Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
IL1RAPQ9NPH3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IL1RAPQ9NPH3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IL1RAPQ9NPH3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IL1RAPQ9NPH3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IL1RAPQ9NPH3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IL1RAPQ9NPH3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IL1RAPQ9NPH3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
IL1RAPQ9NPH3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IL1RAPQ9NPH3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IL1RAPQ9NPH3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IL1RAPQ9NPH3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IL1RAPQ9NPH3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IL1RAPQ9NPH3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IL1RAPQ9NPH3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
IL1RAPQ9NPH3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IL1RAPQ9NPH3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IL1RAPQ9NPH3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IL1RAPQ9NPH3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IL1RAPQ9NPH3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IL1RAPQ9NPH3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IL1RAPQ9NPH3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IL1RAPQ9NPH3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IL1RAPQ9NPH3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IL1RAPQ9NPH3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IL1RAPQ9NPH3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IL1RAPQ9NPH3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IL1RAPQ9NPH3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IL1RAPQ9NPH3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IL1RAPQ9NPH3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IL1RAPQ9NPH3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IL1RAPQ9NPH3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IL1RAPQ9NPH3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IL1RAPQ9NPH3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
IL1RAPQ9NPH3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IL1RAPQ9NPH3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IL1RAPQ9NPH3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IL1RAPQ9NPH3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IL1RAPQ9NPH3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
IL1RAPQ9NPH3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
IL1RAPQ9NPH3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
IL1RAPQ9NPH3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
IL1RAPQ9NPH3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IL1RAPQ9NPH3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms