Protein–RNA interactions for Protein: P29478

SEC65, Signal recognition particle subunit SEC65, yeastyeast

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC65P29478 YLR179CYLR179C 606 nt11.9□□□□□ -0.5
SEC65P29478 WSC2YNL283C 1512 nt11.87□□□□□ -0.51
SEC65P29478 SPC25YER018C 666 nt11.87□□□□□ -0.51
SEC65P29478 STB1YNL309W 1263 nt11.87□□□□□ -0.51
SEC65P29478 RAX1YOR301W 1308 nt11.86□□□□□ -0.51
SEC65P29478 YKL030WYKL030W 606 nt11.86□□□□□ -0.51
SEC65P29478 RTG1YOL067C 534 nt11.85□□□□□ -0.51
SEC65P29478 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.84□□□□□ -0.51
SEC65P29478 AHT1YHR093W 549 nt11.84□□□□□ -0.51
SEC65P29478 CCA1YER168C 1641 nt11.84□□□□□ -0.51
SEC65P29478 FEN2YCR028C 1539 nt11.8□□□□□ -0.52
SEC65P29478 MIC12YBR262C 321 nt11.77□□□□□ -0.53
SEC65P29478 GPI16YHR188C 1833 nt11.76□□□□□ -0.53
SEC65P29478 VPS60YDR486C 690 nt11.76□□□□□ -0.53
SEC65P29478 CCT4YDL143W 1587 nt11.75□□□□□ -0.53
SEC65P29478 ALG3YBL082C 1377 nt11.75□□□□□ -0.53
SEC65P29478 BOR1YNL275W 1731 nt11.74□□□□□ -0.53
SEC65P29478 YJL225CYJL225C 5277 nt11.72□□□□□ -0.53
SEC65P29478 HSP60YLR259C 1719 nt11.72□□□□□ -0.53
SEC65P29478 YIR016WYIR016W 798 nt11.72□□□□□ -0.53
SEC65P29478 YPR064WYPR064W 420 nt11.72□□□□□ -0.53
SEC65P29478 BNA2YJR078W 1362 nt11.7□□□□□ -0.54
SEC65P29478 FUR4YBR021W 1902 nt11.7□□□□□ -0.54
SEC65P29478 AGP1YCL025C 1902 nt11.7□□□□□ -0.54
SEC65P29478 TAD3YLR316C 969 nt11.68□□□□□ -0.54
SEC65P29478 GLK1YCL040W 1503 nt11.64□□□□□ -0.55
SEC65P29478 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.63□□□□□ -0.55
SEC65P29478 YEL076CYEL076C 651 nt11.63□□□□□ -0.55
SEC65P29478 YLR464WYLR464W 651 nt11.63□□□□□ -0.55
SEC65P29478 SWC5YBR231C 912 nt11.63□□□□□ -0.55
SEC65P29478 HHO1YPL127C 777 nt11.6□□□□□ -0.55
SEC65P29478 BDH1YAL060W 1149 nt11.59□□□□□ -0.55
SEC65P29478 XDJ1YLR090W 1380 nt11.55□□□□□ -0.56
SEC65P29478 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.53□□□□□ -0.56
SEC65P29478 YGR201CYGR201C 678 nt11.52□□□□□ -0.57
SEC65P29478 HUA1YGR268C 597 nt11.52□□□□□ -0.57
SEC65P29478 MRPL8YJL063C 717 nt11.52□□□□□ -0.57
SEC65P29478 DUT1YBR252W 444 nt11.52□□□□□ -0.57
SEC65P29478 YSP3YOR003W 1437 nt11.47□□□□□ -0.57
SEC65P29478 YLR415CYLR415C 339 nt11.47□□□□□ -0.57
SEC65P29478 DUS1YML080W 1272 nt11.47□□□□□ -0.57
SEC65P29478 PRP4YPR178W 1398 nt11.46□□□□□ -0.57
SEC65P29478 YCL074WYCL074W 927 nt11.46□□□□□ -0.57
SEC65P29478 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.44□□□□□ -0.58
SEC65P29478 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.44□□□□□ -0.58
SEC65P29478 ADO1YJR105W 1023 nt11.42□□□□□ -0.58
SEC65P29478 DPS1YLL018C 1674 nt11.42□□□□□ -0.58
SEC65P29478 GDH3YAL062W 1374 nt11.41□□□□□ -0.58
