Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHACTR1Q9C0D0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHACTR1Q9C0D0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms