Protein–RNA interactions for Protein: Q96S86

HAPLN3, Hyaluronan and proteoglycan link protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN3Q96S86 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HAPLN3Q96S86 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
HAPLN3Q96S86 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HAPLN3Q96S86 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HAPLN3Q96S86 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HAPLN3Q96S86 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HAPLN3Q96S86 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HAPLN3Q96S86 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HAPLN3Q96S86 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HAPLN3Q96S86 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HAPLN3Q96S86 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HAPLN3Q96S86 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HAPLN3Q96S86 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HAPLN3Q96S86 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HAPLN3Q96S86 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HAPLN3Q96S86 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HAPLN3Q96S86 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HAPLN3Q96S86 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HAPLN3Q96S86 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HAPLN3Q96S86 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HAPLN3Q96S86 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HAPLN3Q96S86 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HAPLN3Q96S86 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HAPLN3Q96S86 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HAPLN3Q96S86 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HAPLN3Q96S86 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms