Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX79

STRA6, Stimulated by retinoic acid gene 6 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRA6Q9BX79 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
STRA6Q9BX79 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms