Protein–RNA interactions for Protein: P34228

SEF1, Putative transcription factor SEF1, yeastyeast

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Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEF1P34228 TAD3YLR316C 969 nt10.07□□□□□ -0.8
SEF1P34228 AHT1YHR093W 549 nt10.05□□□□□ -0.8
SEF1P34228 YFL066CYFL066C 1179 nt10.03□□□□□ -0.8
SEF1P34228 YLL053CYLL053C 459 nt10.03□□□□□ -0.8
SEF1P34228 BOR1YNL275W 1731 nt10.03□□□□□ -0.8
SEF1P34228 NCP1YHR042W 2076 nt10.02□□□□□ -0.81
SEF1P34228 BOP3YNL042W 1191 nt9.99□□□□□ -0.81
SEF1P34228 PEX25YPL112C 1185 nt9.99□□□□□ -0.81
SEF1P34228 FTR1YER145C 1215 nt9.98□□□□□ -0.81
SEF1P34228 RTF1YGL244W 1677 nt9.98□□□□□ -0.81
SEF1P34228 MCH5YOR306C 1566 nt9.97□□□□□ -0.81
SEF1P34228 NAT4YMR069W 858 nt9.97□□□□□ -0.81
SEF1P34228 AQY1YPR192W 918 nt9.97□□□□□ -0.81
SEF1P34228 ERF2YLR246W 1080 nt9.95□□□□□ -0.82
SEF1P34228 GAL1YBR020W 1587 nt9.94□□□□□ -0.82
SEF1P34228 YSP3YOR003W 1437 nt9.91□□□□□ -0.82
SEF1P34228 BDH1YAL060W 1149 nt9.91□□□□□ -0.82
SEF1P34228 CRR1YLR213C 1269 nt9.91□□□□□ -0.82
SEF1P34228 TRM5YHR070W 1500 nt9.9□□□□□ -0.82
SEF1P34228 YNL115CYNL115C 1935 nt9.89□□□□□ -0.83
SEF1P34228 ATF2YGR177C 1608 nt9.89□□□□□ -0.83
SEF1P34228 GLK1YCL040W 1503 nt9.88□□□□□ -0.83
SEF1P34228 YFL067WYFL067W 528 nt9.88□□□□□ -0.83
SEF1P34228 MSF1YPR047W 1410 nt9.87□□□□□ -0.83
SEF1P34228 LYS4YDR234W 2082 nt9.87□□□□□ -0.83
SEF1P34228 RPM1RPM1 483 nt9.86□□□□□ -0.83
SEF1P34228 SPC25YER018C 666 nt9.85□□□□□ -0.83
SEF1P34228 STB1YNL309W 1263 nt9.84□□□□□ -0.83
SEF1P34228 DDR2YOL052C-A 186 nt9.84□□□□□ -0.83
SEF1P34228 YLR415CYLR415C 339 nt9.83□□□□□ -0.84
SEF1P34228 PTK1YKL198C 1989 nt9.83□□□□□ -0.84
SEF1P34228 MIR1YJR077C 936 nt9.82□□□□□ -0.84
SEF1P34228 YMR244WYMR244W 1068 nt9.82□□□□□ -0.84
SEF1P34228 CCT4YDL143W 1587 nt9.81□□□□□ -0.84
SEF1P34228 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.81□□□□□ -0.84
SEF1P34228 THI74YDR438W 1113 nt9.81□□□□□ -0.84
SEF1P34228 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.8□□□□□ -0.84
SEF1P34228 GPI16YHR188C 1833 nt9.79□□□□□ -0.84
SEF1P34228 ANP1YEL036C 1503 nt9.78□□□□□ -0.84
SEF1P34228 HEM12YDR047W 1089 nt9.78□□□□□ -0.84
SEF1P34228 SNG1YGR197C 1644 nt9.78□□□□□ -0.84
SEF1P34228 VPS60YDR486C 690 nt9.76□□□□□ -0.85
SEF1P34228 MIC10YCL057C-A 294 nt9.75□□□□□ -0.85
SEF1P34228 ALG3YBL082C 1377 nt9.74□□□□□ -0.85
SEF1P34228 VPS75YNL246W 795 nt9.73□□□□□ -0.85
SEF1P34228 SWC5YBR231C 912 nt9.73□□□□□ -0.85
SEF1P34228 FEN2YCR028C 1539 nt9.72□□□□□ -0.85
SEF1P34228 DAT1YML113W 747 nt9.69□□□□□ -0.86
