Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms