Protein–RNA interactions for Protein: P38316

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, yeast

Predictions only

Length 186 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	P38316	FTR1	YER145C	1215 nt		11.23	□□□□□ -0.61
ATG12	P38316	YFL054C	YFL054C	1941 nt		11.22	□□□□□ -0.61
ATG12	P38316	PRE6	YOL038W	765 nt		11.22	□□□□□ -0.61
ATG12	P38316	LYS4	YDR234W	2082 nt		11.2	□□□□□ -0.62
ATG12	P38316	GAL1	YBR020W	1587 nt		11.2	□□□□□ -0.62
ATG12	P38316	TRM5	YHR070W	1500 nt		11.16	□□□□□ -0.62
ATG12	P38316	YFL066C	YFL066C	1179 nt		11.14	□□□□□ -0.63
ATG12	P38316	STB1	YNL309W	1263 nt		11.14	□□□□□ -0.63
ATG12	P38316	DDR2	YOL052C-A	186 nt		11.13	□□□□□ -0.63
ATG12	P38316	PEX25	YPL112C	1185 nt		11.13	□□□□□ -0.63
ATG12	P38316	YLR415C	YLR415C	339 nt		11.12	□□□□□ -0.63
ATG12	P38316	SPT8	YLR055C	1809 nt		11.12	□□□□□ -0.63
ATG12	P38316	BDH1	YAL060W	1149 nt		11.11	□□□□□ -0.63
ATG12	P38316	SPC25	YER018C	666 nt		11.1	□□□□□ -0.63
ATG12	P38316	YFL067W	YFL067W	528 nt		11.1	□□□□□ -0.63
ATG12	P38316	ERF2	YLR246W	1080 nt		11.1	□□□□□ -0.63
ATG12	P38316	CCT4	YDL143W	1587 nt		11.1	□□□□□ -0.63
ATG12	P38316	YDR524C-B	YDR524C-B	201 nt		11.09	□□□□□ -0.63
ATG12	P38316	GPI16	YHR188C	1833 nt		11.09	□□□□□ -0.63
ATG12	P38316	YSP3	YOR003W	1437 nt		11.09	□□□□□ -0.63
ATG12	P38316	YNL115C	YNL115C	1935 nt		11.07	□□□□□ -0.64
ATG12	P38316	ATF2	YGR177C	1608 nt		11.06	□□□□□ -0.64
ATG12	P38316	SBA1	YKL117W	651 nt		11.06	□□□□□ -0.64
ATG12	P38316	CRR1	YLR213C	1269 nt		11.06	□□□□□ -0.64
ATG12	P38316	SWC5	YBR231C	912 nt		11.06	□□□□□ -0.64
ATG12	P38316	NAT4	YMR069W	858 nt		11.05	□□□□□ -0.64
ATG12	P38316	YDL086C-A	YDL086C-A	435 nt		11.02	□□□□□ -0.65
ATG12	P38316	GLK1	YCL040W	1503 nt		11.02	□□□□□ -0.65
ATG12	P38316	VPS60	YDR486C	690 nt		11.01	□□□□□ -0.65
ATG12	P38316	MIC10	YCL057C-A	294 nt		10.99	□□□□□ -0.65
ATG12	P38316	FEN2	YCR028C	1539 nt		10.97	□□□□□ -0.65
ATG12	P38316	SWE1	YJL187C	2460 nt		10.96	□□□□□ -0.65
ATG12	P38316	HEM12	YDR047W	1089 nt		10.95	□□□□□ -0.66
ATG12	P38316	ANP1	YEL036C	1503 nt		10.94	□□□□□ -0.66
ATG12	P38316	VPS75	YNL246W	795 nt		10.94	□□□□□ -0.66
ATG12	P38316	SNG1	YGR197C	1644 nt		10.94	□□□□□ -0.66
ATG12	P38316	ALG3	YBL082C	1377 nt		10.92	□□□□□ -0.66
ATG12	P38316	YHR056W-A	YHR056W-A	435 nt		10.92	□□□□□ -0.66
ATG12	P38316	MSF1	YPR047W	1410 nt		10.91	□□□□□ -0.66
ATG12	P38316	THI74	YDR438W	1113 nt		10.89	□□□□□ -0.67
ATG12	P38316	MIR1	YJR077C	936 nt		10.87	□□□□□ -0.67
ATG12	P38316	YIR016W	YIR016W	798 nt		10.86	□□□□□ -0.67
ATG12	P38316	PAU7	YAR020C	168 nt		10.86	□□□□□ -0.67
ATG12	P38316	TIM17	YJL143W	477 nt		10.82	□□□□□ -0.68
ATG12	P38316	NVJ2	YPR091C	2313 nt		10.82	□□□□□ -0.68
ATG12	P38316	RAX1	YOR301W	1308 nt		10.82	□□□□□ -0.68
ATG12	P38316	BNA2	YJR078W	1362 nt		10.77	□□□□□ -0.68
ATG12	P38316	CCA1	YER168C	1641 nt		10.76	□□□□□ -0.69
ATG12	P38316	DAT1	YML113W	747 nt		10.75	□□□□□ -0.69
ATG12	P38316	SHM2	YLR058C	1410 nt		10.71	□□□□□ -0.69
ATG12	P38316	XDJ1	YLR090W	1380 nt		10.7	□□□□□ -0.7
ATG12	P38316	UBA4	YHR111W	1323 nt		10.7	□□□□□ -0.7
ATG12	P38316	BOR1	YNL275W	1731 nt		10.7	□□□□□ -0.7
ATG12	P38316	YGL034C	YGL034C	366 nt		10.69	□□□□□ -0.7
ATG12	P38316	SHB17	YKR043C	816 nt		10.68	□□□□□ -0.7
ATG12	P38316	MIC12	YBR262C	321 nt		10.68	□□□□□ -0.7
ATG12	P38316	YSR3	YKR053C	1215 nt		10.66	□□□□□ -0.7
ATG12	P38316	GDH3	YAL062W	1374 nt		10.65	□□□□□ -0.7
ATG12	P38316	YMR244W	YMR244W	1068 nt		10.65	□□□□□ -0.7
ATG12	P38316	HSP60	YLR259C	1719 nt		10.64	□□□□□ -0.71
ATG12	P38316	GLR1	YPL091W	1452 nt		10.63	□□□□□ -0.71
ATG12	P38316	FUR4	YBR021W	1902 nt		10.63	□□□□□ -0.71
ATG12	P38316	SGT2	YOR007C	1041 nt		10.62	□□□□□ -0.71
ATG12	P38316	HHO1	YPL127C	777 nt		10.62	□□□□□ -0.71
ATG12	P38316	AGP1	YCL025C	1902 nt		10.62	□□□□□ -0.71
ATG12	P38316	YGR201C	YGR201C	678 nt		10.6	□□□□□ -0.71
ATG12	P38316	NIT1	YIL164C	600 nt		10.59	□□□□□ -0.71
ATG12	P38316	NDI1	YML120C	1542 nt		10.58	□□□□□ -0.72
ATG12	P38316	XYL2	YLR070C	1071 nt		10.58	□□□□□ -0.72
ATG12	P38316	YDR010C	YDR010C	333 nt		10.57	□□□□□ -0.72
ATG12	P38316	YCR087W	YCR087W	516 nt		10.56	□□□□□ -0.72
ATG12	P38316	RBG1	YAL036C	1110 nt		10.56	□□□□□ -0.72
ATG12	P38316	PHO89	YBR296C	1725 nt		10.55	□□□□□ -0.72
ATG12	P38316	RET2	YFR051C	1641 nt		10.53	□□□□□ -0.72
ATG12	P38316	AVT6	YER119C	1347 nt		10.53	□□□□□ -0.72
ATG12	P38316	DUS1	YML080W	1272 nt		10.5	□□□□□ -0.73
ATG12	P38316	GOR1	YNL274C	1053 nt		10.5	□□□□□ -0.73
ATG12	P38316	DUT1	YBR252W	444 nt		10.48	□□□□□ -0.73
ATG12	P38316	AIM45	YPR004C	1035 nt		10.47	□□□□□ -0.73
ATG12	P38316	YJL225C	YJL225C	5277 nt		10.46	□□□□□ -0.73
ATG12	P38316	MRP20	YDR405W	792 nt		10.46	□□□□□ -0.73
ATG12	P38316	RBG2	YGR173W	1107 nt		10.46	□□□□□ -0.73
ATG12	P38316	PRP4	YPR178W	1398 nt		10.44	□□□□□ -0.74
ATG12	P38316	YCL074W	YCL074W	927 nt		10.43	□□□□□ -0.74
ATG12	P38316	YCR102C	YCR102C	1107 nt		10.43	□□□□□ -0.74
ATG12	P38316	YMR226C	YMR226C	804 nt		10.4	□□□□□ -0.74
ATG12	P38316	RDN18-1	RDN18-1	1800 nt		10.38	□□□□□ -0.75
ATG12	P38316	RDN18-2	RDN18-2	1800 nt		10.38	□□□□□ -0.75
ATG12	P38316	YKR005C	YKR005C	1578 nt		10.38	□□□□□ -0.75
ATG12	P38316	DPS1	YLL018C	1674 nt		10.38	□□□□□ -0.75
ATG12	P38316	COQ2	YNR041C	1119 nt		10.37	□□□□□ -0.75
ATG12	P38316	STR3	YGL184C	1398 nt		10.37	□□□□□ -0.75
ATG12	P38316	SFA1	YDL168W	1161 nt		10.32	□□□□□ -0.76
ATG12	P38316	YHL019W-A	YHL019W-A	594 nt		10.32	□□□□□ -0.76
ATG12	P38316	ALG12	YNR030W	1656 nt		10.31	□□□□□ -0.76
ATG12	P38316	AQY2	YLL052C	450 nt		10.31	□□□□□ -0.76
ATG12	P38316	YLR111W	YLR111W	333 nt		10.31	□□□□□ -0.76
ATG12	P38316	RPL4B	YDR012W	1089 nt		10.3	□□□□□ -0.76
ATG12	P38316	YGR259C	YGR259C	441 nt		10.3	□□□□□ -0.76
ATG12	P38316	Q0182	Q0182	405 nt		10.3	□□□□□ -0.76

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.2 ms