SEC65P29478 YKR005CYKR005C 1578 nt11.41□□□□□ -0.58
SEC65P29478 STR3YGL184C 1398 nt11.41□□□□□ -0.58
SEC65P29478 SHM2YLR058C 1410 nt11.4□□□□□ -0.58
SEC65P29478 AVT6YER119C 1347 nt11.39□□□□□ -0.59
SEC65P29478 ALG12YNR030W 1656 nt11.38□□□□□ -0.59
SEC65P29478 GOR1YNL274C 1053 nt11.33□□□□□ -0.6
SEC65P29478 YNL115CYNL115C 1935 nt11.33□□□□□ -0.6
SEC65P29478 NIT1YIL164C 600 nt11.32□□□□□ -0.6
SEC65P29478 YGR259CYGR259C 441 nt11.31□□□□□ -0.6
SEC65P29478 TIM17YJL143W 477 nt11.31□□□□□ -0.6
SEC65P29478 AAC1YMR056C 930 nt11.31□□□□□ -0.6
SEC65P29478 SNF1YDR477W 1902 nt11.31□□□□□ -0.6
SEC65P29478 UME6YDR207C 2511 nt11.31□□□□□ -0.6
SEC65P29478 PEX25YPL112C 1185 nt11.3□□□□□ -0.6
SEC65P29478 YFL066CYFL066C 1179 nt11.29□□□□□ -0.6
SEC65P29478 AQY2YLL052C 450 nt11.26□□□□□ -0.61
SEC65P29478 BMT6YLR063W 1098 nt11.26□□□□□ -0.61
SEC65P29478 DAT1YML113W 747 nt11.25□□□□□ -0.61
SEC65P29478 SGT2YOR007C 1041 nt11.23□□□□□ -0.61
SEC65P29478 BIO5YNR056C 1686 nt11.23□□□□□ -0.61
SEC65P29478 YFR018CYFR018C 1092 nt11.21□□□□□ -0.61
SEC65P29478 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.2□□□□□ -0.62
SEC65P29478 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.2□□□□□ -0.62
SEC65P29478 PRE6YOL038W 765 nt11.2□□□□□ -0.62
SEC65P29478 IRC24YIR036C 792 nt11.19□□□□□ -0.62
SEC65P29478 VPS75YNL246W 795 nt11.18□□□□□ -0.62
SEC65P29478 NBP35YGL091C 987 nt11.17□□□□□ -0.62
SEC65P29478 MCH5YOR306C 1566 nt11.16□□□□□ -0.62
SEC65P29478 RTN2YDL204W 1182 nt11.15□□□□□ -0.62
SEC65P29478 YCR102CYCR102C 1107 nt11.13□□□□□ -0.63
SEC65P29478 PBP1YGR178C 2169 nt11.07□□□□□ -0.64
SEC65P29478 YDR094WYDR094W 336 nt11.07□□□□□ -0.64
SEC65P29478 NAR1YNL240C 1476 nt11.06□□□□□ -0.64
SEC65P29478 ARP6YLR085C 1317 nt11.06□□□□□ -0.64
SEC65P29478 PLB1YMR008C 1995 nt11.05□□□□□ -0.64
SEC65P29478 SHH4YLR164W 507 nt11.02□□□□□ -0.65
SEC65P29478 YDR010CYDR010C 333 nt10.99□□□□□ -0.65
SEC65P29478 MIR1YJR077C 936 nt10.96□□□□□ -0.65
SEC65P29478 TIR3YIL011W 810 nt10.95□□□□□ -0.66
SEC65P29478 UBX6YJL048C 1191 nt10.95□□□□□ -0.66
SEC65P29478 CYT2YKL087C 675 nt10.95□□□□□ -0.66
SEC65P29478 PAU16YKL224C 372 nt10.95□□□□□ -0.66
SEC65P29478 RRT5YFR032C 870 nt10.94□□□□□ -0.66
SEC65P29478 SHB17YKR043C 816 nt10.94□□□□□ -0.66
SEC65P29478 PAU7YAR020C 168 nt10.93□□□□□ -0.66
SEC65P29478 SFA1YDL168W 1161 nt10.9□□□□□ -0.66
SEC65P29478 LSC2YGR244C 1284 nt10.9□□□□□ -0.66
SEC65P29478 PRM5YIL117C 957 nt10.9□□□□□ -0.66
SEC65P29478 PRO1YDR300C 1287 nt10.89□□□□□ -0.67
SEC65P29478 POM34YLR018C 900 nt10.89□□□□□ -0.67
SEC65P29478 UTR1YJR049C 1593 nt10.88□□□□□ -0.67
SEC65P29478 GAP1YKR039W 1809 nt10.87□□□□□ -0.67
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