Protein–RNA interactions for Protein: P34220

YBL055C, Deoxyribonuclease Tat-D, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBL055CP34220 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.46□□□□□ -0.57
YBL055CP34220 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.44□□□□□ -0.58
YBL055CP34220 YJL225CYJL225C 5277 nt11.43□□□□□ -0.58
YBL055CP34220 SWE1YJL187C 2460 nt11.43□□□□□ -0.58
YBL055CP34220 WSC2YNL283C 1512 nt11.42□□□□□ -0.58
YBL055CP34220 STB1YNL309W 1263 nt11.42□□□□□ -0.58
YBL055CP34220 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.41□□□□□ -0.58
YBL055CP34220 SPC25YER018C 666 nt11.4□□□□□ -0.58
YBL055CP34220 AHT1YHR093W 549 nt11.4□□□□□ -0.58
YBL055CP34220 ANP1YEL036C 1503 nt11.4□□□□□ -0.59
YBL055CP34220 YPR064WYPR064W 420 nt11.37□□□□□ -0.59
YBL055CP34220 RAX1YOR301W 1308 nt11.36□□□□□ -0.59
YBL055CP34220 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.36□□□□□ -0.59
YBL055CP34220 YEL076CYEL076C 651 nt11.36□□□□□ -0.59
YBL055CP34220 YLR464WYLR464W 651 nt11.36□□□□□ -0.59
YBL055CP34220 FEN2YCR028C 1539 nt11.35□□□□□ -0.59
YBL055CP34220 GPI16YHR188C 1833 nt11.34□□□□□ -0.59
YBL055CP34220 CCT4YDL143W 1587 nt11.32□□□□□ -0.6
YBL055CP34220 VPS60YDR486C 690 nt11.31□□□□□ -0.6
YBL055CP34220 MRPL8YJL063C 717 nt11.3□□□□□ -0.6
YBL055CP34220 TAD3YLR316C 969 nt11.3□□□□□ -0.6
YBL055CP34220 HUA1YGR268C 597 nt11.28□□□□□ -0.6
YBL055CP34220 BNA2YJR078W 1362 nt11.28□□□□□ -0.6
YBL055CP34220 YIR016WYIR016W 798 nt11.26□□□□□ -0.61
YBL055CP34220 CCA1YER168C 1641 nt11.26□□□□□ -0.61
YBL055CP34220 ALG3YBL082C 1377 nt11.26□□□□□ -0.61
YBL055CP34220 HSP60YLR259C 1719 nt11.25□□□□□ -0.61
YBL055CP34220 SWC5YBR231C 912 nt11.24□□□□□ -0.61
YBL055CP34220 MIC12YBR262C 321 nt11.24□□□□□ -0.61
YBL055CP34220 ADO1YJR105W 1023 nt11.23□□□□□ -0.61
YBL055CP34220 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.19□□□□□ -0.62
YBL055CP34220 BDH1YAL060W 1149 nt11.16□□□□□ -0.62
YBL055CP34220 HHO1YPL127C 777 nt11.15□□□□□ -0.62
YBL055CP34220 GLK1YCL040W 1503 nt11.14□□□□□ -0.63
YBL055CP34220 UME6YDR207C 2511 nt11.13□□□□□ -0.63
YBL055CP34220 YLR415CYLR415C 339 nt11.12□□□□□ -0.63
YBL055CP34220 AGP1YCL025C 1902 nt11.11□□□□□ -0.63
YBL055CP34220 FUR4YBR021W 1902 nt11.08□□□□□ -0.64
YBL055CP34220 YSP3YOR003W 1437 nt11.07□□□□□ -0.64
YBL055CP34220 YGR201CYGR201C 678 nt11.06□□□□□ -0.64
YBL055CP34220 ALG12YNR030W 1656 nt11.05□□□□□ -0.64
YBL055CP34220 XDJ1YLR090W 1380 nt11.04□□□□□ -0.64
YBL055CP34220 DUS1YML080W 1272 nt11□□□□□ -0.65
YBL055CP34220 GDH3YAL062W 1374 nt11□□□□□ -0.65
YBL055CP34220 DUT1YBR252W 444 nt10.99□□□□□ -0.65
YBL055CP34220 SHM2YLR058C 1410 nt10.97□□□□□ -0.65
YBL055CP34220 YNL115CYNL115C 1935 nt10.97□□□□□ -0.65
YBL055CP34220 AVT6YER119C 1347 nt10.96□□□□□ -0.65
YBL055CP34220 MCH5YOR306C 1566 nt10.94□□□□□ -0.66
YBL055CP34220 YCL074WYCL074W 927 nt10.94□□□□□ -0.66
YBL055CP34220 YFL066CYFL066C 1179 nt10.94□□□□□ -0.66
YBL055CP34220 TIM17YJL143W 477 nt10.94□□□□□ -0.66
YBL055CP34220 PEX25YPL112C 1185 nt10.94□□□□□ -0.66
YBL055CP34220 PRP4YPR178W 1398 nt10.93□□□□□ -0.66
YBL055CP34220 GOR1YNL274C 1053 nt10.93□□□□□ -0.66
YBL055CP34220 YFR018CYFR018C 1092 nt10.9□□□□□ -0.66
YBL055CP34220 NIT1YIL164C 600 nt10.87□□□□□ -0.67
YBL055CP34220 DPS1YLL018C 1674 nt10.87□□□□□ -0.67
YBL055CP34220 STR3YGL184C 1398 nt10.87□□□□□ -0.67
YBL055CP34220 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.86□□□□□ -0.67
YBL055CP34220 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.86□□□□□ -0.67
YBL055CP34220 AAC1YMR056C 930 nt10.86□□□□□ -0.67
YBL055CP34220 PRE6YOL038W 765 nt10.86□□□□□ -0.67
YBL055CP34220 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.84□□□□□ -0.67
YBL055CP34220 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.84□□□□□ -0.67
YBL055CP34220 YDR094WYDR094W 336 nt10.84□□□□□ -0.67
YBL055CP34220 YKR005CYKR005C 1578 nt10.83□□□□□ -0.68
YBL055CP34220 VPS75YNL246W 795 nt10.82□□□□□ -0.68
YBL055CP34220 SGT2YOR007C 1041 nt10.82□□□□□ -0.68
YBL055CP34220 AQY2YLL052C 450 nt10.81□□□□□ -0.68
YBL055CP34220 BMT6YLR063W 1098 nt10.79□□□□□ -0.68
YBL055CP34220 DAT1YML113W 747 nt10.79□□□□□ -0.68
YBL055CP34220 YGR259CYGR259C 441 nt10.77□□□□□ -0.69
YBL055CP34220 UBX6YJL048C 1191 nt10.76□□□□□ -0.69
YBL055CP34220 NAR1YNL240C 1476 nt10.74□□□□□ -0.69
YBL055CP34220 RRT5YFR032C 870 nt10.73□□□□□ -0.69
YBL055CP34220 YCR102CYCR102C 1107 nt10.72□□□□□ -0.69
YBL055CP34220 SNF1YDR477W 1902 nt10.72□□□□□ -0.69
YBL055CP34220 BIO5YNR056C 1686 nt10.71□□□□□ -0.69
YBL055CP34220 NBP35YGL091C 987 nt10.69□□□□□ -0.7
YBL055CP34220 PAU16YKL224C 372 nt10.68□□□□□ -0.7
YBL055CP34220 PAU7YAR020C 168 nt10.68□□□□□ -0.7
YBL055CP34220 RTN2YDL204W 1182 nt10.65□□□□□ -0.7
YBL055CP34220 IRC24YIR036C 792 nt10.63□□□□□ -0.71
YBL055CP34220 MIR1YJR077C 936 nt10.61□□□□□ -0.71
YBL055CP34220 PBP1YGR178C 2169 nt10.6□□□□□ -0.71
YBL055CP34220 YDR010CYDR010C 333 nt10.59□□□□□ -0.71
YBL055CP34220 SHB17YKR043C 816 nt10.59□□□□□ -0.71
YBL055CP34220 CYT2YKL087C 675 nt10.56□□□□□ -0.72
YBL055CP34220 ARP6YLR085C 1317 nt10.56□□□□□ -0.72
YBL055CP34220 SHH4YLR164W 507 nt10.55□□□□□ -0.72
YBL055CP34220 PLB1YMR008C 1995 nt10.55□□□□□ -0.72
YBL055CP34220 TIR3YIL011W 810 nt10.53□□□□□ -0.72
YBL055CP34220 THI74YDR438W 1113 nt10.52□□□□□ -0.73
YBL055CP34220 UBA4YHR111W 1323 nt10.51□□□□□ -0.73
YBL055CP34220 RET2YFR051C 1641 nt10.48□□□□□ -0.73
YBL055CP34220 SFA1YDL168W 1161 nt10.48□□□□□ -0.73
YBL055CP34220 LSC2YGR244C 1284 nt10.47□□□□□ -0.73
YBL055CP34220 NAT4YMR069W 858 nt10.47□□□□□ -0.73
YBL055CP34220 PRO1YDR300C 1287 nt10.46□□□□□ -0.73
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