SEF1P34228 GLR1YPL091W 1452 nt9.69□□□□□ -0.86
SEF1P34228 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt9.68□□□□□ -0.86
SEF1P34228 SPT8YLR055C 1809 nt9.66□□□□□ -0.86
SEF1P34228 YFL054CYFL054C 1941 nt9.65□□□□□ -0.86
SEF1P34228 YIR016WYIR016W 798 nt9.64□□□□□ -0.87
SEF1P34228 ALG12YNR030W 1656 nt9.62□□□□□ -0.87
SEF1P34228 YGL034CYGL034C 366 nt9.62□□□□□ -0.87
SEF1P34228 RBG2YGR173W 1107 nt9.62□□□□□ -0.87
SEF1P34228 FRE6YLL051C 2139 nt9.61□□□□□ -0.87
SEF1P34228 RAX1YOR301W 1308 nt9.59□□□□□ -0.87
SEF1P34228 MIC12YBR262C 321 nt9.59□□□□□ -0.87
SEF1P34228 BNA2YJR078W 1362 nt9.58□□□□□ -0.88
SEF1P34228 UBA4YHR111W 1323 nt9.57□□□□□ -0.88
SEF1P34228 PAU7YAR020C 168 nt9.57□□□□□ -0.88
SEF1P34228 NDI1YML120C 1542 nt9.54□□□□□ -0.88
SEF1P34228 TIM17YJL143W 477 nt9.53□□□□□ -0.88
SEF1P34228 SHB17YKR043C 816 nt9.53□□□□□ -0.88
SEF1P34228 YSR3YKR053C 1215 nt9.51□□□□□ -0.89
SEF1P34228 SHM2YLR058C 1410 nt9.5□□□□□ -0.89
SEF1P34228 RBG1YAL036C 1110 nt9.49□□□□□ -0.89
SEF1P34228 XYL2YLR070C 1071 nt9.49□□□□□ -0.89
SEF1P34228 XDJ1YLR090W 1380 nt9.49□□□□□ -0.89
SEF1P34228 YGR201CYGR201C 678 nt9.48□□□□□ -0.89
SEF1P34228 SWE1YJL187C 2460 nt9.47□□□□□ -0.89
SEF1P34228 HSP60YLR259C 1719 nt9.47□□□□□ -0.89
SEF1P34228 YDR010CYDR010C 333 nt9.45□□□□□ -0.9
SEF1P34228 HHO1YPL127C 777 nt9.45□□□□□ -0.9
SEF1P34228 NIT1YIL164C 600 nt9.44□□□□□ -0.9
SEF1P34228 SGT2YOR007C 1041 nt9.43□□□□□ -0.9
SEF1P34228 CCA1YER168C 1641 nt9.42□□□□□ -0.9
SEF1P34228 GDH3YAL062W 1374 nt9.41□□□□□ -0.9
SEF1P34228 YMR226CYMR226C 804 nt9.39□□□□□ -0.91
SEF1P34228 SAM1YLR180W 1149 nt9.38□□□□□ -0.91
SEF1P34228 RET2YFR051C 1641 nt9.38□□□□□ -0.91
SEF1P34228 PHO89YBR296C 1725 nt9.37□□□□□ -0.91
SEF1P34228 YCR087WYCR087W 516 nt9.37□□□□□ -0.91
SEF1P34228 AIM45YPR004C 1035 nt9.37□□□□□ -0.91
SEF1P34228 AGP1YCL025C 1902 nt9.37□□□□□ -0.91
SEF1P34228 NAR1YNL240C 1476 nt9.35□□□□□ -0.91
SEF1P34228 AVT6YER119C 1347 nt9.33□□□□□ -0.92
SEF1P34228 RAD51YER095W 1203 nt9.31□□□□□ -0.92
SEF1P34228 GOR1YNL274C 1053 nt9.3□□□□□ -0.92
SEF1P34228 DUT1YBR252W 444 nt9.26□□□□□ -0.93
SEF1P34228 COQ2YNR041C 1119 nt9.25□□□□□ -0.93
SEF1P34228 MRP20YDR405W 792 nt9.24□□□□□ -0.93
SEF1P34228 HSL7YBR133C 2484 nt9.23□□□□□ -0.93
SEF1P34228 YCR102CYCR102C 1107 nt9.23□□□□□ -0.93
SEF1P34228 YLR111WYLR111W 333 nt9.23□□□□□ -0.93
SEF1P34228 SFA1YDL168W 1161 nt9.21□□□□□ -0.94
SEF1P34228 DUS1YML080W 1272 nt9.21□□□□□ -0.94
SEF1P34228 CMP2YML057W 1815 nt9.21□□□□□ -0.94
SEF1P34228 YCL074WYCL074W 927 nt9.18□□□□□ -0.94
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