPR004C 1035 nt11□□□□□ -0.65
SLX1P38324 RPM1RPM1 483 nt10.95□□□□□ -0.66
SLX1P38324 BOR1YNL275W 1731 nt10.95□□□□□ -0.66
SLX1P38324 MRP20YDR405W 792 nt10.93□□□□□ -0.66
SLX1P38324 SAM1YLR180W 1149 nt10.93□□□□□ -0.66
SLX1P38324 MIC12YBR262C 321 nt10.93□□□□□ -0.66
SLX1P38324 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.91□□□□□ -0.66
SLX1P38324 COQ2YNR041C 1119 nt10.89□□□□□ -0.67
SLX1P38324 HHO1YPL127C 777 nt10.89□□□□□ -0.67
SLX1P38324 RAX1YOR301W 1308 nt10.87□□□□□ -0.67
SLX1P38324 YLR111WYLR111W 333 nt10.86□□□□□ -0.67
SLX1P38324 YGR201CYGR201C 678 nt10.85□□□□□ -0.67
SLX1P38324 AVT6YER119C 1347 nt10.84□□□□□ -0.67
SLX1P38324 SFA1YDL168W 1161 nt10.8□□□□□ -0.68
SLX1P38324 RAD51YER095W 1203 nt10.78□□□□□ -0.68
SLX1P38324 YFL054CYFL054C 1941 nt10.78□□□□□ -0.68
SLX1P38324 GOR1YNL274C 1053 nt10.77□□□□□ -0.69
SLX1P38324 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.75□□□□□ -0.69
SLX1P38324 SDH5YOL071W 489 nt10.75□□□□□ -0.69
SLX1P38324 YCR102CYCR102C 1107 nt10.74□□□□□ -0.69
SLX1P38324 RPL4BYDR012W 1089 nt10.73□□□□□ -0.69
SLX1P38324 RPL4AYBR031W 1089 nt10.73□□□□□ -0.69
SLX1P38324 DUT1YBR252W 444 nt10.7□□□□□ -0.7
SLX1P38324 CLB6YGR109C 1143 nt10.68□□□□□ -0.7
SLX1P38324 RPS14BYJL191W 417 nt10.67□□□□□ -0.7
SLX1P38324 RAD23YEL037C 1197 nt10.66□□□□□ -0.7
SLX1P38324 YNR029CYNR029C 1290 nt10.65□□□□□ -0.7
SLX1P38324 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt10.64□□□□□ -0.71
SLX1P38324 STE4YOR212W 1272 nt10.63□□□□□ -0.71
SLX1P38324 SHH4YLR164W 507 nt10.62□□□□□ -0.71
SLX1P38324 AGP1YCL025C 1902 nt10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.7 ms