Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms