Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms