Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN3

TMEM8A, Post-GPI attachment to proteins factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM8AQ9HCN3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM8AQ9HCN3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM8AQ9HCN3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM8AQ9HCN3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM8AQ9HCN3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM8AQ9HCN3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM8AQ9HCN3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM8AQ9HCN3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM8AQ9HCN3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM8AQ9HCN3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM8AQ9HCN3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM8AQ9HCN3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM8AQ9HCN3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM8AQ9HCN3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM8AQ9HCN3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM8AQ9HCN3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM8AQ9HCN3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM8AQ9HCN3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM8AQ9HCN3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM8AQ9HCN3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM8AQ9HCN3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM8AQ9HCN3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM8AQ9HCN3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM8AQ9HCN3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM8AQ9HCN3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM8AQ9HCN3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM8AQ9HCN3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM8AQ9HCN3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM8AQ9HCN3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM8AQ9HCN3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM8AQ9HCN3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM8AQ9HCN3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM8AQ9HCN3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM8AQ9HCN3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM8AQ9HCN3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM8AQ9HCN3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM8AQ9HCN3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms