Protein–RNA interactions for Protein: P32829

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, yeastyeast

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MRE11P32829 DDR2YOL052C-A 186 nt11.01□□□□□ -0.65
MRE11P32829 CCA1YER168C 1641 nt11□□□□□ -0.65
MRE11P32829 GAL1YBR020W 1587 nt10.99□□□□□ -0.65
MRE11P32829 ALG12YNR030W 1656 nt10.99□□□□□ -0.65
MRE11P32829 TRM5YHR070W 1500 nt10.99□□□□□ -0.65
MRE11P32829 DIC1YLR348C 897 nt10.98□□□□□ -0.65
MRE11P32829 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.95□□□□□ -0.66
MRE11P32829 AQY1YPR192W 918 nt10.93□□□□□ -0.66
MRE11P32829 BNA2YJR078W 1362 nt10.92□□□□□ -0.66
MRE11P32829 PRP4YPR178W 1398 nt10.92□□□□□ -0.66
MRE11P32829 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.9□□□□□ -0.66
MRE11P32829 YEL076CYEL076C 651 nt10.9□□□□□ -0.66
MRE11P32829 YLR464WYLR464W 651 nt10.9□□□□□ -0.66
MRE11P32829 ANP1YEL036C 1503 nt10.89□□□□□ -0.67
MRE11P32829 AAC1YMR056C 930 nt10.87□□□□□ -0.67
MRE11P32829 BMT6YLR063W 1098 nt10.84□□□□□ -0.67
MRE11P32829 DPS1YLL018C 1674 nt10.84□□□□□ -0.67
MRE11P32829 MIC12YBR262C 321 nt10.83□□□□□ -0.68
MRE11P32829 STB1YNL309W 1263 nt10.82□□□□□ -0.68
MRE11P32829 WSC2YNL283C 1512 nt10.81□□□□□ -0.68
MRE11P32829 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.81□□□□□ -0.68
MRE11P32829 SPC25YER018C 666 nt10.81□□□□□ -0.68
MRE11P32829 YLR235CYLR235C 399 nt10.79□□□□□ -0.68
MRE11P32829 GPI16YHR188C 1833 nt10.79□□□□□ -0.68
MRE11P32829 FEN2YCR028C 1539 nt10.79□□□□□ -0.68
MRE11P32829 YKR005CYKR005C 1578 nt10.77□□□□□ -0.68
MRE11P32829 DUS1YML080W 1272 nt10.77□□□□□ -0.69
MRE11P32829 TIM23YNR017W 669 nt10.77□□□□□ -0.69
MRE11P32829 YCL074WYCL074W 927 nt10.76□□□□□ -0.69
MRE11P32829 HHO1YPL127C 777 nt10.76□□□□□ -0.69
MRE11P32829 PTH1YHR189W 573 nt10.75□□□□□ -0.69
MRE11P32829 YLR179CYLR179C 606 nt10.75□□□□□ -0.69
MRE11P32829 AGP1YCL025C 1902 nt10.73□□□□□ -0.69
MRE11P32829 YIR016WYIR016W 798 nt10.71□□□□□ -0.69
MRE11P32829 YGR259CYGR259C 441 nt10.69□□□□□ -0.7
MRE11P32829 YGR201CYGR201C 678 nt10.68□□□□□ -0.7
MRE11P32829 CCT4YDL143W 1587 nt10.68□□□□□ -0.7
MRE11P32829 VPS60YDR486C 690 nt10.67□□□□□ -0.7
MRE11P32829 NAR1YNL240C 1476 nt10.67□□□□□ -0.7
MRE11P32829 AHT1YHR093W 549 nt10.65□□□□□ -0.7
MRE11P32829 IRC24YIR036C 792 nt10.65□□□□□ -0.7
MRE11P32829 SNF1YDR477W 1902 nt10.63□□□□□ -0.71
MRE11P32829 SWC5YBR231C 912 nt10.63□□□□□ -0.71
MRE11P32829 BIO5YNR056C 1686 nt10.62□□□□□ -0.71
MRE11P32829 YKL030WYKL030W 606 nt10.6□□□□□ -0.71
MRE11P32829 SPP1YPL138C 1062 nt10.6□□□□□ -0.71
MRE11P32829 YPR064WYPR064W 420 nt10.6□□□□□ -0.71
MRE11P32829 ALG3YBL082C 1377 nt10.59□□□□□ -0.71
MRE11P32829 XDJ1YLR090W 1380 nt10.58□□□□□ -0.72
MRE11P32829 STR3YGL184C 1398 nt10.55□□□□□ -0.72
MRE11P32829 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.53□□□□□ -0.72
MRE11P32829 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.53□□□□□ -0.72
MRE11P32829 CYT2YKL087C 675 nt10.52□□□□□ -0.73
MRE11P32829 GOR1YNL274C 1053 nt10.52□□□□□ -0.73
MRE11P32829 PBP1YGR178C 2169 nt10.52□□□□□ -0.73
MRE11P32829 TAD3YLR316C 969 nt10.5□□□□□ -0.73
MRE11P32829 AVT6YER119C 1347 nt10.49□□□□□ -0.73
MRE11P32829 AQY2YLL052C 450 nt10.47□□□□□ -0.73
MRE11P32829 DUT1YBR252W 444 nt10.47□□□□□ -0.73
MRE11P32829 GDH3YAL062W 1374 nt10.46□□□□□ -0.74
MRE11P32829 HSL7YBR133C 2484 nt10.45□□□□□ -0.74
MRE11P32829 RTN2YDL204W 1182 nt10.45□□□□□ -0.74
MRE11P32829 YLR415CYLR415C 339 nt10.37□□□□□ -0.75
MRE11P32829 BDH1YAL060W 1149 nt10.34□□□□□ -0.75
MRE11P32829 SHM2YLR058C 1410 nt10.33□□□□□ -0.76
MRE11P32829 FRE6YLL051C 2139 nt10.33□□□□□ -0.76
MRE11P32829 TIM17YJL143W 477 nt10.33□□□□□ -0.76
MRE11P32829 SSN3YPL042C 1668 nt10.33□□□□□ -0.76
MRE11P32829 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.31□□□□□ -0.76
MRE11P32829 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.31□□□□□ -0.76
MRE11P32829 CMP2YML057W 1815 nt10.29□□□□□ -0.76
MRE11P32829 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.29□□□□□ -0.76
MRE11P32829 DAT1YML113W 747 nt10.29□□□□□ -0.76
MRE11P32829 YCR102CYCR102C 1107 nt10.24□□□□□ -0.77
MRE11P32829 RTG1YOL067C 534 nt10.23□□□□□ -0.77
MRE11P32829 NBP35YGL091C 987 nt10.21□□□□□ -0.77
MRE11P32829 NIT1YIL164C 600 nt10.21□□□□□ -0.77
MRE11P32829 ARP6YLR085C 1317 nt10.21□□□□□ -0.78
MRE11P32829 YSP3YOR003W 1437 nt10.21□□□□□ -0.78
MRE11P32829 PLB1YMR008C 1995 nt10.21□□□□□ -0.78
MRE11P32829 NDI1YML120C 1542 nt10.2□□□□□ -0.78
MRE11P32829 YAT1YAR035W 2064 nt10.19□□□□□ -0.78
MRE11P32829 ALD4YOR374W 1560 nt10.16□□□□□ -0.78
MRE11P32829 SGT2YOR007C 1041 nt10.15□□□□□ -0.78
MRE11P32829 HUA1YGR268C 597 nt10.14□□□□□ -0.79
MRE11P32829 HIF1YLL022C 1158 nt10.14□□□□□ -0.79
MRE11P32829 GID7YCL039W 2238 nt10.11□□□□□ -0.79
MRE11P32829 PRM5YIL117C 957 nt10.11□□□□□ -0.79
MRE11P32829 INA1YLR413W 2028 nt10.09□□□□□ -0.79
MRE11P32829 SPT20YOL148C 1815 nt10.08□□□□□ -0.8
MRE11P32829 YNL115CYNL115C 1935 nt10.08□□□□□ -0.8
MRE11P32829 LSC2YGR244C 1284 nt10.06□□□□□ -0.8
MRE11P32829 SAM35YHR083W 990 nt10.06□□□□□ -0.8
MRE11P32829 HEL2YDR266C 1920 nt10.04□□□□□ -0.8
MRE11P32829 VPS75YNL246W 795 nt10.04□□□□□ -0.8
MRE11P32829 PEX25YPL112C 1185 nt10.04□□□□□ -0.8
MRE11P32829 UTR1YJR049C 1593 nt10.04□□□□□ -0.8
MRE11P32829 TIR3YIL011W 810 nt10.03□□□□□ -0.8
MRE11P32829 GAP1YKR039W 1809 nt10.02□□□□□ -0.81
MRE11P32829 ZRT3YKL175W 1512 nt10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.9 ms